準連鎖平衡

準連鎖平衡（QLE）は、集団遺伝学の問題を解く際に用いられる数学的近似である。木村資生は、フィッシャーの基本定理のモデルを簡素化する概念を導入した。QLEは、弱い選択と弱いエピスタシスを仮定しながら、集団の遺伝方程式を大幅に簡素化する。^[1] これらの条件下での選択は、対立遺伝子頻度を急速に変化させ、あたかも連鎖平衡にあるかのように進化させる。木村はもともと、2遺伝子座系におけるQLEの十分条件を提示したが、最近、何人かの研究者が、一般的な多遺伝子座系でQLEが起こる仕組みを示している。^[2] QLEは、理論家が連鎖不平衡を単純な式、多くの場合は対立遺伝子頻度または遺伝子型頻度の単純な関数で近似することを可能にし、それによって、複数の遺伝子座または多遺伝子形質の選択を含む非常に複雑な問題に対する解を提供する。^{[3] QLEは、}メンデルの原理から量的遺伝方程式を導出する際に、近似を正当化する上でも重要な役割を果たす。

シンプルモデル

、、を半数体2座2対立遺伝子モデルにおける4つの可能な遺伝子型の頻度を表すものとする。木村のオリジナルモデル^[1]では、 $X$ $Y$ $Z$ $U$

$R={\frac {XU}{YZ}}$

組換えに対するエピスタシス効果が小さい場合、安定状態に急速に近づく。からの逸脱は、世代ごとに組換え率によって減少する。 ${\hat {R}}$ ${\hat {R}}$

参考文献

^ ab 木村基夫 (1965). 「自然選択によって遺伝子頻度が変化する状況における準連鎖平衡の達成」遺伝学52 ( 5): 875–890 . doi :10.1093/genetics/52.5.875. PMC 1210959. PMID 17248281 .
^ Nagylaki, Thomas; Hofbauer, Joseph; Brunovsky, Pavel (1999). 「弱いエピスタシスまたは弱い選択下における多座系の収束」. Journal of Mathematical Biology . 38 (2): 103– 133. doi :10.1007/s002850050143. PMID 10085555. S2CID 1220489.
^ カークパトリック, マーク; ジョンソン, トビー; バートン, ニコラス (2002). 「多座進化の一般モデル」.遺伝学. 161 (4): 1727–1750 . doi :10.1093/genetics/161.4.1727. PMC 1462196. PMID 12196414 .

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[kimura-1] 木村基夫 (1965). 「自然選択によって遺伝子頻度が変化する状況における準連鎖平衡の達成」遺伝学52 ( 5): 875–890 . doi :10.1093/genetics/52.5.875. PMC 1210959. PMID 17248281 .

[nagylaki-2] Nagylaki, Thomas; Hofbauer, Joseph; Brunovsky, Pavel (1999). 「弱いエピスタシスまたは弱い選択下における多座系の収束」. Journal of Mathematical Biology . 38 (2): 103– 133. doi :10.1007/s002850050143. PMID 10085555. S2CID 1220489.

[kjb-3] カークパトリック, マーク; ジョンソン, トビー; バートン, ニコラス (2002). 「多座進化の一般モデル」.遺伝学. 161 (4): 1727–1750 . doi :10.1093/genetics/161.4.1727. PMC 1462196. PMID 12196414 .