RBMX

RBMX
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2MB0、2MKS​​
識別子
エイリアス	RBMX、HNRNPG、HNRPG、RBMXP1、RBMXRT、RNMX、hnRNP-G、MRXS11、RNA結合モチーフタンパク質、X連鎖、RNA結合モチーフタンパク質X連鎖
外部ID	オミム: 300199 ; MGI : 1343044 ;ホモロジーン: 20494 ;ジーンカード：RBMX ; OMA : RBMX - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト X染色体（ヒト）[ 1 ] バンド Xq26.3 始める 136,848,004 bp [ 1 ] 終わり 1億3688万764塩基対[ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト X染色体（マウス）[ 2 ] バンド X|X A6 始める 56,428,890 bp [ 2 ] 終わり 56,438,396 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 心室帯 神経節隆起 左卵巣 アキレス腱 右卵巣 子宮頸管 平滑筋組織 子宮体部 回腸粘膜 直腸 上位の表現 球形嚢 性器結節 吻側回遊流 心室帯 神経節隆起 胚の尾 耳小胞 耳板 網膜の神経層 嗅球 より多くの参照表現データ バイオGPS 該当なし
遺伝子オントロジー 分子機能 タンパク質結合 核酸結合 mRNA結合 RNA結合 クロマチン結合 タンパク質ドメイン特異的結合 同一のタンパク質結合 一本鎖RNA結合 RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合 細胞成分 触媒ステップ2スプライソソーム 膜 スプライスオソーム上複合体 核質 スプライセオソーム複合体 細胞外エクソソーム 核 細胞外空間 リボ核タンパク質複合体 生物学的プロセス スプライソソームを介したmRNAスプライシング スプライソソームを介したmRNAスプライシングの正の制御 mRNA処理 RNAポリメラーゼIIによる転写 スプライソソームを介した選択的mRNAスプライシングの制御 転写、DNAテンプレート スプライソソームを介したmRNAスプライシングの負の制御 膜タンパク質細胞外ドメインのタンパク質分解 骨芽細胞の分化 インターロイキン-1に対する細胞応答 タンパク質ホモオリゴマー化 RNAスプライシング RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 RNA代謝プロセス タンパク質複合体のオリゴマー化 mRNAスプライス部位の選択 転写の正の制御、DNAテンプレート 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 27316 19655 アンサンブル ENSG00000147274 ENSMUSG00000031134 ユニプロット P38159 Q9WV02 RefSeq (mRNA) NM_001164803 NM_002139 NM_001166623 NM_011252 RefSeq（タンパク質） NP_001158275 NP_002130 NP_001160095 NP_035382 場所（UCSC） 染色体X: 136.85 – 136.88 Mb 染色体X: 56.43 – 56.44 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

異種核リボ核タンパク質Gは、ヒトではRBMX遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]}

関数

この遺伝子は、Y染色体精子形成候補遺伝子を含むRBMY遺伝子ファミリーに属する。この遺伝子は、Y染色体RBMY遺伝子の活性X染色体相同遺伝子であり、広く発現しているが、RBMY遺伝子は精子形成において男性特有の機能を発達させた。1番染色体、4番染色体、9番染色体、11番染色体、および6番染色体上に認められるこの遺伝子の擬似遺伝子は、元の遺伝子からのレトロトランスポジションによって生じたと考えられる。異なるアイソフォームをコードする選択的スプライシング転写バリアントが同定されているが、それらの生物学的性質は解明されていない。^{[ 7 ]}

相互作用

RBMXはSFRS10 ^{[ 8 ]}およびCDC5L ^{[ 9 ]}と相互作用することが示されている。

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000147274 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000031134 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Delbridge ML, Lingenfelter PA, Disteche CM, Graves JA (1999年7月). 「精子形成候補遺伝子RBMYはヒトX染色体上にホモログを持つ」. Nature Genetics . 22 (3): 223–4 . doi : 10.1038/10279 . PMID 10391206. S2CID 43301464 .  
6. Mazeyrat S, Saut N, Mattei MG, Mitchell MJ (1999年7月). 「RBMYはY染色体上で普遍的に転写されるXY同一遺伝子から進化した」. Nature Genetics . 22 (3): 224–6 . doi : 10.1038/10282 . PMID 10391207. S2CID 13071214 .  
7. 「Entrez Gene: RBMX RNA結合モチーフタンパク質、X連鎖」。
8. Hofmann Y, Wirth B (2002年8月). 「hnRNP-GはHtra2-beta1との直接的な相互作用を介して生存運動ニューロン（SMN）のエクソン7への封入を促進する」 .ヒト分子遺伝学. 11 (17): 2037–49 . doi : 10.1093/hmg/11.17.2037 . PMID 12165565 . 
9. Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (2000年12月). 「ヒトCDC5L複合体の機能解析と質量分析によるその構成タンパク質の同定」 . The EMBO Journal . 19 (23): 6569–81 . doi : 10.1093/emboj/19.23.6569 . PMC 305846. PMID 11101529 .  

