プラジエノリドB
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| 名前 | |
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| IUPAC名 [(2S,3S,4E,6S,7R,10R)-7,10-ジヒドロキシ-2-[(2E,4E,6S)-7-[(2R,3R)-3-[(2R,3S)-3-ヒドロキシペンタン-2-イル]オキシラン-2-イル]-6-メチルヘプタ-2,4-ジエン-2-イル]-3,7-ジメチル-12-オキソ-1-オキサシクロドデカ-4-エン-6-イル]アセテート | |
| 識別子 | |
3Dモデル（JSmol） | |
| ケムスパイダー | |
PubChem CID | |
CompToxダッシュボード（EPA） | |
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| プロパティ | |
| C 30 H 48 O 8 | |
| モル質量 | 536.706 g·mol −1 |
特に記載がない限り、データは標準状態（25 °C [77 °F]、100 kPa）における材料のものです。 | |
プラジエノリドBは、日本の土壌から分離されたグラム陽性細菌であるストレプトマイセス・プラテンシスMER-11107 [ 1 ] [ 2 ]によって産生されるポリケチド天然物です。 [ 3 ]プラジエノリドBは、抗がん作用の可能性が注目されている分子です。この分子の作用機序は、ヒトスプライソソーム内のSF3B複合体に結合し、これを阻害することであると提唱されています。[ 1 ]
生合成
ポリケチドであるプラジエノリドBは、脂肪酸合成酵素（FAS）経路から派生した生合成経路であるポリケチド合成酵素（PKS）I型経路で合成される。ポリケチドは、アシルチオエステル単位の縮合によって形成される。プラジエノリドBの合成は、アシルトランスフェラーゼがプロピオニルCoAをホロ（活性化）アシルキャリアタンパク質（ACP）にロードすることから始まる。その後、反復PKSによって分子は10回伸長し、そのたびに2つの炭素単位が付加される（図1）。[ 2 ]図1は、ロードユニット（マロニルCoAまたはメチルマロニルCoA）と各モジュールを調整する酵素（図1のc部分の青緑色の酵素クラスター）を示している。 10個の伸長モジュールの後、チオエステラーゼ（TE）の活性部位セリン残基は求核剤として働き、CoA-SHに直接結合したケトンを攻撃する。この求核攻撃によりCoA-SHが脱離し、伸長した鎖がTEに転移する。次に、炭素11位の水酸基が求核剤として働き、末端ケトンを攻撃する。その結果、炭素1位から11位は環状の12員環を形成し、その過程でTEが遊離する。これで生合成におけるPKS部分が終了し、プラジエノリドB骨格構造が形成される。[ 2 ] [ 4 ]
PKS後の修飾： アセチルトランスフェラーゼ（AT）は、アセチル基を炭素7に転移します。次のステップは、P450 I酵素（PldB C6-ヒドロキシラーゼ）が炭素6にヒドロキシル基を付加するか、またはP450 II（PldD C18-C19-エポキシダーゼ）によって炭素18と19の間にエポキシド基を付加するか、またはその両方です。 BootheらによるこれらのPKS後の化合物の精製結果に基づくと、[ 2 ]ヒドロキシル化またはアセチル化のどちらが先に起こる可能性があると思われますが、Bootheら[ 2 ]は、ヒドロキシル化が先に 起こる頻度はアセチル化が先に起こる頻度の2倍以上であることを発見しました。[ 2 ]しかし、ヒドロキシル化またはアセチル化のどちらが先に起こるかに関係なく、これらの調整ステップの結果としてプラジエノリドBが生成されます（図1） 。
炭素は伝統的なIUPAC命名システムを使用して番号付けされ、C1は環内のケトン炭素、C23は鎖の末端炭素です。[ 5 ]
参考文献
- ^ a b Trieger, Kelsey A.; La Clair, James J.; Burkart, Michael D. (2020). 「スプライスモジュレーションは細胞周期阻害を相乗的に促進する」 . ACS Chemical Biology . 15 (3): 669– 674. doi : 10.1021/acschembio.9b00833 . PMC 7570451. PMID 32004428 .
- ^ a b c d e f g Booth, Thomas J.; Kalaitzis, John A.; Vuong, Daniel; Crombie, Andrew; Lacey, Ernest; Piggott, Andrew M.; Wilkinson, Barrie (2020-08-12). 「経路特異的活性化因子のネイティブ発現による新規プラジエノリド類似体の産生」 . Chemical Science . 11 (31): 8249– 8255. doi : 10.1039 / D0SC01928C . ISSN 2041-6539 . PMC 8163091. PMID 34094178 .
- ^酒井 隆; 鮫島 智弘; 松藤 素子; 河村 直人; 土橋 和之; 水井 善治 (2004-03-25). 「プラジエノリド、ストレプトマイセス・プラテンシス Mer-11107 の培養物から得られる新物質 I. 分類、発酵、分離およびスクリーニング」 . The Journal of Antibiotics . 57 (3): 173– 179. doi : 10.7164/antibiotics.57.1 73. ISSN 0021-8820 .
- ^ a b町田 和弘; 有澤 明; 武田 進; 土田 敏夫; 有徳 康秀; 吉田 正志; 池田 治夫 (2008年11月23日). 「Streptomyces platensis Mer-11107におけるポリケチド抗腫瘍性マクロライド、プラジエノリドの生合成遺伝子クラスターの構成」 .生物科学, バイオテクノロジー, 生化学. 72 (11): 2946– 2952. doi : 10.1271/bbb.80425 . PMID 18997414. S2CID 20711372 .
- ^ 「IUPACルール」 www.chem.uiuc.edu 2023年6月8日閲覧。
