RAB8A

RAB8A
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 3QBT、3TNF、4LHV、4LHW、4LHX、4LHY、4LHZ、4LI0
識別子
エイリアス	RAB8A、MEL、RAB8、RASがん遺伝子ファミリーのメンバー
外部ID	オミム：165040; MGI : 96960;ホモロジーン: 100934;ジーンカード：RAB8A; OMA :RAB8A - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 19番染色体（ヒト）[1] バンド 19p13.11 始める 16,111,889 bp [1] 終わり 16,134,234 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 8番染色体（マウス）[2] バンド 8 B3.3|8 34.84 cM 始める 72,915,044 bp [2] 終わり 72,937,748 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 単球 回腸粘膜 骨髄細胞 十二指腸 S状結腸粘膜 小腸粘膜 血 結腸上皮 顆粒球 人間のペニス 上位の表現 顆粒球 大臼歯 卵黄嚢 脛大腿関節 胸腺 十二指腸 右腎臓 小腸上皮 心室帯 内側神経節隆起 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 ヌクレオチド結合 GDP結合 GTP結合 ミオシンV結合 タンパク質結合 タンパク質キナーゼ結合 GTPase活性 細胞成分 細胞質 毛様体基底小体 リサイクルエンドソーム 細胞質 エンドソーム 中心体 食細胞小胞膜 ゴルジ体 細胞投影 膜 シナプス後密度 シナプス小胞 ゴルジ膜 繊毛 毛様体基部 ソーマ 樹状突起 貪食小胞 中心小体 細胞外エクソソーム 細胞骨格 細胞質小胞 細胞外マトリックス 細胞膜 トランスゴルジネットワーク輸送小胞 トランスゴルジネットワーク膜 樹状突起棘 エンドソーム膜のリサイクル 非運動性繊毛 分泌顆粒膜 胴体 シナプス グルタミン酸作動性シナプス 生物学的プロセス 長期的な神経シナプス可塑性の調節 タンパク質輸送の調節 軸索形成 エキソサイトーシスに関与する小胞ドッキング タンパク質分泌 タンパク質の局在の制御 細胞投影組織 有糸分裂細胞周期のG2/M移行 ゴルジ小胞の標的膜への融合 タンパク質輸送 タンパク質の細胞膜への局在 インスリン刺激に対する細胞反応 繊毛アセンブリ 毛様体基底小体と細胞膜のドッキング 神経伝達物質受容体のシナプス後膜への輸送 オートファジーの調節 オートファジー 翻訳後タンパク質修飾 エキソサイトーシスの調節 輸送 細胞内タンパク質輸送 Rabタンパク質シグナル伝達 神経伝達物質受容体輸送、エンドソームからシナプス後膜へ シナプスにおける小胞媒介輸送 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 4218 17274 アンサンブル ENSG00000167461 ENSMUSG00000003037 ユニプロット P61006 P55258 RefSeq (mRNA) NM_005370 NM_023126 RefSeq（タンパク質） NP_005361 NP_005361.2 NP_075615 場所（UCSC） 19章16.11～16.13節 8章: 72.92 – 72.94 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
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Ras関連タンパク質Rab-8Aは、ヒトではRAB8A遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[5] [6] [7]}

関数

この遺伝子によってコードされるタンパク質は、平均サイズが200アミノ酸の小さなGTP/GDP結合タンパク質であるRASスーパーファミリーのメンバーです。RAB/YPTファミリーのRAS関連タンパク質は、小胞体からゴルジ体および細胞膜へのタンパク質の輸送に関与していると考えられます。このタンパク質は、イヌRAB8、マウスMEL、およびマウスYPT1タンパク質とそれぞれ97%、96%、および51%の相同性があり、すべてのRASタンパク質に存在する4つのGTP/GDP結合部位を含みます。このタンパク質の推定エフェクター結合部位は、RAB/YPTタンパク質のものと類似しています。ただし、このタンパク質は、多くのRASスーパーファミリーメンバーに特徴的であるが、YPT1および大多数のRABタンパク質には見られないC末端CAAXモチーフを含みます。この遺伝子はメラノーマ細胞株から形質転換遺伝子として単離されたが、MELと悪性黒色腫との連鎖は証明されていない。この癌遺伝子は染色体19p13.1上のMY09Bから800kb遠位に位置する。^[7]