さらに読む

• Le Coniat M, Soulard M, Della Valle V, Larsen CJ, Berger R (1992年3月). 「ヒト遺伝子コード異種核RNAリボ核タンパク質G (hnRNP-G) の染色体6p12への局在」. Human Genetics . 88 (5): 593–5 . doi : 10.1007/bf00219352 . PMID  1551662. S2CID  23980780 .
• Soulard M, Della Valle V, Siomi MC, Piñol-Roma S, Codogno P, Bauvy C, Bellini M, Lacroix JC, Monod G, Dreyfuss G (1993年9月). 「hnRNP G：グリコシル化RNA結合タンパク質の配列と特性解析」 . Nucleic Acids Research . 21 (18): 4210–7 . doi : 10.1093 / nar/21.18.4210 . PMC  310052. PMID  7692398 .
• ヒリアー・LD、レノン・G、ベッカー・M、ボナルド・MF、チアペリ・B、チッソー・S、ディートリッヒ・N、デュビューク・T、ファヴェッロ・A、ギッシュ・W、ホーキンス・M、ハルトマン・M、クカバ・T、レイシー・M、ル・M、ル・N、マーディス・E、ムーア・B、モリス・M、パーソンズ・J、プランゲ・C、リフキン・L、ロールフィング・T、シェレンバーグ・K、ベントソアレス M、タン F、ティエリー メグ J、トレバスキス E、アンダーウッド K、ウォルドマン P、ウォーターストン R、ウィルソン R、マーラ M (1996 年 9 月)。「280,000 個のヒト発現配列タグの生成と分析」。ゲノム研究。6 (9): 807–28 .土井: 10.1101/gr.6.9.807。PMID  8889549。
• Venables JP, Vernet C, Chew SL, Elliott DJ, Cowmeadow RB, Wu J, Cooke HJ, Artzt K, Eperon IC (1999年6月). 「T-STAR/ETOILE：精子形成に関与するRNA結合タンパク質と相互作用するSAM68の新規類似体」 . Human Molecular Genetics . 8 (6): 959–69 . doi : 10.1093/hmg/8.6.959 . PMID  10332027 .
• Venables JP, Elliott DJ, Makarova OV, Makarov EM, Cooke HJ, Eperon IC (2000年3月). 「ヒト精子形成因子と考えられるRBMYとその他のhnRNP Gタンパク質はTra2βと相互作用し、スプライシングに影響を与える」 . Human Molecular Genetics . 9 (5): 685–94 . doi : 10.1093/hmg/9.5.685 . PMID  10749975 .
• Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (2000年12月). 「ヒトCDC5L複合体の機能解析と質量分析によるその構成タンパク質の同定」 . The EMBO Journal . 19 (23): 6569–81 . doi : 10.1093/emboj/19.23.6569 . PMC  305846. PMID  11101529 .
• Lingenfelter PA, Delbridge ML, Thomas S, Hoekstra HE, Mitchell MJ, Graves JA, Disteche CM (2001年7月). 「RBMX遺伝子のプロセッシングコピーの発現と保全」. Mammalian Genome . 12 (7): 538–45 . CiteSeerX  10.1.1.721.2504 . doi : 10.1007/s00335001-0003-z . PMID  11420617. S2CID  7201204 .
• Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, Grigorieff N, Moore MJ (2002年4月). 「三次元構造解析に適したネイティブスプライセオソームの精製と特性評価」 . RNA . 8 ( 4) S1355838202021088: 426–39 . doi : 10.1017/S1355838202021088 . PMC  1370266. PMID  11991638 .
• Hofmann Y, Wirth B (2002年8月). 「hnRNP-GはHtra2-beta1との直接的な相互作用を介して生存運動ニューロン（SMN）のエクソン7への封入を促進する」 .ヒト分子遺伝学. 11 (17): 2037–49 . doi : 10.1093/hmg/11.17.2037 . PMID  12165565 .
• Angenstein F, Evans AM, Settlage RE, Moran ST, Ling SC, Klintsova AY, Shabanowitz J, Hunt DF, Greenough WT (2002年10月). 「活性化Cキナーゼの受容体は、ニューロンにおいてポリA-mRNAと会合したメッセンジャーリボ核タンパク質複合体の一部である」 . The Journal of Neuroscience . 22 (20): 8827–37 . doi : 10.1523/JNEUROSCI.22-20-08827.2002 . PMC  6757688. PMID  12388589 .
• Li J, Hawkins IC, Harvey CD, Jennings JL, Link AJ, Patton JG (2003年11月). 「SRrp86とその相互作用タンパク質による選択的スプライシングの制御」 . Molecular and Cellular Biology . 23 (21): 7437–47 . doi : 10.1128 / MCB.23.21.7437-7447.2003 . PMC  207616. PMID 14559993  .
• Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (2004年5月). 「固定化金属アフィニティークロマトグラフィーとタンデム質量分析を用いたヒトT細胞チロシンリン酸化部位の堅牢なリン酸化プロテオームプロファイリング」(PDF) .分析化学. 76 (10): 2763–72 . Bibcode : 2004AnaCh..76.2763B . doi : 10.1021/ac035352d . PMID  15144186 .
• Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004年8月). 「HeLa細胞核リン酸化タンパク質の大規模解析」 .米国科学アカデミー紀要. 101 (33): 12130–5 . Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/ pnas.0404720101 . PMC  514446. PMID  15302935 .
• Ong SE, Mittler G, Mann M (2004年11月). 「重メチルSILACによる生体内メチル化部位の同定と定量」. Nature Methods . 1 (2): 119–26 . doi : 10.1038/nmeth715 . PMID  15782174. S2CID  6654604 .