ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| RAB4A |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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1YU9、1Z0K、2BMD、2BME |
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| 識別子 |
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| エイリアス | RAB4A、HRES-1、HRES-1/RAB4、HRES1、RAB4、RASがん遺伝子ファミリーのメンバー |
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| 外部ID | オミム: 179511; MGI : 105069;ホモロジーン: 101538;ジーンカード:RAB4A; OMA :RAB4A - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 8番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 8 E2|8 72.19 cM | 始める | 124,532,724 bp [2] |
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| 終わり | 1億2456万2026塩基対[2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 視床の外側核群
- 耳下腺
- 緻密部
- 鼻粘膜の嗅覚領域
- 眼瞼結膜
- 人間のペニス
- 右心室
- 網状部
- 内皮細胞
- アキレス腱
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| | 上位の表現 | - 耳下腺
- 精嚢
- 涙腺
- 卵黄嚢
- 顎下腺
- 右腎臓
- 上行大動脈
- 小脳皮質
- 肝臓の左葉
- 十二指腸
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- ヌクレオチド結合
- GDP結合
- ATPase結合
- GTP結合
- タンパク質結合
- GTPase活性
- ATPase活性化因子活性
- シンタキシン結合
- イオンチャネル型グルタミン酸受容体結合
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- リサイクルエンドソーム
- 小胞
- 細胞質
- エンドソーム
- 膜
- 細胞内膜小器官
- インスリン反応性コンパートメント
- 細胞膜
- 細胞質の核周囲領域
- 細胞外エクソソーム
- 細胞質小胞膜
- シナプス後リサイクリングエンドソーム
- 初期エンドソーム膜
- エンドソーム膜のリサイクル
- シナプス小胞膜のアンカー成分
| | 生物学的プロセス |
- エンドサイトーシスの調節
- 抗原処理と提示
- ATP依存性活性の正の調節
- Rabタンパク質シグナル伝達
- タンパク質輸送
- ホスファチジルイノシトール生合成プロセス
- 細胞内タンパク質輸送
- 低分子GTPaseを介したシグナル伝達
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | | |
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| RefSeq(タンパク質) | |
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NP_001258927 NP_004569 NP_004569.2 |
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| 場所(UCSC) | 1章: 229.27 – 229.31 Mb | 8章: 124.53 – 124.56 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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Ras関連タンパク質Rab-4Aは、ヒトではRAB4A遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5]
相互作用
RAB4A は以下と相互作用することが示されています。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000168118 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000019478 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「Entrez Gene: RAB4A RAB4A、RAS がん遺伝子ファミリーのメンバー」。
- ^ Cormont M, Metón I, Mari M, Monzo P, Keslair F, Gaskin C, McGraw TE, Le Marchand-Brustel Y (2003年2月). 「CD2AP/CMSはRab4およびc-Cblとの相互作用を通じてエンドソームの形態と分解経路への輸送を制御する」. Traffic . 4 (2): 97–112 . doi :10.1034/j.1600-0854.2003.40205.x. PMID 12559036. S2CID 38612642.
- ^ 今村 剛志、黄 俊一、臼井 郁夫、佐藤 秀、ベバー 俊一、オレフスキー ジョン・ムルティ (2003年7月). 「インスリン誘導性GLUT4転座は、タンパク質キナーゼC-ラムダを介したRab4とモータータンパク質キネシン間の機能的結合に関与する」.分子細胞生物学. 23 (14): 4892– 900. doi :10.1128/mcb.23.14.4892-4900.2003. PMC 162221. PMID 12832475 .
- ^ Lindsay AJ, Hendrick AG, Cantalupo G, Senic-Matuglia F, Goud B, Bucci C, McCaffrey MW (2002年4月). 「Rabカップリングタンパク質(RCP)、新規Rab4およびRab11エフェクタータンパク質」. The Journal of Biological Chemistry . 277 (14): 12190–9 . doi : 10.1074/jbc.M108665200 . PMID 11786538.
- ^ Vitale G, Rybin V, Christoforidis S, Thornqvist P, McCaffrey M, Stenmark H, Zerial M (1998年4月). 「異なるRab結合ドメインがラバプチン5とGTP結合型Rab4およびRab5の相互作用を媒介する」. The EMBO Journal . 17 (7): 1941–51 . doi :10.1093/emboj/17.7.1941. PMC 1170540. PMID 9524117 .
- ^ Li L, Omata W, Kojima I, Shibata H (2001年2月). 「Rab4とシンタキシン4の直接的な相互作用」. The Journal of Biological Chemistry . 276 (7): 5265–73 . doi : 10.1074/jbc.M003883200 . PMID 11063739.
さらに読む
- Stibbs HH, Seed JR (1975年4月). 「Trypanosoma brucei gambiense感染ラットにおける(14-C)トリプトファンの短期代謝」. The Journal of Infectious Diseases . 131 (4): 459–62 . doi :10.1093/infdis/131.4.459. PMID 1117200.
