海底岩石データベース

海洋底岩石データベース（PetDB）[ 1 ]は、背弧盆地、若い海山、古い海洋地殻を含む中央海嶺で生成された火成岩と変成岩、マントルと下部地殻のオフィオライトと陸生捕獲岩、ダイヤモンドの地球化学に関する全球地球化学データのリレーショナルデータベースです。これらのデータは、質量分析、原子発光分析、蛍光X線分析、湿式化学分析などのさまざまな技術を使用して、全岩粉末、火山ガラス、鉱物を分析することで得られます。データは、PetDBデータ管理者が科学文献から編集し、系統的なメタデータレビュー後に入力されています。科学コミュニティのメンバーは、 EarthChemライブラリに入力された特定のデータの入力を提案することもできます。PetDBは、K. Lehnertが率いるラモント・ドハティ地球観測所の統合地球データアプリケーション（IEDA）施設のEarthChemグループによって管理されています。 PetDB は米国国立科学財団によってサポートされています。

について

PetDB [ 2 ]の開発は、ラモント・ドハティ地球観測所（LDEO）[ 3 ]の科学者C.ラングミュア（現在はハーバード大学）、W.ライアン、A.ブーランジェが、ワールドワイドウェブとリレーショナルデータベースが研究や授業での科学データの利用にどのような影響を与えるかを認識した1995年に始まりました。

PetDBの初期資金調達フェーズ（1996～2001年）では、データベース構造の開発とデータ値の登録が支援されました。その後の資金調達フェーズ（2002～2007年）では、コロンビア大学国際地球科学情報ネットワークセンター（CIESIN）[ 4 ]が管理するORACLEベースの環境へのデータベース移行[ 5 ]、継続的なデータ入力、そしてよりユーザーフレンドリーな設計によるWebインターフェースの強化が可能となりました。

PetDB は現在 EarthChem によって管理され、米国国立科学財団によって資金提供されており、地球サンプル登録システム (SESAR) や宇宙物質データ システム (AstroMat) などの関連プロジェクトのエコシステムの一部として Interdisciplinary Earth Data Alliance 施設によって管理されています。

PetDB は創設以来、幅広い科学的取り組みをサポートし、中央海嶺玄武岩、深海ペリドタイト、さらには地球のマントルと下部地殻からの捕獲岩サンプルに関する地球化学データの包括的なグローバル データセットへの容易なアクセスを提供しています。

PetDBのリレーショナルデータベース構造はサンプルベースの実装であり、あらゆる種類の岩石サンプルの化学、同位体、鉱物学的データに加えて、各サンプルに関する情報（収集場所と時間、分類、岩石学的説明など）と分析手順、参照標準測定などのデータ品質を提供する必須メタデータを収容するように設計されています（Lehnert et al. 2000 [ 6 ]）。

このリレーショナルデータモデルは当初PetDBとそのヨーロッパのカウンターパートであるGEOROC [ 7 ]向けに開発されたが、その後の地球化学データベースプロジェクトへの応用によってその有用性と柔軟性が実証された。その中には、PetDBも推進してきたいくつかの共同研究を含む、東アフリカリフトのテフラサンプルに焦点を当てたEARThDプロジェクト、南極の岩石サンプルのメタデータを含むオハイオ州立大学の米国極地岩石保管庫、そして北米の花崗岩質プルトンサンプルのデータも含まれるようになったカンザス大学との共同研究などがある。このプロジェクトはNAVDATプロジェクトから発展したものである。

PetDBは1500以上の査読付き科学論文で引用されています。[ 8 ]

PetDB は、FAIR (検索可能、アクセス可能、相互運用可能、再利用可能)、TRUST (透明性、責任、ユーザー重視、持続可能性、テクノロジー)、および先住民データ ガバナンスに関する CARE 原則 (共同利益、管理権限、責任、倫理) に準拠したデータに取り組んでおり、すべての科学分野にわたって公開されているデジタル リソースの重要性を示すことを目指しています。

コンテンツ

現在のアプリケーションであるPetDBは、化学パラメータ（現在250種類以上の元素、酸化物、同位体、同位体比）の完全なセットと、洗練されたクエリインターフェースを介した岩石学（モード）データを備え、オンラインでアクセスを提供しています。新しいデータは、著者によってPetDBに提出され、公開されるにつれて、継続的にデータベースに追加されます。異なる研究室で生成されたデータや、複数の著者によって公開されたデータは、データベースアプリケーションによって生成される一意のサンプル識別子を使用してリンクされ、統合されます。

統計

2024年11月15日現在、PetDBの保有資産は以下のとおりです。

  • 参照: 3,680
  • サンプル数: 141,527
  • 岩石データポイント数: 1,796,265
  • 鉱物: 3,549,654
  • 火山ガラス: 937,401
  • 収録数: 354,156
  • 合計個別値: 6,639,789

