パラバクテロイデス

パラバクテロイデス
パラバクテロイデス・ディスタソニス（ヒト腸内細菌叢内の パラバクテロイデス属の一種）
科学的分類
ドメイン：	細菌
王国：	シュードモナダティ
門:	バクテロイデス類
クラス：	バクテロイジア
注文：	バクテロイデス目
家族：	タンネレラ科
属:	パラバクテロイデス 坂本およびベンノ 2006 [1]
タイプ種
パラバクテロイデス ディスタソニス[1]
種[1]
P. アシディファ シエンス P. bouchesdurhonensis > P. chartae P. chinchillae P. chongii P. distasonis P. faecavium P. faecis P. goldsteinii P. gordonii P. hominis P. intestinavium P. intestinigallinarum P. intestinipullorum P. johnsonii P. masiliensis P. merdae P. pacaensis P.ペキネンセ P. プロベンセンシス P. ティモネンシス

パラバクテロイデスは、グラム陰性、嫌気性、非胞子形成性のタンネレラ科に属する細菌である。 ^{[2] [3] [4] [5]}

1933年に糞便検体から初めて分離されたパラバクテロイデス・ディスタソニス（Parabacteroides distasonis）は、当初バクテロイデス・ディスタソニス（Bacteroides distasonis）という名称で分類されていました。^[6]この株は2006年に再分類され、新属パラバクテロイデス（Parabacteroides）となりました。 ^[7]現在、 パラバクテロイデスは系統学的、生態学的、代謝学的に多様な21種から構成されており、そのうち11種は分類データベース「原核生物の命名法における地位を持つ種リスト（LPSN）」に正式に掲載されています。^[2]

パラバクテロイデス属の中で、P. distasonisとP. goldsteiniiの種は、消化管に沿った腸内細菌叢における重要な役割に関連して、ヒトの健康に有益な効果があるとされています。^{[8] [9] [10]}

分類学

原核生物パラバクテロイデス属に用いられる分類群ID番号は516255である。^{[2]親分類群は細菌科}タンネレラ科に由来し、オンラインLPSNデータベースでは29533番で識別される。^[2]

ゲノミクス

パラバクテロイデス属のゲノムは、種間および単一株内において非常に多様性に富んでいます。例えば、P. distasonis株から単離されたゲノムは、約4.5～5.2 Mb（メガベース）の大きさで、2,000種類以上の機能性タンパク質をコードしており、種内での大きな多様性を示しています。^[11]

種

パラバクテロイデス属は以下の種から構成され、そのうち11種は原核生物命名法リスト（LPSN）に有効に公表されている。^[2]

有効に出版されたものとして記載されている[2]	有効に出版されたものとして記載されていない[2]
P.アシディファシエンス Wang et al. 2019年 P. chartae Tan et al. 2012 P.チンチラ 北原ら。 2013年 P. chongii Kim et al. 2019 P. distasonis (Eggerth および Gagnon 1933) 坂本および Benno 2006 P.フェシス・ サカモトら。 2015年 P. goldsteinii (Song et al. 2006) 坂本とベンノ 2006 P. gordonii 坂本ら。 2009年 P. hominis Liu et al. 2022 P. johnsonii 坂本ら2007年 P. merdae (Johnson et al. 1986)、Sakamoto and Benno 2006	P. bouchesdurhonensis Dione et al. 2018年 P.フェカビウム ギルロイら2021年 P. intestinavium Gilroy et al. 2021年 P. intestinigallinarum Gilroy et al. 2021年 P. intestinipullorum Gilroy et al. 2021年 P. masiliensis Bellali et al. 2019年 P. pacaensis Benabdelkader et al. 2020年 P. pekinense Li et al. 2022 P. provencensis ベナブデルカダー他2020 P. ティモネンシス Bilen et al. 2019年

ヒト腸内微小環境における役割

ヒトの腸内に存在するバクテロイデス目細菌群に属するパラバクテロイデス属は、腸内微小環境に広く分布しています。パラバクテロイデス属は消化管における微生物叢の重要な構成要素であり、ヒトの体との共生関係から恩恵を受けています。腸内微生物叢はヒト宿主にも恩恵をもたらし、腸内微小環境における重要な代謝関連プロセスを調節します。^[12]

特にパラバクテロイデス・ディスタソニスとP.ゴールドスタインは腸内細菌叢にバイオフィルムを形成し、厳しい条件下で生存し、極端なpH環境でも十分な個体数を維持できるようにしています。 ^[8]最近の研究では、プロバイオティクスとしてのパラバクテロイデスの新たな用途が解明され、バランスの取れた微生物叢構成が人間の消化器系の健康に有益であることが示されています。 ^[8] P.ディスタソニスとP.ゴールドスタインはともに、腸内微小環境内で二次胆汁酸とコハク酸を生成することにより、抗肥満効果を発揮します^{。 [8] [10]}パラバクテロイデス属菌種P.ディスタソニスに関する研究では、このメカニズムが体重増加の抑制、高血糖の減少、脂肪肝やその他の代謝性疾患の改善など、代謝に有益であることが明らかになっています。 ^[9]