- van der Sluijs P, Hull M, Huber LA, Mâle P, Goud B, Mellman I (1992年12月). 「可逆的なリン酸化-脱リン酸化は細胞周期におけるrab4の局在を決定する」. The EMBO Journal . 11 (12): 4379–89 . doi :10.1002/j.1460-2075.1992.tb05538.x. PMC 557012. PMID 1425574 .
- Bailly E, McCaffrey M, Touchot N, Zahraoui A, Goud B, Bornens M (1991年4月). 「p34cdc2によるRabファミリーの2つの低分子GTP結合タンパク質のリン酸化」. Nature . 350 (6320): 715–8 . Bibcode :1991Natur.350..715B. doi :10.1038/350715a0. PMID 1902553. S2CID 4261640.
- Rousseau-Merck MF, Zahraoui A, Touchot N, Tavitian A, Berger R (1991年2月). 「4つのRAS関連RAB遺伝子の染色体割り当て」. Human Genetics . 86 (4): 350–4 . doi :10.1007/BF00201831. PMID 1999336. S2CID 30730416.
- Zahraoui A, Touchot N, Chardin P, Tavitian A (1989年7月). 「ヒトRab遺伝子は、分泌に関与する酵母YPT1およびSEC4産物に関連するGTP結合タンパク質ファミリーをコードする」. The Journal of Biological Chemistry . 264 (21): 12394–401 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)63872-4 . PMID 2501306.
- Cormont M, Tanti JF, Zahraoui A, Van Obberghen E, Le Marchand-Brustel Y (1994年2月). 「Rab4はインスリン活性化細胞外シグナル調節キナーゼERK1によってリン酸化される」. European Journal of Biochemistry . 219 (3): 1081–5 . doi : 10.1111/j.1432-1033.1994.tb18591.x . PMID 8112321.
- 丸山 憲治、菅野 誠 (1994年1月). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」.遺伝子. 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Karniguian A, Zahraoui A, Tavitian A (1993年8月). 「ヒト血小板における低分子GTP結合rabタンパク質の同定:rab3B、rab6、およびrab8タンパク質のトロンビン誘導リン酸化」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 90 (16): 7647–51 . Bibcode :1993PNAS...90.7647K. doi : 10.1073/pnas.90.16.7647 . PMC 47199. PMID 8356066 .
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- 鈴木雄三、中川吉智、丸山健、須山明生、菅野誠一 (1997年10月). 「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」. Gene . 200 ( 1–2 ): 149–56 . doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Vitale G, Rybin V, Christoforidis S, Thornqvist P, McCaffrey M, Stenmark H, Zerial M (1998年4月). 「異なるRab結合ドメインがRabaptin-5とGTP結合型Rab4およびRab5の相互作用を媒介する」. The EMBO Journal . 17 (7): 1941–51 . doi :10.1093/emboj/17.7.1941. PMC 1170540. PMID 9524117 .
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- Shisheva A, Chinni SR, DeMarco C (1999年9月). 「Rabタンパク質の膜放出におけるGDP解離阻害因子2の一般的役割:in vitroおよびin vivoでの構造修飾による機能的相互作用の調節」.生化学. 38 (36): 11711–21 . doi :10.1021/bi990200r. PMID 10512627.
- Nagelkerken B、Van Anken E、Van Raak M、Gerez L、Mohrmann K、Van Uden N、Holthuizen J、Pelkmans L、Van Der Sluijs P (2000 年 3 月)。 「小型GTPアーゼrab4aの新規エフェクターであるラバプチン4は、核周囲のリサイクリング小胞に動員される。」生化学ジャーナル。346 (3): 593–601 .土井:10.1042/0264-6021:3460593。PMC 1220890。PMID 10698684。
- Gerez L、Mohrmann K、van Raak M、Jongeneelen M、Zhou XZ、Lu KP、van Der Sluijs P (2000 年 7 月)。 「有糸分裂中の細胞質におけるrab4GTPの蓄積とペプチジルプロリルイソメラーゼpin1との結合」。細胞の分子生物学。11 (7): 2201–11 .土井:10.1091/mbc.11.7.2201。PMC 14913。PMID 10888662。
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- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2000年11月). 「in vitro部位特異的組換えを用いたDNAクローニング」. Genome Research . 10 (11): 1788–95 . doi :10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863 .
- Cormont M, Mari M, Galmiche A, Hofman P, Le Marchand-Brustel Y (2001年2月). 「FYVEフィンガー含有タンパク質Rabip4は、初期エンドソーム輸送に関与するRab4エフェクターである」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 98 (4): 1637–42 . doi : 10.1073/pnas.031586998 . PMC 29309. PMID 11172003 .
- Bielli A, Thörnqvist PO, Hendrick AG, Finn R, Fitzgerald K, McCaffrey MW (2001年3月). 「低分子GTPase Rab4Aは細胞質ダイニン軽鎖中間鎖1の中央領域と相互作用する」.生化学および生物物理学的研究通信. 281 (5): 1141–53 . doi :10.1006/bbrc.2001.4468. PMID 11243854.
- Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (2000年9月). 「大規模cDNAシークエンシングによって同定された新規タンパク質の系統的細胞内局在」. EMBO Reports . 1 (3): 287–92 . doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614 .