パスツレラ科

パスツレラ科
Haemophilus ducreyi
科学的分類
ドメイン	細菌
界	シュードモナス
門	シュードモナス門
綱	ガンマプロテオバクテリア
目	パスツレラ目 Garrity et al. 2005
科	パスツレラ科 Castellani & Chalmers, 1919
属
アクチノバチルス、アグリゲティ バクター、アビバクテリウム、バスフィア、ビベルステイニア、ビスガアルディア、カビバクテリウム[1] 、ケロノバクター、コンセルバクテリウム[2] 、クリセティバクター、エクセルシタトゥス、フレデリクセニア、ガリバクテリウム、グラエッセレラ、ヘモフィルス、ヒストフィルス、ロネピネラ、マンヘイミア、メルギバクター、メソクリセティバクター、ムリバクター、ネクロプソバクター、ニコレテラ、オタリオジバクター、パスツレラ、フォコエノバクター、ローデンティバクター、スピラビリバクテリウム、セミニバクテリウム、テストディニバクター、ウルシディバクター、ヴェスペルティリバクター、ボルクリバクター

パスツレラ科はグラム陰性細菌の大きな科である。ほとんどの菌は鳥類や哺乳類の粘膜表面、特に上気道に常在菌として生息する。 ^[3]パスツレラ科は典型的には桿菌であり、通性嫌気性菌の中でも注目すべきグループである。その生化学的特徴は、近縁の腸内細菌科とは酸化酵素の存在によって、また他の多くの類似細菌とは鞭毛の欠如によって区別できる。

パスツレラ科の細菌は、代謝特性に基づいていくつかの属に分類されていますが、これらの分類は一般的に異なる種間の進化的関係を正確に反映しているわけではありません。インフルエンザ菌はゲノム配列が解読された最初の生物であり、遺伝学的および分子生物学的手法によって集中的に研究されてきました。インフルエンザ菌属は、菌血症、肺炎、髄膜炎、軟性下疳に関連する悪名高いヒト病原体です。パスツレラ科の他の病原性細菌には、アグリゲティバクター、マンヘイミア、パスツレラ、アクチノバチルス属などがあります。

分子シグネチャーと系統学的位置

パスツレラ科ゲノムの比較解析により、様々な重要なタンパク質において、配列決定されたすべてのパスツレラ科種／株に共通するが、他の細菌には見られない、多数（20以上）の保存されたシグネチャーインデル（CSI）が同定されました。パスツレラ科種のサブグループに特異的な他の多くのCSIに基づいて、パスツレラ科を少なくとも2つのクレードに分割することが提案されています。^[4]提案されているクレードの1つには、アグリゲティバクター、パスツレラ、アクチノバチルス・サクシノゲネス、ヘモフィルス・インフルエンザ、ヒストフィルス・ソムニ、マンヘイミア・サクシニシプロデューセンスが含まれ、もう1つには、アクチノバチルス・マイナー、アクチノバチルス・プレウロニューモニアエ、ヘモフィルス・デュクレイ、グラエッセレラ・パラスイス、マンヘイミア・ヘモリチカが 含まれます

CSIという分子シグネチャーは、パスツレラ科に属する3つの主要属、すなわちアクチノバチルス属、ヘモフィルス属、パスツレラ属の多系統分布を解明するためにも用いられてきた。^{[5] [6] [7]}これらの属は科全体にわたって広範な多系統性を示しているが、それぞれの属内で単系統群を形成する特定の種の間では、CSIが一貫して共有されていることが分かっている。[ ^5] CSIの分布は、それぞれ「真の」アクチノバチルス属、ヘモフィルス属、パスツレラ属の種の厳密な意味での系統群に対応している。これらは共通祖先を示すため、CSI分布を用いて属の同一性を決定できると仮定されており、CSIを共有しない種は別の属として再分類される可能性がある。臨床的に関連する2つの属、アグリゲティバクター属とマンヘイミア属に特異的なCSIも見つかっている。^[5]

