ルネッサンス・コンピューティング研究所
ルネサンス コンピューティング研究所 (RENCI)
RENCIのメインキャンパスは、ノースカロライナ州チャペルヒルのヨーロッパドライブにあります。
設立2004
研究分野
データサイエンスとサイバーインフラストラクチャ、環境科学、生物医学と健康科学
監督スタンリー・C・アハルト博士
位置ノースカロライナ州チャペルヒル
所属ノースカロライナ大学チャペルヒル校
Webサイトrenci.org

ルネッサンス・コンピューティング研究所（RENCI）は、ノースカロライナ州、ノースカロライナ大学チャペルヒル校（UNC-CH）、デューク大学、ノースカロライナ州立大学の共同研究機関として2004年に設立されました。RENCIはUNC-CH内の研究機関として組織化されており、メインキャンパスはノースカロライナ州チャペルヒルにあり、UNC-CHキャンパスから数マイルの距離にあります。RENCIは、UNC-CH、デューク大学（ダーラム）、ノースカロライナ州立大学（ローリー）にエンゲージメントセンターを置いています。

RENCIの初代所長はダニエル・A・リード氏で、現所長はスタンリー・C・アハルト氏です。RENCIは80名以上の職員を雇用しています。

ミッションステートメント

RENCIの現在の使命は、「研究による発見と実用的な革新を可能にする高度な技術を開発・展開すること」です。[1] RENCIは、学術研究者、政府の政策立案者、業界のリーダーと提携し、データサイエンスとサイバーインフラストラクチャ、環境科学、生物医学と健康科学など、いくつかの重点分野における重要な課題の解決を目指した研究開発に取り組むことで、その使命を達成しています。

歴史

RENCIは、2004年1月にダニエル・A・リード博士によって、ノースカロライナ州、ノースカロライナ大学ノースカロライナ校（UNC-CH）、ノースカロライナ州立大学、デューク大学の資金援助を受けて設立されました。[2] [3]リード博士は、国立スーパーコンピューティング応用センター（NCSA）の所長、国立科学財団（NSF）のTeraGridイニシアチブのチーフアーキテクト、大統領情報技術諮問委員会の委員を務めていました。2004年5月には、アラン・ブラテッキーがRENCIの副所長に就任しました。ブラテッキー氏は、サンディエゴ・スーパーコンピュータセンターのエグゼクティブディレクターとNSFミドルウェアイニシアチブの責任者を務めていました。

RENCI の当初のミッション ステートメントは次のとおりです。

学術、商業、社会をつなぐ学際的な研究所として、人間の可能性を豊かにし、力を与え、複数の機関のパートナーシップを構築し、世界をリードする計算インフラストラクチャを開発および展開すること。

2005年12月、RENCIはノースカロライナ州から2005～2006年度の資金として590万ドル、および「職員支援、コンピュータ運用、設備」のための経常資金として1,180万ドルを受け取りました。この資金は、RENCIにとって極めて重要でした。RENCIは州全体にわたるインフラを構築し、仮想組織を構築し、そのインフラとRENCI職員の専門知識を活用して、州が関心を持つ連邦政府資金によるプロジェクトに参画することができました。RENCIは当初、サイバー技術と高度な分析技術を沿岸災害の計画、軽減、対応に適用することに注力していました。RENCIはその後、ノースカロライナ州内および全米各地で多様なパートナーシップを構築してきました。これらのパートナーシップは、数々の連邦政府助成金の獲得につながり、組織に新たな収入源をもたらしました。

RENCIは2007年にリーダーシップの交代を迎え、リード博士が退任し、ブラテッキー氏が暫定所長に就任しました。この時期にRENCIは初の戦略計画プロセスを実施し、その結果、ミッションステートメントが改訂されました。

ルネッサンス コンピューティング研究所は、複数の機関から構成され、多分野にわたる専門家と高度な技術力を結集して、緊急の研究課題に取り組み、ノースカロライナ州、米国、そして世界の生活の質に影響を与える複雑な問題の解決策を見つけています。

2009年、スタンリー・C・アハルト博士が所長に任命されました。アハルト博士は以前、オハイオ・スーパーコンピュータセンター（OSC）のエグゼクティブディレクターを務め、オハイオ州立大学（OSU）の電気・コンピュータ工学部の教授でもありました。RENCI着任に伴い、アハルト博士はノースカロライナ大学チャペルヒル校（UNC-CH）のコンピュータサイエンス学部の教授も兼任しました。