相互作用

RAB8Aはオプティニューリン^[8]およびMAP4K2 ^[9]と相互作用することが示されている。

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000167461 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000003037 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Nimmo ER, Sanders PG, Padua RA, Hughes D, Williamson R, Johnson KJ (1991年8月). 「MEL遺伝子：RAB/YPTクラスのRAS関連遺伝子の新たなメンバー」. Oncogene . 6 (8): 1347–51 . PMID  1886711.
6. Huber LA, Pimplikar S, Parton RG, Virta H, Zerial M, Simons K (1993年10月). 「Rab8はTGNと基底外側細胞膜間の小胞輸送に関与する低分子GTPaseである」. The Journal of Cell Biology . 123 (1): 35– 45. doi :10.1083/jcb.123.1.35. PMC 2119815. PMID 8408203  . 
7. "Entrez Gene: RAB8A RAB8A、RAS がん遺伝子ファミリーのメンバー".
8. Hattula K, Peränen J (2000). 「コイルドコイルタンパク質であるFIP-2はハンチンチンをRab8に連結し、細胞形態形成を制御する」Current Biology . 10 (24): 1603–6 . Bibcode :2000CBio...10.1603H. doi : 10.1016/S0960-9822(00)00864-2 . PMID  11137014. S2CID  12836037.
9. Ren M, Zeng J, De Lemos-Chiarandini C, Rosenfeld M, Adesnik M, Sabatini DD (1996年5月). 「活性型GTP結合タンパク質rab8は、ストレス活性化タンパク質キナーゼと相互作用する」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 93 (10): 5151–5 . Bibcode :1996PNAS...93.5151R. doi : 10.1073/pnas.93.10.5151 . PMC 39423. PMID 8643544  . 

さらに読む

• Newport J, Roemer MI (1975年3月). 「医療基盤と他の出産モデルにおける周産期死亡率の比較」. Inquiry . 12 (1): 10–7 . PMID  123217.
• Nimmo E, Padua RA, Hughes D, Brook JD, Williamson R, Johnson KJ (1989年3月). 「物理的および遺伝学的マッピングによる19番染色体上のc-MEL遺伝子座位の確認と精密化」. Human Genetics . 81 (4): 382–4 . doi :10.1007/BF00283697. PMID  2564840. S2CID  25002878.
• Zahraoui A, Joberty G, Arpin M, Fontaine JJ, Hellio R, Tavitian A, Louvard D (1994年1月). 「小さなrab GTPaseは非極性細胞では細胞質小胞に分布するが、極性上皮細胞ではタイトジャンクションマーカーZO-1と共局在する」. The Journal of Cell Biology . 124 ( 1–2 ): 101–15 . doi :10.1083/jcb.124.1.101. PMC  2119893. PMID  8294494 .
• Joberty G, Tavitian A, Zahraoui A (1993年9月). 「C末端CaaXモチーフを有するRabタンパク質のイソプレニル化」. FEBS Letters . 330 (3): 323–8 . Bibcode :1993FEBSL.330..323J. doi : 10.1016/0014-5793(93)80897-4 . PMID  8375503. S2CID  29047580.
• Ren M, Zeng J, De Lemos-Chiarandini C, Rosenfeld M, Adesnik M, Sabatini DD (1996年5月). 「活性型GTP結合タンパク質rab8は、ストレス活性化プロテインキナーゼと相互作用する」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 93 (10): 5151–5 . Bibcode :1996PNAS...93.5151R. doi : 10.1073/pnas.93.10.5151 . PMC  39423. PMID 8643544  .
• Bähler M, Kehrer I, Gordon L, Stoffler HE, Olsen AS (1997年7月). 「ラットミオシンmyr5のヒト相同遺伝子であるヒトミオシンIXB（MYO9B）の染色体19p13.1への物理的マッピング」. Genomics . 43 (1): 107–9 . doi :10.1006/geno.1997.4776. PMID  9226381.
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• 黒田 TS, 福田 正之, 有賀 浩, 御子柴 健 (2002年3月). 「シナプトタグミン様タンパク質1-4とSlac2のSlp相同ドメインは新規Rab27A結合ドメインとして機能する」. The Journal of Biological Chemistry . 277 (11): 9212–8 . doi : 10.1074/jbc.M112414200 . PMID  11773082.
• Hattula K, Furuhjelm J, Arffman A, Peränen J (2002年9月). 「Rab8特異的GDP/GTP交換因子はアクチンリモデリングと分極膜輸送に関与する」. Molecular Biology of the Cell . 13 (9): 3268–80 . doi :10.1091/mbc.E02-03-0143. PMC 124888.  PMID 12221131  .
• 福田 正之 (2003年4月). 「Rim1、Rim2、ラブフィリン、およびNoc2の異なるRab結合特異性。Rim2によるRab3A/Rab27A認識の重要な決定因子の同定」. The Journal of Biological Chemistry . 278 (17): 15373–80 . doi : 10.1074/jbc.M212341200 . PMID  12578829.
• Lau AS, Mruk DD (2003年4月). 「精巣におけるRab8B GTPaseと結合ダイナミクス」.内分泌学. 144 (4): 1549–63 . doi :10.1210/en.2002-220893. PMID  12639940.
• リンダー MD、ウロネン RL、ヘルッタ＝ヴオリ M、ファン デル スルイス P、ペレーネン J、イコネン E (2007 年 1 月)。 「Rab8依存性リサイクリングは、正常細胞およびスフィンゴリピドーシス細胞におけるエンドソームコレステロール除去を促進する。」細胞の分子生物学。18 (1): 47–56 .土井:10.1091/mbc.E06-07-0575。PMC  1751315。PMID  17050734。