ペラギバクテリア科

ペラギバクテリア科
科学的分類
ドメイン：	細菌
王国：	シュードモナダティ
門:	シュードモナドタ
クラス：	アルファプロテオバクテリア
サブクラス:	「リケッツ科」
注文：	「カンジダトゥス・ペラギバクテラル」
家族：	ペラギバクテリア科 スラッシュら2011 [1]
属[2]
カンジダトゥス ・アロフォンティバクター・ コリッグ。ツェメンツィら。 2019年 Candidatus Fonsibacter Henson et al . 2018年 Candidatus Pelagibacter Rappe et al . 2002年

ペラギバクテリア科は、自由生活性の海洋細菌からなるアルファプロテオバクテリア科に属する。^[3]

アルファプロテオバクテリアはプロテオバクテリアの一種で、ロドバクテリア目、ロドスピリラ目、カウロバクテリア目など、複数の目に分類されます。アルファプロテオバクテリア目には多数の目があり、100以上の科が存在します。その中で最も豊富なのはペラギバクテリア科です。FEMS Microbiology Ecologyによると、「アルファプロテオバクテリア科ペラギバクテリア科、またはSAR11クレードは、世界の海洋で最も豊富な細菌クレードの一つです」（Ortmann & Santos, 2016）。OpenStax Biology 2eでは、クレードを「単一の祖先から派生した生物のグループ」と定義しています（Clark, Douglas, & Choi 2018）。

プロテオバクテリア綱は1980年頃に特定され、その後ペラギバクテリア科が発見されました。FEMS Microbiology Ecology誌は、「SAR11はサルガッソ海で初めて観察され、その後の調査結果から、この系統は海洋環境と淡水環境の両方に広く分布していることが示されています」（Ortmann & Santos, 2016）と述べています。この細菌が多様な生息地に広く分布していることは、その回復力の高さを物語っています。その豊富さにもかかわらず、その繁栄を可能にする要因はまだ調査中です。海洋生物は、生存のためにリン酸塩や硝酸塩などの特定の栄養素レベルに依存することがよくあります。「ペラギバクテリア科が繁栄している理由の一つは、外洋のような栄養素が限られた条件下でも繁栄できる能力にある可能性があり、これはおそらく適応的なゲノム合理化によるものと考えられます」（Ortmann & Santos, 2016）。

参考文献

1. スラッシュ JC、ボイド A、ハゲット MJ、グローテ J、カリーニ P、ヨーダー RJ、ロベルトセ B、スパタフォーラ JW、ラッペ MS、ジョバンノーニ SJ (2011)。 「ミトコンドリアとSAR11クレードの共通祖先に関する系統ゲノム学的証拠」。科学担当者。1 : 13。ビブコード:2011NatSR...1E..13T。土井：10.1038/srep00013。PMC  3216501。PMID  22355532。
2. Euzéby JP, Parte AC. 「Pelagibacteraceae」.原核生物名一覧（LPSN） . 2021年6月2日閲覧。
3. Grote J, Thrash JC, Huggett MJ, Landry ZC, Carini P, Giovannoni SJ, Rappe MS (2012). 「SAR11クレードの高度に異なるメンバー間の合理化とコアゲノム保全」mBio . 3 (5): 1– 13. doi :10.1128/mBio.00252-12. PMC 3448164 . PMID  22991429. 

Clark, M., Douglas, M., & Choi, J. (2018). Biology 2e. Houston, Texas: OpenStax. https://openstax.org/books/biology-2e/pages/1-introduction より取得。Ortmann, AC, & Santos, TT (2016年7月6日). 河口勾配におけるPelagibacteraceaeの空間的および時間的パターン。FEMS Microbiology Ecology, 92 , 9. doi:https://doi.org/10.1093/femsec/fiw133