データ出力

PetDB のデータは、HTML テーブルで表示したり、XLS 形式のスプレッドシートにダウンロードしたりできます。化学パラメータの選択時に、ユーザーはデータを個別の値として取得するか (データ テーブルの各行には、同じサンプルで同じ方法で測定され、同じ参照にリンクされた値が含まれます)、プリコンパイルされた形式で取得するかを選択できます。プリコンパイルされた形式では、データが複数の出版物から取得されている場合でも、サンプルに関連付けられたすべてのデータが 1 行にまとめられます。特定の化学項目に複数のデータ値がある場合、プリコンパイル アルゴリズムによって最新の分析と最も正確な使用可能な方法が選択されます。HTML テーブル内のリンクを使用すると、サンプル、参照、またはデータ値 (分析手順) に関する詳細情報にアクセスできます。最終的なスプレッドシート出力には 2 つのワークシートが含まれます。1 つ目は、照会された化学データ、地理空間座標、要約された方法と参照が含まれ、2 つ目は分析方法と出版物情報に関するメタデータが含まれます。

参考文献

  1. ^ “PetDB” . 2008年8月20日時点のオリジナルよりアーカイブ。2020年5月5日閲覧。
  2. ^ “PetDB - Home” . www.petdb.org . 2008年8月20日時点のオリジナルよりアーカイブ。2022年6月30日閲覧。
  3. ^ 「ホーム」 . ldeo.columbia.edu .
  4. ^ 「ホーム」 . ciesin.columbia.edu .
  5. ^ 「ホーム」 . columbia.edu .
  6. ^ Lehnert, K.; Su, Y.; Langmuir, CH; Sarbas, B.; Nohl, U. (2000). 「岩石のためのグローバル地球化学データベース構造」 .地球化学、地球物理学、地球システム. 1 (5): 1012. Bibcode : 2000GGG.....1.1012L . doi : 10.1029/1999GC000026 . S2CID 134706218 . 
  7. ^ 「地球化学岩石データベースクエリ」。
  8. ^ 「EarthChem- EarthChemシステムの引用」。

さらに読む

  • Alemayehu M, Zhang H-, Sakyi PA. エチオピア南部リフトゾーン下におけるリソスフェアマントルの性質と進化：マントル捕獲岩の岩石学および地球化学による証拠. 国際地球科学ジャーナル. 2016. doi : 10.1007/s00531-016-1342-z
  • Braun, MGおよびPB Kelemen (2002). 「オマーンオフィオライトにおけるダナイトの分布：多孔質ダナイト導管を通る溶融フラックスへの影響」G-CUBED 3(11): 8603. doi : 10.1029/2001GC000289
  • Chavrit, D., Humler, E., Grasset, O.(2014)「中央海嶺系全体にわたる現代のCO2フラックスとマントル炭素含有量のマッピング」EPSL 387:229-39. doi : 10.1016/j.epsl.2013.11.036
  • Cipriani, A., HK Brueckner, et al. (2004). 「捉えどころのない親岩によって形成された海洋地殻：大西洋中央海嶺の玄武岩-ペリドタイトペア中のSrおよびNd同位体」GEOLOGY 32: 657-660. doi : 10.1130/G20560.1
  • Horsburgh JS, Aufdenkampe AK, Mayorga E, Lehnert KA, Hsu L, Song L, et al. Observations Data Model 2: A community information model for spatially discrete Earth observations. Environmental Modelling & Software. 2016;79:55-74. doi : 10.1016/j.envsoft.2016.01.010
  • Lehnert, KA, Su, Y., Langmuir, CH, Sarbas, B., Nohl, U., 「岩石のためのグローバル地球化学データベース構造」、G-CUBED、第1巻、2000年。doi ： 10.1029 /1999GC000026
  • McNutt M, Lehnert K, Hanson B, Nosek BA, Ellison AM, King JL. フィールド科学サンプルとデータの解放. Science. 2016;351(6277):1024-6. doi : 10.1126/science.aad7048
  • Salters, VJMとA. Stracke (2004). 「枯渇したマントルの組成」G-CUBED 5(5). doi : 10.1029/2003GC000597
  • Spiegelman, M. および PB Kelemen (2003). 「チャネル化された溶融体輸送の結果としての極端な化学的変動」G-CUBED 4. doi : 10.1029/2002GC000336
  • Thirlwall, MF, MAM Gee, et al. (2004). 「ダブルスパイクPb同位体比を用いたアイスランドおよび隣接海嶺のマントル構成物質の調査」GEOCHIM COSMOCHIM ACTA 68: 361-386. doi : 10.1016/S0016-7037(03)00424-1
  • van de Flierdt, T., M. Frank, et al. (2004). 「海底熱水流入の履歴と熱水ハフニウムの海水収支における重要性の追跡 ― Pb-Hf-Nd同位体を用いた複合アプローチ」EARTH PLANET SCI LETT 222: 259-273. doi : 10.1016/j.epsl.2004.02.025
  • Weyer, S., C. Muenker, et al. (2003). 「枯渇したマントルにおけるNb/Ta、Zr/Hf、REE：地殻マントル系の分化史への示唆」EARTH PLANET SCI LETT 205: 309-324. doi : 10.1016/S0012-821X(02)01059-2
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