ポリメラーゼの吃音

ポリメラーゼスタッターとは、ポリメラーゼが mRNA鎖上でそれ以上進まずにヌクレオチドを複数回転写するプロセスです。ウイルスなどの比較的複雑でない生物では、ポリAテールの付加やmRNA鎖のキャッピングによく用いられます。

プロセス

ポリメラーゼは確率制御された事象としてスタッターを起こす可能性があり、したがって翻訳過程におけるいかなるメカニズムによっても明示的に制御されることはありません。一般的に、スタッターはmRNA鎖上の滑りやすいヌクレオチド配列における多数の短いフレームシフトの繰り返しの結果として生じます。 ^[1] しかし、フレームシフトは1ヌクレオチド（場合によっては2ヌクレオチド^[2]）に限定され、配列の両側に擬似ノットまたはチョークポイントが存在します。

例

このような挙動を示すポリメラーゼの一つにRNA依存性RNAポリメラーゼがあり、多くの RNAウイルスに存在します。逆転写酵素もこのポリメラーゼスタッターを起こすことが観察されています。^[3]

文学

^ Anderson, EC; Hunt, SL; Jackson, RJ (2007年11月). 「ヒトライノウイルス2型の内部リボソーム進入部位からの内部翻訳開始には、5'非翻訳領域上の2つの異なる部位へのUnrの結合が必要である」. J Gen Virol . 88 (11): 3043–52 . doi : 10.1099/vir.0.82463-0 . PMID 17947529.
^ Mauro, VP; Chappell, SA; Dresios, J (2007). 「真核生物mRNAにおける翻訳開始時のリボソームシャント解析」.翻訳開始：抽出システムと分子遺伝学. Methods Enzymol. Vol. 429. pp. 323– 54. doi :10.1016/s0076-6879(07)29015-9. ISBN 978-0-12-374191-2. PMID 17913630。
^ Kurzynska-Kokorniak, A; Jamburuthugoda, VK; Bibillo, A; Eickbush, TH (2007年11月). 「DNA誘導性DNAポリメラーゼとR2レトロトランスポゾンによってコードされる逆転写酵素の鎖置換活性」J Mol Biol . 374 (2): 322– 33. doi :10.1016/j.jmb.2007.09.047. PMC 2121658 . PMID 17936300.

[1] Anderson, EC; Hunt, SL; Jackson, RJ (2007年11月). 「ヒトライノウイルス2型の内部リボソーム進入部位からの内部翻訳開始には、5'非翻訳領域上の2つの異なる部位へのUnrの結合が必要である」. J Gen Virol . 88 (11): 3043–52 . doi : 10.1099/vir.0.82463-0 . PMID 17947529.

[2] Mauro, VP; Chappell, SA; Dresios, J (2007). 「真核生物mRNAにおける翻訳開始時のリボソームシャント解析」.翻訳開始：抽出システムと分子遺伝学. Methods Enzymol. Vol. 429. pp. 323– 54. doi :10.1016/s0076-6879(07)29015-9. ISBN 978-0-12-374191-2. PMID 17913630。

[3] Kurzynska-Kokorniak, A; Jamburuthugoda, VK; Bibillo, A; Eickbush, TH (2007年11月). 「DNA誘導性DNAポリメラーゼとR2レトロトランスポゾンによってコードされる逆転写酵素の鎖置換活性」J Mol Biol . 374 (2): 322– 33. doi :10.1016/j.jmb.2007.09.047. PMC 2121658 . PMID 17936300.