プロトパルボウイルス
ウイルスの属

プロトパルボウイルス
犬パルボウイルスの電子顕微鏡写真
犬パルボウイルスの電子顕微鏡写真
ウイルスの分類 この分類を編集する
（ランク外）: ウイルス
レルム: モノドナビリア
王国： ショウトクビレ
門: コサビリコタ
クラス： クイントビリセテス
注文： ピコウイルス科
家族： パルボウイルス科
亜科: パルボウイルス科
属: プロトパルボウイルス
種[1]

テキストを参照

プロトパルボウイルスは、パルボウイルス科パルボウイルス亜科に属するウイルス属です。 [2] [3]自然宿主は脊椎動物です。この属には23種が含まれます[4]。その中には、マウス微小ウイルス（MVM）を代表とする齧歯類プロトパルボウイルス1が含まれます。この属には、子犬の消化管に損傷を与え、致死率が約80%に達する犬パルボウイルス（CPV） [5]や、豚の胎児死亡や不妊症の主な原因となる豚パルボウイルス（PPV）も含まれます。 [1]この属は系統学的に2つの枝に分かれており、1つはMVM、CPV、PPVなど、かなり詳細に研究されている多くの創始者を含む枝、もう1つは、ウイルス発見手法を用いて野生株で最近コード配列が同定されたものの、その生物学的性質はほとんど研究されていない予測ウイルスのみで構成される枝である。この2番目の枝には現在、ヒトに感染するProtoparvovirus primate1とProtoparvovirus primate3と呼ばれる2種が含まれる。2014年まではParvovirus属と呼ばれていたが、この属とParvoviridae科全体のメンバーとの混同を避けるため改名された。 [6] [7]

分類学

23種が認められており、その多くは複数の命名されたウイルス、ウイルス株、遺伝子型、または血清型を含んでいます。ウイルスに適用される場合、種の定義は少し変わっています。[8]これは単に、選択された範囲の遺伝子変異をクラスター化する抽象的な分類概念であり、系統発生系統の分岐を区別するのに役立ちますが、動物に感染したり分離したりできるウイルスのような物理的実体ではありません。[9]種を定義するために使用される多様性レベルが非常に低く設定されている場合、多くの種が実質的に単一のウイルスを含み、ウイルスと種に同じ名前が付けられる場合さえあります。その結果、文献で2つの概念が混同され、種の分類群の系統発生的役割が軽視されます。この問題に対処するため、現在パルボウイルス科の種に認められている多様性レベルは比較的広くなっています。種は、通常NS1と呼ばれる特定の複製タンパク質をコードする類似のウイルスのクラスターとして定義され、そのタンパク質は、その種の他のメンバーによってコードされるタンパク質と少なくとも85％同一です。[6] [7]

この属には以下の種が含まれており、学名とそれぞれの種の代表的なウイルス名が列挙されている: [4] [10]

  • プロトパルボウイルス・カルニボラン1、イヌパルボウイルス。この種にはネコパルボウイルスも含まれる。
  • プロトパルボウイルス・カルニボラン2、ラッコパルボウイルス
  • プロトパルボウイルスカルニボラン3、イヌブファウイルス
  • プロトパルボウイルス・カルニボラン4、キツネパルボウイルス
  • プロトパルボウイルス・カルニボラン5、ニューラウイルス
  • プロトパルボウイルス カルニボラン6、パルボウイルス科Dogfe372C6
  • プロトパルボウイルス カルニボラン7、パルボウイルス科Dogfe373C1
  • プロトパルボウイルス カルニボラン8、パルボウイルス科Dogfe342C1
  • プロトパルボウイルス・キロプテラン1、メガバット・ブファウイルス1
  • プロトパルボウイルス・キロプテラン2、コウモリパルボウイルスBtPk-PV/スイス/2019
  • プロトパルボウイルス eulipotyphla1、ムプルング ブファウイルス
  • プロトパルボウイルス・インサータム1、ツサウイルス
  • プロトパルボウイルスpinniped1、カリフォルニアアシカパルボウイルスHanchett
  • プロトパルボウイルス霊長類1、ブファウイルス1a
  • プロトパルボウイルス霊長類2、ウハルフパルボウイルス1
  • プロトパルボウイルス霊長類3、クタウイルス
  • プロトパルボウイルス齧歯類1、マウス微小ウイルス
  • プロトパルボウイルス齧歯類2、ラットパルボウイルス1
  • プロトパルボウイルス齧歯類3、ラットブファウイルスSY-2015
  • プロトパルボウイルス有蹄類1、豚パルボウイルス
  • プロトパルボウイルス有蹄類2、豚ブファウイルス
  • 有蹄類プロトパルボウイルス3、馬プロトパルボウイルス
  • プロトパルボウイルス有蹄類4、豚パルボウイルス8