パスツレラ目は、腸内細菌目とともに、ガンマプロテオバクテリアの中で最も最近分岐した目です。^[8]他のすべての目との区別は、これら2つの目に共通し、他のすべての細菌には存在しないいくつかの保存されたシグネチャータンパク質（CSP）の存在によって裏付けられています。^{[8]パスツレラ目は、腸内細菌目、}ビブリオナ目、エロモナダ目、アルテロモナダ目とも追加のCSPを共有しており、ガンマプロテオバクテリアという大きな綱の中での進化の分岐と系統学的位置をさらに解明しています。^[8]

語源

この細菌分類群はルイ・パスツールにちなんで命名され、1981年に正式に承認されました。この名称は、現在33属110種からなるグラム陰性菌の集合を収容するために考案されました。これらの菌は「主に哺乳類と鳥類である脊椎動物の、主に病原体であり、潜在的な病原体である特殊な片利共生菌」と説明されています。^[9]

参考文献

1. Parker, Charles Thomas; Garrity, George M. (2018). Parker, Charles Thomas; Garrity, George M (eds.). "Taxonomy of the genus Caviibacterium Adhikary et al. 2018". doi :10.1601/tx.31260. {{cite journal}}：ジャーナルの引用には|journal=（ヘルプ）が必要です
2. パーカー、チャールズ・トーマス; ギャリティ、ジョージ・M. (2018). パーカー、チャールズ・トーマス; ギャリティ、ジョージ・M. (編). 「Conservatibacter属の分類学、Adhikaryら、2018年」. doi :10.1601/tx.31262. {{cite journal}}：ジャーナルの引用には|journal=（ヘルプ）が必要です
3. Kokotovic, Branko; Friis, Niels F; Ahrens, Peter (2007). 「デンマークの牛の気管支肺胞洗浄液中にMycoplasma alkalescensが検出される」. Acta Veterinaria Scandinavica . 49 (1): 2. doi : 10.1186/1751-0147-49-2 . ISSN  1751-0147. PMC 1766361. PMID 17204146  . 
4. Naushad, HS; Gupta, RS (2012年1月). 「パスツレラ目に特異的で、その主要な2つの系統群を区別するタンパク質配列における分子シグネチャー（保存されたインデル）. Antonie van Leeuwenhoek . 101 (1): 105–24 . doi :10.1007/s10482-011-9628-4. PMID  21830122. S2CID  15114511
5. Naushad S, Adeolu M, Goel N, Khadka B, Al-Dahwi A, Gupta RS (2015). 「多系統パスツレラ科アクチノバチルス属、ヘモフィルス属、およびパスツレラ属の中核メンバーの系統ゲノム的および分子的区分」.  Int J Genom . 2015 198560. doi : 10.1155/2015/198560 . PMC 4363679. PMID 25821780 
6. Olsen I, Dewhirst FE, Paster BJ, Busse HJ (2005) パスツレラ科I. バーギーの系統的細菌学マニュアル、第2版、第2巻、851～856ページ。Brenner DJ、Krieg NR、Garrity GM、Staley JT編、Springer-: New York
7.  の代表的な54種の系統発生」J Bacteriol . 174 (6): 2002–2013 . doi :10.1128/jb.174.6.2002-2013.1992. PMC 205807. PMID 1548238 
8. Gao B, Mohan R, Gupta RS (2009). 「ガンマプロテオバクテリアの進化的関係を解明する系統ゲノム学とタンパク質シグネチャー」. Int J Syst Evol Microbiol . 59 (Pt 2): 234–247 . doi : 10.1099/ijs.0.002741-0 . PMID  19196760
9. Partin, Clyde (2024年10月). 「Etymologia - Pasteurellaceae [pas′-tər-ə-lā′-sē-ī]」. Emerg Infect Dis . 30 (10): 2204. doi :10.3201/eid3010.240735. PMC 11431925. 2024年10月2日閲覧。CDCのパブリックドメインテキストを引用しています。