| purD RNAモチーフ | |
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| 識別子 | |
| シンボル | purD |
| Rfam | RF01069 |
| その他のデータ | |
| RNAタイプ | シス-reg |
| ドメイン | 細菌 |
| SO | SO:0005836 |
| PDB構造 | PDBe |
purD RNAモチーフは、ヘリコバクター属やカンピロバクター属などのキャンピロバクター門に見られる保存されたRNA構造です。[1]このRNAは、 purD遺伝子の 見かけ上の5' UTRに一貫して存在します。purD 遺伝子は、プリンのde novo合成の初期段階を触媒する酵素、ホスホリボシルアミン-グリシンリガーゼをコードしています。このモチーフはシス制御的な役割を持つ可能性が提案されていましたが、実験結果から、関連種の6S RNAと重複していること、そしてモチーフの 2番目のヘアピンが生物学的ではない可能性があることが示唆されています。 [2]
参考文献
- ^ Weinberg Z, Barrick JE, Yao Z, et al. (2007). 「CMfinder比較ゲノミクスパイプラインを用いた細菌中の22の候補構造化RNAの同定」Nucleic Acids Res . 35 (14): 4809–4819 . doi :10.1093/nar/gkm487 . PMC 1950547. PMID 17621584
- ^ Sharma CM, Hoffmann S , Darfeuille F, et al. (2010年2月). 「主要ヒト病原体Helicobacter pyloriの一次トランスクリプトーム」Nature 464 (7286): 250– 255. doi :10.1038/nature08756. PMID 20164839. S2CID 205219639.
外部リンク
- RfamのPurD_RNA_motifのページ