ヒトに感染するプロトパルボウイルスは、2012年にブルキナファソの子供の糞便から初めて発見され、シグルム・ブファウイルス（siglum bufavirus）と命名されました。[11]これまでに3つの遺伝子型のブファウイルスが検出されており、チュニジア、フィンランド[12]、ブータン[13]で流行しています。

この属でヒトに感染する2番目のウイルスであるクタウイルスは、当初下痢を起こした子供の糞便から分離されました。[14]

3つ目の潜在的なヒトプロトパルボウイルスであるツサウイルス1が1人のヒトの糞便から報告されているが、それがヒトに感染できるのか、それとも単に摂取されただけなのかは明らかにされていない。[15]

構造

プロトパルボウイルス属のウイルスは、直径約18～26 nmのエンベロープを持たないタンパク質カプシドを有し、T=1の正20面体対称性を示す。ゲノムは4～6 kbの長さの一本鎖線状DNAで、各末端には小さな（100～500 b）不完全な回文配列が折り畳まれ、特徴的な二本鎖ヘアピンテロメアを形成する。[5]

属 構造 対称 カプシド ゲノム配列 ゲノムセグメンテーション
プロトパルボウイルス 正二十面体 T=1 非封筒 直鎖状ssDNA いいえ

カプシドはVP1 と VP2 の両方を 含む 60 個の VP タンパク質 ( PDB : 2CAS ​) で構成されていると考えられています。

ゲノム構成

プロトパルボウイルスゲノムには2つのORFがあります。非構造ORF（NS）は5'末端側の「最初の」ORFで、構造ORF（VP）は3'末端側にあります。ゲノムは広範な選択的スプライシングによって発現されます。これによりVPが発現するだけでなく、各ORFの複数の選択的スプライシングバージョンが生成され、通常はNS1、NS2（P,Y,L）、VP1、VP2と呼ばれます。[5] UniProtで注釈が付けられたタンパク質の例を以下に示します。

ライフサイクル

ウイルスの複製は核内で行われる。宿主細胞への侵入は、宿主受容体への結合によって達成され、クラスリンを介したエンドサイトーシスが誘導される。複製はローリングヘアピンモデルに従う。ウイルスと宿主細胞の組み合わせによっては、子孫ウイルス粒子が小胞状に輸送され、細胞死前に親宿主細胞から放出される。一方、残りのウイルス粒子は細胞溶解後に放出される。現在、6目の脊椎動物が自然宿主として知られている。感染経路は、典型的には糞口感染および／または呼吸器感染である。[5]

属 ホストの詳細 組織向性 エントリー詳細 リリースの詳細 複製サイト 組立場所 伝染 ; 感染
プロトパルボウイルス 脊椎動物 変数 エンドサイトーシス 早期小胞輸出/細胞溶解 核 核 糞口感染または呼吸器感染

歴史

1959年に分離されたキルハムラットウイルス[16]は、この小型で線状の一本鎖DNAウイルスファミリーで最初に同定されたウイルスでした。

その後数年間で、H1、LuIII、マウス微小ウイルス、腫瘍ウイルスXなど、物理的に類似した一連のウイルスが、研究室で日常的に使用されている細胞や組織から抽出されました[17]。また、豚の生殖障害の主な原因の一つである豚パルボウイルス（PPV）が感染した豚から分離されました[18] 。1971年、これらのウイルスはすべて、新たに設立された国際ウイルス分類委員会（ICTV）の第一報告書において、パルボウイルスと呼ばれる分類上の属の一部として認識されました[19]。

1976年に発表された第二次ICTV報告書では、当時3つの属を含むパルボウイルス科が確立されました。そのうちの1つはパルボウイルスという名称を保持し、前述のすべてのウイルスに加えて、飼い猫に腸炎、汎白血球減少症、先天性小脳失調症の流行を引き起こすことが示されている猫汎白血球減少症ウイルス（現在は猫パルボウイルスと呼ばれ、略称FPV）を含んでいました。1978年には、FPVと同じ種から犬に感染するウイルス（犬パルボウイルスまたはCPVと呼ばれる）が出現し、急速に世界中に広がり、重篤な腸疾患や冠動脈疾患のパンデミックを引き起こしました。[20]

パルボウイルス属は2014年にプロトパルボウイルスに名称が変更されるまで、新しいウイルスを蓄積し続けました。[6] [7]