参考文献

1. Parte, AC「パラバクテロイデス」。LPSN。
2. 「Genus: Parabacteroides」. lpsn.dsmz.de . 2022年11月18日閲覧。
3. "UniProt". www.uniprot.org . 2022年11月18日閲覧。
4. バーギーの系統的細菌学マニュアル. デイビッド・R・ブーン、リチャード・W・カステンホルツ、ジョージ・M・ギャリティ（第2版）. ニューヨーク：シュプリンガー. 2011. ISBN 978-0-387-98771-2. OCLC  45951601。
5. シェヒターの微生物疾患のメカニズム。モセリオ・シェクター、N. ケアリー・エングルバーグ、ビクター・J. ディリタ、テレンス・ダーモディ (第 5 版)。フィラデルフィア: ウォルターズ・クルーワー・ヘルス/リッピンコット・ウィリアムズ&ウィルキンス。 2013.ISBN​ 978-0-7817-8744-4. OCLC  769141612。
6. Eggerth, AH; Gagnon, BH (1933). 「ヒト糞便中のバクテロイデス」. Journal of Bacteriology . 25 (4): 389– 413. doi :10.1128/jb.25.4.389-413.1933. ISSN  0021-9193. PMC 533498. PMID 16559622  . 
7. 坂本光夫; 弁野義美YR 2006 (2006). 「Bacteroides distasonis、Bacteroides goldsteinii、Bacteroides merdae の Parabacteroides distasonis gen. nov., comb. nov.、Parabacteroides goldsteinii comb. nov.、Parabacteroides merdae comb. nov への再分類」. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 56 (7): 1599– 1605. doi : 10.1099/ijs.0.64192-0 . ISSN  1466-5034. PMID  16825636.
8. 王、凱;廖、明芳。周、南。バオ、リー。作る;鄭、中永。ワン・ユージン。劉、張。王文照。ワン・ジュン；劉双江。劉宏偉（2019-01-02）。 「パラバクテロイデス ディスタソニスは、コハク酸酸と二次胆汁酸の生成を介して肥満と代謝機能障害を軽減します」。セルレポート。26 (1): 222–235.e5。土井：10.1016/j.celrep.2018.12.028。ISSN  2211-1247。PMID  30605678。S2CID 58618693  。
9. 曾、強;李東方。彼、ユアン。リー、インフ。ヤン・ジェンユー。趙、小蘭。劉燕紅。王、裕。サン、ジン。フォン、シン。ワン、フェイ。チェン、嘉興。鄭、岳傑。ヤン・ヨンホン。日、雪林（2019-09-17）。 「肥満関連の代謝異常を分類するための矛盾した腸内細菌叢マーカー」。科学的報告書。9 (1): 13424。ビブコード:2019NatSR...913424Z。土井：10.1038/s41598-019-49462-w。ISSN  2045-2322。PMC 6748942。PMID  31530820。S2CID 202580919  。 
10. Wu, Tsung-Ru; Lin, Chuan-Sheng; Chang, Chih-Jung; Lin, Tzu-Lung; Martel, Jan; Ko, Yun-Fei; Ojcius, David M.; Lu, Chia-Chen; Young, John D.; Lai, Hsin-Chih (2019-02-01). 「腸内常在菌Parabacteroides goldsteiniiは、Hirsutella sinensis由来多糖類の抗肥満効果において主要な役割を果たす」 . Gut . 68 (2): 248– 262. doi :10.1136/gutjnl-2017-315458. ISSN  0017-5749. PMID  30007918. S2CID  51628274.
11. Yang, Falong; Kumar, Anand; Davenport, Karen Walston; Kelliher, Julia Mae; Ezeji, Jessica C.; Good, Caryn E.; Jacobs, Michael R.; Conger, Mathew; West, Gail; Fiocchi, Claudio; Cominelli, Fabio; Dichosa, Armand Earl Ko; Rodriguez-Palacios, Alexander (2019-09-05). 「重症クローン病患者の腸壁空洞化微小病変から分離されたParabacteroides distasonis株（CavFT hAR46）の完全ゲノム配列」. Microbiology Resource Announcements . 8 (36): e00585–19. doi :10.1128/MRA.00585-19. ISSN  2576-098X. PMC 6728636 . PMID  31488526 . 
12. ロールズ、エドモンド・T. (2016). 「脳の報酬系と栄養」 . Annual Review of Nutrition . 36 (1): 435– 470. doi :10.1146/annurev-nutr-071715-050725. PMID  27146018.

さらに読む

• クロー、トーガー・ジェンセン。アゲルガード、シャーロット・ニールセン。モラー・ジェンセン、ヤコブ。ユストセン、ウルリク・ステンツ（2015年8月20日）。 「ヒト患者の血液培養から単離された推定新規メタロ-β-ラクタマーゼを含むパラバクテロイデス ゴールドスタインのゲノム配列草案」。ゲノムのお知らせ。3 (4): e00937-15。土井：10.1128/genomeA.00937-15。PMC  4543511。PMID  26294633。
• 坂本 正之; ベンノ 雄一 (2006年7月). 「Bacteroides distasonis、Bacteroides goldsteinii、およびBacteroides merdaeのParabacteroides distasonis gen. nov., comb. nov.、Parabacteroides goldsteinii comb. nov.、およびParabacteroides merdae comb. nov.への再分類」. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 56 (Pt 7): 1599– 605. doi : 10.1099/ijs.0.64192-0 . PMID  16825636.
• ビレン、メルヘム。カドレ、フレデリック。ダウド、ジアド。フルニエ、ピエール＝エドゥアール。ラウール、ディディエ（2016 年 12 月）。 「11月のパラバクテロイデス・ティモネンシス、ヒトの便中で確認」。ヒトマイクロバイオームジャーナル。2 : 1–2 .土井: 10.1016/j.humic.2016.10.002。