ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | SET、2PP2A、I2PP2A、IGAAD、IPP2A2、PHAPII、TAF-I、TAF-IBETA、SET核プロトオンコゲン、MRD58 |
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| 外部ID | オミム:600960; MGI : 1860267;ホモロジーン: 55707;ジーンカード:セット; OMA :SET - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 染色体2(マウス)[2] |
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| | バンド | 2|2 B | 始める | 29,947,390 bp [2] |
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| 終わり | 29,962,589 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 神経節隆起
- アキレス腱
- 心室帯
- 鼻咽頭上皮
- 結腸上皮
- 胚上皮
- 眼瞼結膜
- リンパ節
- 視神経
- 壁側胸膜
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| | 上位の表現 | - 胚の尾
- 胚葉上層
- 腹壁
- 移動性腸管神経堤細胞
- 桑実胚
- 心室帯
- 胚
- 精管
- 原始的な条線
- 体節
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- DNA結合
- ヒストン結合
- タンパク質結合
- タンパク質ホスファターゼ阻害活性
- タンパク質ホスファターゼ調節活性
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- 細胞質
- 核質
- 小胞体
- 細胞質の核周囲領域
- 核
- 脂肪滴
- タンパク質含有複合体
| | 生物学的プロセス |
- ニューロンのアポトーシス過程の負の調節
- ヌクレオソームの組み立て
- mRNAの安定性の調節
- DNA複製
- ヌクレオソームの分解
- 核質輸送
- ウイルスプロセス
- 転写の負の制御、DNAテンプレート
- ヒストンのアセチル化の負の制御
- 触媒活性の負の調節
- 触媒活性の調節
- リン酸化タンパク質ホスファターゼ活性の負の調節
- リン酸化タンパク質ホスファターゼ活性の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オーソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001122821 NM_001248000 NM_001248001 NM_003011 NM_001374326 |
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| RefSeq(タンパク質) | |
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NP_001116293 NP_001234929 NP_001234930 NP_003002 NP_001361255 |
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| 場所(UCSC) | 9章: 128.68 – 128.7 Mb | 2章: 29.95 – 29.96 MB |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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タンパク質SETはタンパク質SET1とも呼ばれ、ヒトではSET遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
相互作用
タンパク質 SET は以下と相互作用することが示されています。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000119335 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000054766 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ von Lindern M, van Baal S, Wiegant J, Raap A, Hagemeijer A, Grosveld G (1992年8月). 「骨髄性白血病発症に関連する推定がん遺伝子Canは、その3'末端側が他の遺伝子と融合することで活性化される可能性がある:標的遺伝子の特性解析」. Molecular and Cellular Biology . 12 (8): 3346–55 . doi :10.1128/mcb.12.8.3346. PMC 364582. PMID 1630450 .
- ^ Li M, Makkinje A, Damuni Z (1996年5月). 「骨髄性白血病関連タンパク質SETはタンパク質ホスファターゼ2Aの強力な阻害剤である」. The Journal of Biological Chemistry . 271 (19): 11059–62 . doi : 10.1074/jbc.271.19.11059 . PMID 8626647.
- ^ 「Entrez遺伝子:SET SET転座(骨髄性白血病関連)」。
- ^ ab Seo SB, McNamara P, Heo S, Turner A, Lane WS, Chakravarti D (2001年1月). 「ヒト細胞複合体INHATによるヒストンのアセチル化および転写の制御(INHATは腫瘍タンパク質を含有)」. Cell . 104 (1): 119–30 . doi : 10.1016/s0092-8674(01)00196-9 . PMID 11163245. S2CID 11144887.
- ^ Fan Z, Beresford PJ, Zhang D, Lieberman J (2002年4月). 「HMG2はヌクレオソーム組立タンパク質SETと相互作用し、細胞傷害性Tリンパ球プロテアーゼであるグランザイムAの標的となる」. Molecular and Cellular Biology . 22 (8): 2810–20 . doi :10.1128/mcb.22.8.2810-2820.2002. PMC 133744. PMID 11909973 .
- ^ Qu D, Li Q, Lim HY, Cheung NS, Li R, Wang JH, Qi RZ (2002年3月). 「SETタンパク質は神経細胞のCdk5活性化因子p35nck5aに結合し、Cdk5/p35nck5aの活性を調節する」. The Journal of Biological Chemistry . 277 (9): 7324–32 . doi : 10.1074/jbc.M107270200 . hdl : 10536/DRO/DU:30101408 . PMID 11741927.
- ^ 宮本 誠、鈴木 剛、武藤 誠、相澤 功、木村 明、水野 雄、凪野 剛、今井 雄、安達 暢、堀越 正、永井 亮 (2003年12月). 「p300と発癌制御因子SETによる心血管転写因子KLF5の正負の制御:DNA結合ドメインの相互作用とアセチル化を介した制御」.分子細胞生物学. 23 (23): 8528–41 . doi :10.1128/mcb.23.23.8528-8541.2003. PMC 262669. PMID 14612398 .
- ^ Fan Z, Beresford PJ, Oh DY, Zhang D, Lieberman J (2003年3月). 「腫瘍抑制因子NM23-H1はCTLを介したアポトーシスにおいてグランザイムA活性化DNaseであり、ヌクレオソーム形成タンパク質SETはその阻害剤である」. Cell . 112 (5): 659–72 . doi : 10.1016/s0092-8674(03)00150-8 . PMID 12628186. S2CID 14019153.