アショク・クリシュナムルシー博士は、2013 年 2 月に副所長に任命されました。クリシュナムルシー博士は、以前は OSC の研究および科学開発担当ディレクターであり、OSU のコンピューターおよび電気工学部の准教授でした。

アハルト博士とクリシュナムルシー博士のリーダーシップの下、RENCIはスタッフ数、外部パートナー、そして活動の幅を拡大しました。いくつかの重要なパートナーシップとイニシアチブが立ち上げられました。その第一弾は、国立衛生研究所（NIH）のトランスレーショナル・クリニカル・サイエンス・センターの助成金を活用したノースカロライナ大学ノースカロライナ校（UNC-CH）医学部との提携です。この提携は、2008年にノースカロライナ・トランスレーショナル・クリニカル・サイエンス研究所（NC TraCS）の設立につながりました。アハルト博士とクリシュナムルシー博士は、NC TraCS内のバイオメディカル・インフォマティクス・サービスのディレクターと共同ディレクターを務めています。 2つ目の重要な活動は、2012年9月にRENCIと国立社会環境統合センター（SESYNC）が共同で設立した水科学ソフトウェア研究所（WSSI）です。3つ目の重要な活動は、2013年2月に国立データサイエンスコンソーシアム（NCDS）を設立したことです。NCDSはRENCIに本部を置き、学術界、産業界、政府機関からのメンバーで構成されています。4つ目の重要な活動は、2013年3月にiRODSコンソーシアムを設立したことです。iRODSコンソーシアムもRENCIに本部を置き、多様な国際的メンバーで構成されています。

現在のリーダーシップ

  • アショク・クリシュナムルティ監督
  • レベッカ・ボイルズ副所長
  • ブライアン・ブラントン、地球データサイエンス担当ディレクター
  • iRODSコンソーシアムのデータ管理ディレクター兼エグゼクティブディレクター、テレル・ラッセル氏
  • 高性能コンピューティング担当ディレクター、ロブ・ファウラー
  • DevOpsディレクター、レイ・アイダザック氏
  • 沿岸モデルの主任ドメイン科学者、リック・ルーティッチ
  • カーク・C・ウィルヘルムセン、ゲノミクスの主任ドメイン科学者、生物医学研究イニシアチブのディレクター

主要な研究開発の重点分野と技術

データサイエンスとサイバーインフラストラクチャ

RENCI では、高度なコンピューティングおよびネットワーク機能の開発と展開を目的とした、数多くのアクティブな研究プログラムが実施されています。その結果得られる技術の多くはオープンソースです。たとえば、オープンソースのExoGENI (Exo-Global Environment for Network Innovation) は、NSF が資金提供する GENI イニシアティブの一環として開発されています。[4] [5] ExoGENI は、ネットワーク、ストレージ、およびコンピューティング リソースの動的なプロビジョニングを行う、クラウドベースの連合型 Networked Infrastructure-as-a-Service (NIaaS) プラットフォームとして機能します。同じく NSF が資金提供するADAMANT (Adaptive Data-Aware Multi-domain Application Network Topologies) は、ExoGENI を基盤としています。ADAMANT は、Pegasus (ワークフロー管理)と HT Condor科学ワークフロー システムをExoGENI NIaaS プラットフォームに統合し、分散クラウドまたは従来の高性能コンピューティング リソース上で大規模な科学ワークフローの実行を調整します。iRODS（統合ルール指向データシステム）は、UNC-CHとカリフォルニア大学サンディエゴ校のData Intensive Cyber​​ Environments（DICE）センターによって開発され、現在はRENCIによって保守されています。iRODSは、地理的に離れた場所、異種のストレージ技術、およびデータアクセスと使用に関するさまざまなポリシーを持つ複数のユーザーグループ間で、データアクセス、移動、使用、アーカイブをポリシーベースで制御できるように設計されたオープンソースのミドルウェア技術です。[6] [7] [8] [9] RADII（リソース認識型データ中心の共同インフラストラクチャ、Web引用）は、GENIのORCA（オープンリソース制御アーキテクチャ）とiRODSを統合して、複数機関のデータ駆動型研究コラボレーションのための分散型クラウドベースのインフラストラクチャを動的にプロビジョニングします。RADIIは、研究データをモデル化し、データ要素、計算、およびストレージをiRODSの基​​盤となる物理インフラストラクチャにマッピングするように設計されたソフトウェアを通じてこれを実現します。DataBridgeは、ロングテールデータコレクションを共有するための多次元社会測定ネットワークシステムを提供することを目指しています。[10] [11] [12] DataBridgeは、科学者が利用可能なデータセットと関連するアルゴリズムを探索し、社会測定ネットワーク内のさまざまなデータセットにリンクしてアクセスするためのセマンティックブリッジを定義できるようにするオープンソースのコラボレーションツールです。

