ピロジクチウム

Genus of archaea

ピロジクチウム
科学的分類 この分類を編集する
ドメイン: 古細菌
王国: 熱タンパク質
門: サーモプロテオタ
クラス: 熱タンパク質
注文: デスルフォロコッカス
家族: ピロディクチウム科
属: パイロディクチウム
ステッター、ケーニッヒ & シュタッケブラント 1984
タイプ種
ピロディクティウム・オカルトゥム
シュテッター、ケーニッヒ、シュタッケブラント 1984

ピロディクティウムピロディクティウム科に属する属で、海底に生息する超好熱性古細菌の一種です。最適生育温度は80~110℃です。カニューレのネットワークと扁平な円盤状の細胞からなる独特な細胞構造を有しています。ピロディクティウムは深海噴出孔の多孔質壁に生息しており、その内部は400℃にも達しますが、外部の海洋環境は通常3℃です。ピロディクティウムは、このような温暖な気候と寒冷な気候が混在する環境に形態的に適応していると考えられます。

ゲノム構造

ピロディクティウムがこのような極端な温度下で生存し、さらには繁殖する能力を理解するために、その遺伝学に関する研究が数多く行われてきました。ピロディクティウム・オクルトゥムの単離tRNAの熱安定性が分析され、ヌクレオシドの修飾によってこの生物は100℃をはるかに超える温度に耐えられることが示唆されています。

細胞構造と代謝

ピロディクティウム細胞は、熱安定性のモデルとなることから、科学者によって研究されてきました。細胞の構造は、直径300~2500ナノメートル、幅最大300ナノメートルの平らで不規則な円盤状です。細胞は、中空の管状カニューレ(細管)のネットワークによって繋がれた独特の薄片状の形状で成長します。管状カニューレは枝分かれして他の細胞と結合し、その移動範囲を大幅に広げます。この形態の正確な理由は不明ですが、カニューレによって得られる可動範囲が、生物が生息する環境の極度の高温から生じる熱エネルギーによって細胞が自由に移動できるようにしていると考えられます。細胞の広いサイズ範囲により、ピロディクティウムは深海の噴出孔壁の様々な隙間に生息できる可能性があります。

生態学

Members of Pyrodictium are located in deep-sea hydrothermal vents, first discovered in 1979. Their ecological significance remains a mystery because of the difficulty in collecting samples which may yield data on the abundance and diversity of these extremophiles.[1]

Phylogeny

The currently accepted taxonomy is based on the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) [2] and National Center for Biotechnology Information (NCBI)[1]

16S rRNA based LTP_06_2022[3][4][5] 53 marker proteins based GTDB 10-RS226[6][7][8]

Pyrolobus fumarii Blöchl et al. 1999

Pyrodictium brockii Stetter et al. 1984

Hyperthermus butylicus Zillig et al. 1991

Pyrodictium

P. occultum Stetter et al. 1984

P. abyssi Pley and Stetter 1991

P. delaneyi Lin et al. 2016

Pyrolobus fumarii

Hyperthermus butylicus

Pyrofollis japonicus Miyazaki et al. 2024

Pyrodictium

P. occultum

P. abyssi

P. delaneyi

See also

References

  1. ^ a b Sayers; et al. "Pyrodictium". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 2011-06-05.
  2. ^ J.P. Euzéby. "Pyrodictium". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved 2020-11-17.
  3. ^ "The LTP". Retrieved 10 May 2023.
  4. ^ "LTP_all tree in newick format". Retrieved 10 May 2023.
  5. ^ "LTP_06_2022 Release Notes" (PDF). Retrieved 10 May 2023.
  6. ^ "GTDB release 10-RS226". Genome Taxonomy Database. Retrieved 1 May 2025.
  7. ^ "ar53_r226.sp_label". Genome Taxonomy Database. Retrieved 1 May 2025.
  8. ^ "Taxon History". Genome Taxonomy Database. Retrieved 1 May 2025.

Further reading

Scientific journals

  • Goodsell DS, Haas D (July 2014). "Visualising microorganisms from molecules to cells". FEMS Microbiology Letters. 356 (1): 1–7. doi:10.1111/1574-6968.12485. PMID 25039917.
  • Burggraf S, Huber H, Stetter KO (July 1997). "Reclassification of the crenarchael orders and families in accordance with 16S rRNA sequence data". International Journal of Systematic Bacteriology. 47 (3): 657–60. doi:10.1099/00207713-47-3-657. PMID 9226896.
  • Stetter KO, König H, Stackebrandt E (1983). "Pyrodictium gen. nov., a New Genus of Submarine Disc-Shaped Sulphur Reducing Archaebacteria Growing Optimally at 105°C". Systematic and Applied Microbiology. 4 (4): 535–51. doi:10.1016/s0723-2020(83)80011-3. PMID 23194811.


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