パラブルクホルデリア

細菌の属

パラブルクホルデリア
科学的分類 この分類を編集する
ドメイン: 細菌
王国: シュードモナダティ
門: シュードモナドタ
クラス: ベータプロテオバクテリア
注文: バークホルデリア目
家族: バークホルデリア科
属: パラバークホルデリア
・サワナ。 2014年

パラバークホルデリアは、グラム陰性のわずかに湾曲した桿菌鞭毛によって運動するシュードモナドタ属の一種であるパラバークホルデリア属は通常、環境細菌であり、植物に付着したり根粒を形成できるものも含まれ、バークホルデリア属とは異なり、ヒトへの感染は一般的ではない。 [1]パラバークホルデリア属はバークホルデリア科内で単系統群を形成しており、これがバークホルデリア属 とは独立した属として区別されるきっかけとなった。さらに、パラバークホルデリア属に特有で、バークホルデリア属には見られない、堅牢に保存されたシグネチャーインデルの発見も相まって、パラバークホルデリア属はバークホルデリアとは独立した [1]これらの CSI によって、この属は他のすべての細菌と区別される。さらに、バークホルデリア属に共通する CSI はパラバークホルデリアには存在せず、別系統の証拠となっている。 [2]

保存されたシグネチャーインデルは、パラバークホルデリア属にも見つかっている[1]これらのCSIは、属内に2つの単系統群を示す系統ゲノム解析と並行している。1つの群には、名前のないCandidatus属のパラバークホルデリアが生息し、もう1つの群には、農業目的で一般的に使用される環境性のパラバークホルデリアが含まれる。 [3] CSIは、これらの群にのみ固有のものが見つかっており、パラバークホルデリア種の他の組み合わせには特異的なものは見つかっていないため、属レベル内での系統学的解決のレベルがさらに高まっている。 [1] [2 ]これらは、生物学的窒素固定と植物成長促進を行う可能性が強い、ハイブリッドトウヒ( Picea glauca x engelmannii)やロッジポールパインなど、多くの植物の生組織に定着することが報告されている。[4] [5] [6]

パラブルクホルデリアは以下の種から構成される: [1] [7]

参考文献

  1. ^ abcde Sawana A, Adeolu M, Gupta RS (2014). 「Burkholderia属の分子シグネチャーと系統ゲノム解析:病原菌を含むBurkholderia属(修正)と環境性菌を含む新属Paraburkholderia gen. nov.への分割提案」. Frontiers in Genetics . 5 : 429. doi : 10.3389/fgene.2014.00429 . PMC  4271702. PMID  25566316 .
  2. ^ ab Gupta RS (2016年7月). 「微生物の進化と分類の理解におけるゲノミクスの影響:ダーウィンの分類観の重要性」. FEMS Microbiology Reviews . 40 (4): 520–53 . doi : 10.1093/femsre/fuw011 . PMID  27279642.
  3. ^ エストラーダ=デ・ロス・サントス P、ビヌエサ P、マルティネス=アギラール L、ヒルシュ AM、カバレロ=メラド J (2013 年 7 月)。 「多座配列解析によるバークホルデリア種の系統解析」。現在の微生物学67 (1): 51–60 .土井:10.1007/s00284-013-0330-9。PMID  23404651。S2CID 14190412  。
  4. ^ Puri A, Padda KP, Chanway CP (2020-01-01). 「ハイブリッドホワイトスプルースに自然発生する内生窒素固定細菌は、極度の栄養不良土壌における北方林の樹木成長を維持できるか?」土壌生物学・生化学140 107642. doi : 10.1016/j.soilbio.2019.107642. ISSN  0038-0717.
  5. ^ Puri A, Padda KP, Chanway CP (2018-12-15). 「カナダ、ブリティッシュコロンビア州ウェストチルコティン地域における、異なる栄養状態の土壌で生育するロッジポールパインとハイブリッドホワイトスプルースにおける内生ジアゾ栄養細菌の証拠」. Forest Ecology and Management . 430 : 558–565 . doi :10.1016/j.foreco.2018.08.049. ISSN  0378-1127. S2CID  92247486.
  6. ^ Puri A, Padda KP, Chanway CP (2020-08-26). 「植物に有益な細菌を介して栄養制限された土壌条件下におけるマツ科樹木の成長の持続」. PLOS ONE . 15 (8) e0238055. Bibcode :2020PLoSO..1538055P. doi : 10.1371 /journal.pone.0238055 . PMC 7449467. PMID  32845898. 
  7. ^ Oren A, Garrity GM (2017年9月). 「これまで有効ではあったが、有効ではなかった新名称および新組み合わせのリスト」. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 67 (9): 3140– 3143. doi :10.1099/ijs.0.000317. PMC 5817221. PMID 28891789  . 
  8. ^ Paulitsch F, Dall'Agnol RF, Delamuta JR, Ribeiro RA, da Silva Batista JS, Hungria M (2020). 「Paraburkholderia atlantica sp. nov. および Paraburkholderia franconis sp. nov.、ブラジルの大西洋岸森林土壌から分離された2つの新種の窒素固定根粒菌」Arch Microbiol . 202 (6): 1369– 1380. doi :10.1007/s00203-020-01843-w. PMID  32166359. S2CID  212682253.
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  11. ^ Wilhelm RC, Murphy SJ, Feriancek NM, Karasz DC, DeRito CM, Newman JD, Buckley DH (2020年3月). 「酸性森林土壌から分離されたフェノール酸分解細菌、新種Paraburkholderia madseniana」. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 70 (3): 2137– 2146. doi : 10.1099/ijsem.0.004029 . PMID  32027304.
  12. ^ ab Beukes CW、Steenkamp ET、van Zyl E、Avontuur J、Chan WY、Hassen AI、他。 (2019年9月)。 「Paraburkholderia strydomiana sp. nov. およびParaburkholderia steynii sp. nov.: フィンボス マメ科植物Hypocalyptus sophoroidesの根粒共生生物」。アントニー・ファン・レーウェンフック112 (9): 1369 ~ 1385 年。土井:10.1007/s10482-019-01269-5。hdl : 2263/71241PMID  31053961。S2CID 143432118  。
  13. ^ マビマ L、ビュークス CW、パーマー M、デマイヤー SE、ジェームス EK、マルク M、グロス E、ブエノ ドス レイス F、アボントゥール JR、チャン WY、ヴェンター SN、スティーンカンプ ET (2020)。「Paraburkholderia youngii sp. nov.および「Paraburkholderia atlantica」 - 以前はParaburkholderia tuberum sv. mimosaeとして知られていたブラジルおよびメキシコのミモザ関連根粒菌。 」システム アプリケーション 微生物土井:10.1016/j.syapm.2020.126152。hdl : 2263/83117PMID  33276286。S2CID 227295923  。
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