参考文献

  1. ^ ab 「Genus: Protoparvovirus」. ictv.global . 国際ウイルス分類委員会. 2025年1月31日閲覧。
  2. ^ サンフランシスコ州コットモア;アグバンジェ・マッケンナ、M;カヌーティ、M;キオリーニ、JA;エイス・ヒュービンガー、A;ヒューズ、J;ミーチェ、M;モーダ、S;オリアストロ、M;ペンゼス、JJ;ピンテル、DJ。邱、J;ソデルランド・ヴェネルモ、M;タタソール、P;タイセン、P;および ICTV レポート コンソーシアム (2019)。 「ICTV ウイルス分類プロファイル: パルボウイルス科」。一般ウイルス学のジャーナル。100 (3): 367–368 .土井:10.1099/jgv.0.001212。PMC 6537627。PMID  30672729。 
  3. ^ “ICTV第10報（2018年）パルボウイルス科”.
  4. ^ ab 「ウイルス分類：2024年版」。国際ウイルス分類委員会。2025年3月26日閲覧。
  5. ^ abcd "Viral Zone". ExPASy . 2015年6月15日閲覧。
  6. ^ abc 「ICTV公式タクソノミー：第8回報告書以降の最新情報」ICTV公式タクソノミー。2014年5月19日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2014年6月11日閲覧。
  7. ^ abc コットモア SF、アグバンジェ=マッケンナ M、キオリーニ JA、ムカ DV、ピンテル DJ、キウ J、ソーデルランド=ヴェネルモ M、タッターソール P、タイセン P、ギャザラー D、デイヴィソン AJ。 2014. パルボウイルス科。アーチ。ヴィロル。 159: 1239–47。
  8. ^ Van Regenmortel MHV (2000) ウイルス分類における種概念の導入. Van Regenmortel MHV, Fauquet CM, Bishop DHL, Carstens EB, Estes MK, Lemon SM, McGeogh DJ, Maniloff J, Mayo MA, Pringle CR, Wickner RB. (編) ウイルス分類学 - 国際ウイルス分類委員会第7回報告書. Elsevier Academic Press, London.
  9. ^ Van Regenmortel MHV (2003) 「ウイルスは実在するが、ウイルス種は人為的に作られた分類学的構築物である。」Arch. Virol. 148: 2481–2488.
  10. ^ 「種リスト：パルボウイルス科」. 国際ウイルス分類委員会. 2025年3月26日閲覧。
  11. ^ Phan TG、Vo NP、Bonkoungou IJ、Kapoor A、Barro N、O'Ryan M、Kapusinszky B、Wang C、Delwart E. 2012. 西アフリカの小児における急性下痢: 多様な腸内ウイルスと新規パルボウイルス属。 J・ヴィロル。 86:11024–30
  12. ^ Väisänen E、Kuisma I、Phan TG、Delwart E、Lappalainen M、Tarkka E、Hedman K、Söderlund-Venermo M. 2014. フィンランド、胃腸炎患者の糞便中のブファウイルス。 Emerg Infect Dis. 20(6):1078–80。
  13. ^ Yahiro T、Wangchuk S、Thering K、Bandhari P、Zangmo S、Dorji T、Tshering K、matsumoto T、Nishizono A、Söderlund-Venermo M、Ahmed K. 2014. ブータン、重篤な下痢の小児における新規ヒトブファウイルス遺伝子型 3。 Emerg Infect Dis. 20(6):1037–9。
  14. ^ Phan TG、Dreno B、da Costa AC、Li L、Orlandi P、Deng X、Kapusinszky B、Siqueira J、Knol AC、Halary F、Dantal J、Alexander KA、Pesavento PA、Delwart E ヒト糞便サンプルおよび皮膚 T 細胞リンパ腫 (菌状息肉腫) に含まれる新しいプロトパルボ ウイルス。ウイルス学 496:299–305。土井: 10.1016/j.virol.2016.06.013
  15. ^ Phan TG, Sdiri-Loulizi K, Aouni M, Ambert-Balay K, Pothier P, Deng X, Delwart E (2014) チュニジアにおける原因不明の下痢を呈する小児における新たなパルボウイルス検出 Emerg Infect Dis 20(11):1911–1913. doi: 10.3201/eid2011.140428
  16. ^ キルハム、L.とオリヴィエ、LJ 1959. 組織培養で分離されたラットの潜伏ウイルス. ウイルス学 7: 428–37
  17. ^ Tattersall, P. 2006. パルボウイルス分類の進化. 『パルボウイルス』 J. Kerr, SF Cotmore, ME Bloom, RM Linden, CR Parrish (編), 第1章, pp. 5–4. Hodder Arnold, ロンドン.
  18. ^ Ren X、Tao Y、Cui J、Suo S、Cong Y、Tijssen P. 2013. ブタパルボウイルスの系統発生と進化。ウイルス研究。 178:392–397。
  19. ^ 「国際ウイルス分類委員会（ICTV）」.
  20. ^ Hoelzer K, Parrish CR. 2010. 肉食動物におけるパルボウイルスの出現. Vet. Res. 41:39.
  • ウイルスゾーン：プロトパルボウイルス
  • ICTV
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