さらに読む
- 永田 憲治、河瀬 秀、半田 秀、矢野 憲治、山崎 正之、石見 雄一、奥田 明、菊池 明、松本 憲治 (1995年5月). 「骨髄性白血病発症に関連する推定癌遺伝子setによってコードされる複製因子」.米国科学アカデミー紀要. 92 (10): 4279–83 . Bibcode :1995PNAS...92.4279N. doi : 10.1073 /pnas.92.10.4279 . PMC 41927. PMID 7753797.
- 丸山 憲治、菅野 誠 (1994年1月). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」.遺伝子. 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Aomori Y, Pavlakis GN, Copeland TD (1994年3月). 「急性未分化白血病における転座切断点によってコードされる核リン酸化タンパク質SETのin vivoリン酸化部位の同定」. FEBS Letters . 340 (3): 231–5 . Bibcode :1994FEBSL.340..231A. doi : 10.1016/0014-5793(94)80144-4 . PMID 8131851. S2CID 36974869.
- Vaesen M, Barnikol-Watanabe S, Götz H, Awni LA, Cole T, Zimmermann B, Kratzin HD, Hilschmann N (1994年2月). 「HLAクラスII関連タンパク質候補2種:PHAPIおよびPHAPIIの精製と特性解析」. Biological Chemistry Hoppe-Seyler . 375 (2): 113– 26. doi :10.1515/bchm3.1994.375.2.113. PMID 8192856.
- Aomori Y, Pavlakis GN, Copeland TD (1994年1月). 「急性未分化白血病における転座切断点にコードされる核リン酸化タンパク質SETの同定と特性解析」. The Journal of Biological Chemistry . 269 (3): 2258–62 . doi : 10.1016/S0021-9258(17)42162-4 . PMID 8294483.
- Adler HT, Nallaseth FS, Walter G, Tkachuk DC (1997年11月). 「HRX白血病融合タンパク質は、白血病関連タンパク質SETおよびタンパク質ホスファターゼ2Aとヘテロ複合体を形成する」. The Journal of Biological Chemistry . 272 (45): 28407–14 . doi : 10.1074/jbc.272.45.28407 . PMID 9353299.
- 鈴木雄三、中川吉智、丸山健、須山明生、菅野誠一 (1997年10月). 「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」. Gene . 200 ( 1–2 ): 149–56 . doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Carlson SG, Eng E, Kim EG, Perlman EJ, Copeland TD, Ballermann BJ (1998年10月). 「タンパク質ホスファターゼ2A阻害剤SETの発現と腎発達およびウィルムス腫瘍」. Journal of the American Society of Nephrology . 9 (10): 1873–80 . doi : 10.1681/ASN.V9101873 . PMID 9773788.
- Brennan CM, Gallouzi IE, Steitz JA (2000年10月). 「HuRに対するタンパク質リガンドはin vivoで標的mRNAとの相互作用を調節する」. The Journal of Cell Biology . 151 (1): 1– 14. doi : 10.1083/jcb.151.1.1. PMC 2189805. PMID 11018049.
- Shikama N, Chan HM, Krstic-Demonacos M, Smith L, Lee CW, Cairns W, La Thangue NB (2000年12月). 「ヌクレオソームアセンブリタンパク質とp300/CREB結合タンパク質ファミリーコアクチベーター間の機能的相互作用」. Molecular and Cellular Biology . 20 (23): 8933–43 . doi :10.1128/MCB.20.23.8933-8943.2000. PMC 86548. PMID 11073993 .
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2000年11月). 「in vitro部位特異的組換えを用いたDNAクローニング」. Genome Research . 10 (11): 1788–95 . doi :10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863 .
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- Minakuchi M, Kakazu N, Gorrin-Rivas MJ, Abe T, Copeland TD, Ueda K, Aomori Y. (2001年3月). 「急性未分化白血病関連タンパク質SETに結合する新規タンパク質SEBの同定と特性解析」(PDF) . European Journal of Biochemistry . 268 (5): 1340–51 . doi : 10.1046/j.1432-1327.2001.02000.x . hdl :2433/150179. PMID 11231286.
- Beresford PJ, Zhang D, Oh DY, Fan Z, Greer EL, Russo ML, Jaju M, Lieberman J (2001年11月). 「グランザイムAは小胞体関連カスパーゼ非依存性ヌクレアーゼを活性化し、一本鎖DNA切断を誘導する」. The Journal of Biological Chemistry . 276 (46): 43285–93 . doi : 10.1074/jbc.M108137200 . PMID 11555662.
- Qu D, Li Q, Lim HY, Cheung NS, Li R, Wang JH, Qi RZ (2002年3月). 「SETタンパク質は神経細胞のCdk5活性化因子p35nck5aに結合し、Cdk5/p35nck5aの活性を調節する」. The Journal of Biological Chemistry . 277 (9): 7324–32 . doi : 10.1074/jbc.M107270200 . hdl : 10536/DRO/DU:30101408 . PMID 11741927.
- Fan Z, Beresford PJ, Zhang D, Lieberman J (2002年4月). 「HMG2はヌクレオソーム組立タンパク質SETと相互作用し、細胞傷害性Tリンパ球プロテアーゼであるグランザイムAの標的となる」. Molecular and Cellular Biology . 22 (8): 2810–20 . doi :10.1128/MCB.22.8.2810-2820.2002. PMC 133744. PMID 11909973 .
- Cervoni N, Detich N, Seo SB, Chakravarti D, Szyf M (2002年7月). 「ヒストンアセチルトランスフェラーゼ阻害剤である腫瘍性タンパク質Set/TAF-1betaは、DNAの活性脱メチル化を阻害し、DNAメチル化と転写サイレンシングを統合する」. The Journal of Biological Chemistry . 277 (28): 25026–31 . doi : 10.1074/jbc.M202256200 . PMID 11978794.