プロサー1

プロサー1
識別子
エイリアス	2810046L04Rik9330161F11プロリンとセリンに富む1
外部ID	HomoloGene : 13463; GeneCards : [1]; OMA :- オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
キリスト	3番染色体（ヒト）
終わり	53,389,176 bp
RNA発現パターン
	上位の表現
	耳小胞; ; 性器結節; ; 胚の尾; ; 吻側回遊流; ; 胚葉上層; ; 原始的な条線; ; 心室帯; ; 神経節隆起; ; 三叉神経節; ; 卵黄嚢;
	該当なし
	より多くの参照表現データ
	該当なし
遺伝子オントロジー
分子機能	分子機能;
細胞成分	細胞成分;
生物学的プロセス	生物学的プロセス;
	出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
	212127
	該当なし
	ENSMUSG00000049504
	該当なし
	Q5PRE5
	該当なし
	NM_173382
	該当なし
	NP_775558
	該当なし
	ウィキデータ
人間の表示/編集

PROSER1はヒトではPROSER1遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[2]

命名法

PROSER1にはC13orf23、KIAA2032、プロリン・セリンリッチタンパク質1など、いくつかの別名がある。^[3] ^[4]

遺伝子

位置

PROSER1は、 13番染色体のマイナス（逆）鎖上の13q13.3に位置します。その範囲は、プターから39,009,865塩基対からプターから39,038,095塩基対までで、そのサイズは28,231塩基です。^[5] PROSER1は、5,185塩基対のスプライシングされていない一次転写産物mRNA中に合計13のエクソンを有します。PROSER1には2つのアイソフォームがあり、どちらも5,000塩基の範囲内にあります。^[6]

ジーン地区

STOML3遺伝子とNHLRC3遺伝子は13番染色体上のPROSER1遺伝子に隣接している。^[7]

組織分布

PROSER1の発現に関する発現配列タグマッピングは、リンパ、胎児組織、胸腺、子宮部位で特に高い発現を示すことを示している。精巣、喉頭、神経、血液、脂肪組織部位では中程度の発現を示す。^[8] ヒトタンパク質アトラスによると、PROSER1は一般的な細胞質発現を示し、すべてのRNA組織カテゴリーで発現する。^[9]

相同性

パラログ

PROSER1には相同遺伝子は存在しない。^[10]

オーソログ

PROSER1は哺乳類間で高度に保存されています。魚類、鳥類、一部の無脊椎動物では、それほど高度に保存されていませんが、その存在が見つかっています。細菌、植物、真菌では発現していません。^[11]以下はNCBIからまとめた相同遺伝子の表です。

ラテン語名	通称	分岐の日付（ホモ・サピエンスから）	受入番号	タンパク質配列の長さ	配列同一性	配列類似性
ホモ・サピエンス	人間	-	NP_079414.3	944個のアミノ酸	-	-
ゴリラゴリラ	ゴリラ	890万年前	XP_004054459	994 単数形	99%	99%
コロブス・アンゴレンシス・パリアトゥス	アンゴラコロブス	2910万年前	XP_011798372	947 aa	97%	97%
ナンノスパラックス・ガリリ	スパラックス	9090万年前	XP_008847583	916 aa	80%	85%
クリセトゥルス・グリセウス	チャイニーズハムスター	9090万年前	XP_007626898	912 aa	79%	84%
パンテーラ・チグリス・アルタイカ	シベリアトラ	9750万年前	XP_007097793	665 aa	85%	89%
アシノニクス・ジュバトゥス	チーター	9750万年前	XP_014926409	770 アミノ酸	79%	83%
ツルシオプス・トランカトゥス	バンドウイルカ	9750万年前	XP_004332367	1064 単数形	77%	83%
オルニトリンクス・アナティヌス	カモノハシ	1億7920万年前	XP_007666895	888 aa	69%	74%
カメ	アオウミガメ	3億2050万年前	XP_007070970	936 単数形	75%	83%
ピゴセリス・アデリアエ	アデリーペンギン	3億2050万年前	XP_009318201	938 アミノ酸	75%	83%
カリドリス（フィロマクス）プグナクス	ラフ	3億2050万年前	XP_014821534	899 AA	74%	83%
クリセミス・ピクタ・ベリ	ニシキガメ	3億2050万年前	XP_008175998	825 アミノ酸	73%	82%
アクイラ・クリサエトス・カナデンシス	ゴールデン・ディーグル	3億2050万年前	XP_011579121	916 aa	73%	81%
アリゲーター・シネンシス	中国ワニ	3億2050万年前	XP_014376376	940 アミノ酸	72%	81%
ヤモリ	ニホンヤモリ	3億2050万年前	XP_015281837	1053 aa	65%	75%
Python bivittatus	ビルマニシキヘビ	3億2050万年前	XP_007438154	924 アミノ酸	65%	75%
アノール・カロリネンシス	カロライナアノール	3億2050万年前	XP_008124125	920 AA	64%	75%
アフリカツメガエル	ウエスタンツメガエル	3億5570万年前	XP_012813331	944 アミノ酸	51%	63%
レピソステウス・オクラトゥス	スポッテッドガー	4億2960万年前	XP_015197497	885 aa	47%	58%
カロリンクス・ミリ	オーストラリアのゴーストシャーク	4億8290万年前	XP_007889503	965 単数形	64%	75%

タンパク質

一般的な特性

翻訳されたPROSER1タンパク質は944アミノ酸から構成され、その予測分子量は95.7 kDaである。^[12] PROSER1の等電点は9である。 ^[13]核内に局在すると予測されている。^[14]

構成

この配列はプロリンとセリンが豊富であり、他のアミノ酸が特に少ないわけではありません。

ドメイン

PROSER1には、pfam14771の一部であるDUF 4476という機能不明のドメインが1つ含まれています。DUFはアミノ酸26番から121番までの範囲に広がっています。 ^[2] DUF 4476の分子量は11.1 kDaです。

二次構造

PROSER1は主にαヘリックス、βシート、コイルから構成されており、タンパク質の大部分はコイル状になっています。DUFは主にαヘリックスとコイルから構成されており、タンパク質全体と比較するとβシートの数はわずかに少ないです。^[15]

参考文献

^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
^ 「GeneCards」. ヒト遺伝子データベース.
^ 「BioCompare」. BioCompare.
^ "Ensembl". Ensembl.
^ 「GeneCards」. ヒト遺伝子データベース.
^ 「NCBI遺伝子」。NCBI。
^ 「NCBI遺伝子」。NCBI。
^ 「Uniprot」. Uniprot.
^ 「組織アトラス」。ヒトタンパク質アトラス。
^ "Ensembl". Ensembl.
^ "Ensembl". Ensembl.
^ 「Uniprot」. Uniprot.
^ 「Expasy」. Expasy.
^ 「PSORT II予測」。PSORT II。
^ 「SDSC 生物学ワークベンチ」。SDSC。

[1] 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[2] 「GeneCards」. ヒト遺伝子データベース.

[3] 「BioCompare」. BioCompare.

[4] "Ensembl". Ensembl.

[5] 「GeneCards」. ヒト遺伝子データベース.

[6] 「NCBI遺伝子」。NCBI。

[7] 「NCBI遺伝子」。NCBI。

[8] 「Uniprot」. Uniprot.

[9] 「組織アトラス」。ヒトタンパク質アトラス。

[10] "Ensembl". Ensembl.

[11] "Ensembl". Ensembl.

[12] 「Uniprot」. Uniprot.

[13] 「Expasy」. Expasy.

[14] 「PSORT II予測」。PSORT II。

[15] 「SDSC 生物学ワークベンチ」。SDSC。