環境科学

RENCIの環境科学分野のプロジェクトの多くは、水文学、沿岸高潮、および災害対策を支援する高度なモデリングに重点を置いています。ADCIRCは、複数のデータソースとタイプ（水文学データセット、大気データセット、熱帯低気圧予測データ、地理情報システムデータなど）に高度な分析を適用し、ハリケーンや関連事象後の沿岸高潮と洪水の影響をリアルタイムで高解像度で予測できるようにするオープンソースソフトウェアモデルです。[13] [14] ADCIRCは、UNC沿岸レジリエンスセンターと国立ハリケーンセンターの研究者と共同で、州および連邦の災害計画と意思決定支援を支援する沿岸予測システムとして開発されています。EarthCubeは、NSFが資金提供するイニシアチブで、「今後10年間で、太陽から地球の中心までの地球システムを研究者が理解し予測するのを支援するためのフレームワークを開発する」ことを目的としています。[15] [16] EarthCubeは、海洋科学、極地研究、大気科学、地理空間、コンピュータサイエンスなどの分野を含む地球科学全体でコミュニティ主導のデータ共有を可能にするオープンで動的なサイバーインフラストラクチャとして設計されています。HydroShareは、NSFが資金提供するCUAHSI（水文学科学振興のための大学コンソーシアム）によってサポートされており、水文学のためのオープンコラボレーションサイバーインフラストラクチャとして開発されています。[17] [18] [19] HydroShareを使用すると、水科学者は水関連のデータセットと関連するアルゴリズムとモデルを識別して取得し、グリッドベースのクラウドと高性能コンピューティングおよびストレージ機能を含む分散コンピューティング環境を使用してデータを分析および計算できます。

生物医学と健康科学

RENCIの生物医学・健康科学分野における主要な研究対象は、臨床ゲノミクスです。RENCIは、NC TraCS、UNC-CHのLineberger Comprehensive Cancer Center、そしてUNCの情報技術サービス研究コンピューティング部門と連携し、全ゲノムシーケンシング（WGS）や全エクソームシーケンシング（WES）といった次世代ゲノムシーケンシング技術を支える技術の開発・実装に取り​​組んでいます。これらの技術には、 NIHの資金援助を受け、WGSおよびWESデータのエンドツーエンドのキャプチャ、分析、検証、レポート作成を可能にするGMW（Genetic Medical Workflow）エンジンが含まれています。GMWエンジンは、ワークフロー、サブワークフロー、サンプル、データ、そして人員を連携させるオープンソースアーキテクチャとして設計されており、患者の初回診察から医師によるゲノム検査結果の報告まで、ゲノミクス研究と臨床応用のあらゆる側面をサポートします。[20] MapSeq (Masively Parallel Sequencing) はオープンソースのプラグインベースのサービス指向アーキテクチャ (SOA) であり、高スループットのゲノムシーケンスやその他のデータ集約型アプリケーションに必要な複雑な下流の計算および分析ステップの安全な管理と実行を提供します。[21] MaPSeq とその自社開発の姉妹技術である GATE (Grid Access Triage Engine) は Apache Karaf 上に構築されており、ワークフローパイプラインの実行と管理、ワークフロージョブのメタスケジューリング、コンピューティングリソースの適切な使用、安全なデータ転送、Web ベースのクライアントアクセスなど、ゲノムデータやその他の大規模データセットの下流分析のための拡張可能な機能を提供します。CANVAS (CAroliNa Variant Annotation Store) とAnnoBot (Annotation Bot) は連携して、ゲノム変異データのバージョン管理された注釈とメタデータを提供し、ゲノム変異の最新の臨床解釈をサポートし、それによって臨床意思決定を導きます。[22] CANVASは、ゲノム変異データと関連するアノテーションおよびメタデータを格納するオープンソースのPostgreSQLリレーショナルデータベースとして設計されています。AnnoBotは、アノテーション更新のための外部データソースの自動監視および取得を提供するように構成されたPythonモジュールとソフトウェアドライバコードで構成されています。CHAT（Convergent Haplotype Association Tagging）は、集団間の遺伝子構造を用いて中程度の浸透度を持つゲノム変異の識別を可能にするソフトウェアアルゴリズムです。CHATはグラフ理論に基づくアルゴリズムを用いて、血縁関係のない個体の集団のハプロタイプフェーズを決定します。具体的には、系統的にゲノム領域を共有する個体のサブセットを識別し、共有領域に対してコンセンサスハプロタイプを生成します。[ 23] SMW（セキュアメディカルワークスペース）は、臨床ケアまたは機関審査委員会が承認した臨床研究のための機密性の高い患者データにアクセスするための安全な環境を提供します。[24] [25]オープンソースのSMWアーキテクチャは、仮想化テクノロジー（VMWareなど）とデータ漏洩防止（DLP）テクノロジー（WebSenseなど）を使用して、中央の安全なストレージ環境からデータが物理的に削除されるのを防ぐ（または情報技術スタッフによるチャレンジと監査によって許可する）機能と組み合わせた安全な仮想ワークスペースを作成します。

