| プラスメプシンI | |||||||||
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| 識別子 | |||||||||
| EC番号 | 3.4.23.38 | ||||||||
| CAS番号 | 180189-87-1 | ||||||||
| データベース | |||||||||
| インテンズ | IntEnzビュー | ||||||||
| ブレンダ | ブレンダエントリー | ||||||||
| エクスパス | NiceZymeビュー | ||||||||
| ケッグ | KEGGエントリー | ||||||||
| メタサイクル | 代謝経路 | ||||||||
| プリアモス | プロフィール | ||||||||
| PDB構造 | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
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| プラスメプシンII | |||||||||
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| 識別子 | |||||||||
| EC番号 | 3.4.23.39 | ||||||||
| CAS番号 | 159447-18-4 | ||||||||
| データベース | |||||||||
| インテンズ | IntEnzビュー | ||||||||
| ブレンダ | ブレンダエントリー | ||||||||
| エクスパス | NiceZymeビュー | ||||||||
| ケッグ | KEGGエントリー | ||||||||
| メタサイクル | 代謝経路 | ||||||||
| プリアモス | プロフィール | ||||||||
| PDB構造 | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
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プラスメプシンは、熱帯熱マラリア原虫(Plasmodium falciparum)によって産生される少なくとも10種類の酵素(EC 3.4.23.38およびEC 3.4.23.39)からなるクラスです。マラリア原虫には、これらのタンパク質の10種類のアイソフォームと、それぞれをコードする10種類の遺伝子(Plm I、II、III、IV、V、VI、VII、IX、X、HAP)が存在します。ヒトの他のマラリア原虫種では、プラスメプシンファミリーが小さいことが示唆されています。Plm I、II、IV、V、IX、X、HAPは赤血球サイクルで発現し、Plm VI、VII、VIIIは赤血球外サイクルで発現します。ヘモグロビン分解活性を介して、これらはマラリア患者の症状の重要な原因となります。そのため、この酵素ファミリーは抗マラリア薬の潜在的な標的となっています。
プラスメプシンはアスパラギン酸 プロテアーゼであり、活性部位には2つのアスパラギン 酸残基が含まれています。これらの2つのアスパラギン 酸残基はそれぞれプロトン供与体とプロトン受容体として作用し、タンパク質中のペプチド結合の加水分解を触媒します。
プラスメプシンには4つの種類があり、互いに密接に関連していますが、切断部位の特異性は異なります。プラスメプシンIとIIは、α-グロビンサブユニットの フェニルアラニン33番残基とロイシン34番残基の間のヘモグロビンを切断します。
プラスメプシンという名前は、Plasmodium (生物) とペプシン(類似した分子構造を持つ一般的なアスパラギン酸プロテアーゼ)に由来していると考えられます。
人間において最も近い(非病原性の)酵素的同等物は、ベータセクレターゼ酵素です。
参考文献
- ^ Silva AM, Lee AY, Gulnik SV, Maier P, Collins J, Bhat TN, Collins PJ, Cachau RE, Luker KE, Gluzman IY, Francis SE, Oksman A, Goldberg DE, Erickson JW (1996年9月). 「Plasmodium falciparum由来ヘモグロビン分解酵素、プラスメプシンIIの構造と阻害」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (19): 10034–9 . Bibcode :1996PNAS...9310034S. doi : 10.1073/pnas.93.19.10034 . PMC 38331. PMID 8816746 .
さらに読む
- Dame JB, Reddy GR, Yowell CA, Dunn BM, Kay J, Berry C (1994). 「ヒトマラリア原虫Plasmodium falciparum由来のアスパラギン酸プロテアーゼの配列、発現、およびモデル構造」Mol. Biochem. Parasitol . 64 (2): 177–9 0. doi :10.1016/0166-6851(94)90024-8. PMID 7935597.
- Bernstein NK, Cherney MM, Loetscher H, Ridley RG, James MN (1999). 「熱帯熱マラリア原虫由来の新規アスパラギン酸プロテアーゼ酵素前駆体プロプラスメプシンIIの結晶構造」Nat. Struct. Biol . 6 (1): 32– 7. doi :10.1038/4905. PMID 9886289. S2CID 2326003.
- Karubiu W, Bhakat S, Soliman ME (2015). 「プラスメプシンプロテアーゼのフラップダイナミクス:提案されたパラメータと分子動力学の知見」Mol. Biosyst . 11 (4): 1061– 1066. doi :10.1039/C4MB00631C. PMID 25630418.