研究所とコンソーシアム

RENCI は、国立研究所である WSSI と、2 つの主要コンソーシアムである iRODS コンソーシアムと NCDS の設立を先導しました。

WSSI

NSFの資金提供を受けたWSSIは、RENCIとSESYNCの共同事業として2012年9月に設立されました。WSSIの使命は、「水科学コミュニティのソフトウェア文化と研究文化の両方を同時に変革することにより、変革をもたらす新たな水科学を可能にし、加速すること」です。[26] [27] WSSIは、本格稼働後、オープン・コミュニティ・エンゲージメント・モデルの下で運営することを目指しています。このモデルは、NSFが資金提供する複数のイニシアチブ（統合センター、環境観測所、ソフトウェア持続可能性研究所など）を統合し、データ、アイデア、理論、手法を抽出し、従来の専門分野では解決できない水科学の課題に対処するための統合情報を提供します。WSSIの活動は、変革をもたらす水科学研究を加速するために、オープン・コミュニティの開発とオープンソースおよびアジャイル・ソフトウェア開発の促進に重点を置いています。 RENCI と SESYNC に加えて、現在のメンバーには、UNC-CH の環境研究所、イリノイ大学アーバナ・シャンペーン校、ミシガン大学、メリーランド大学、NCSA、RedHat、アメリカ海洋大気庁、IBM が含まれます。

NCDS

NCDSは、2013年2月にRENCIによって設立されました。データサイエンスの推進に尽力する一流大学、政府機関、非営利団体、そして企業による官民パートナーシップです。NCDSはデータサイエンスを「発見の加速、重要な意思決定プロセスの改善、そしてデータ駆動型経済の実現を目的とした、デジタルデータの組織化と活用に関する体系的な研究」と定義しています。[28] NCDSの使命は、「データサイエンスの研究、教育、そして経済的機会の推進に必要な基盤を提供すること」です。NCDSは、知的リーダーシップを発揮し、数多くのワークショップ、産学連携教員フェローシップ、データ・マターズ・サマー・ショートコース・シリーズ、学生向けキャリアイベント、招待講演、サミット会議などを開催することで、この使命の達成に取り組んでいます。さらに、NCDSはデータ共有とコンピューティングのための共有フェデレーション・インフラストラクチャを提供するデータ・オブザーバトリーを後援しています。NCDSはまた、Datapalooza、Triangle Open Data Day、Pearl Hacks、Data4Decisions、Analytics Forward UnConferenceなど、データサイエンスにおける数多くの地域的な取り組みとも提携しています。 2015 年 6 月現在、NCDS は 15 の会員組織で構成されており、そのうち 8 組織はノースカロライナ州に拠点を置き、4 組織はノースカロライナ州のリサーチ トライアングル パーク地域に強力な拠点を持つ多国籍企業です。

iRODSコンソーシアム

iRODSコンソーシアムは2013年3月にRENCIによって設立され、iRODS開発チームの本部もRENCIにあります。コンソーシアムの使命は、「統合ルール指向データシステム（iRODS）の持続可能性を確保し、その普及と継続的な進化を促進すること」です。[29]この使命を達成するため、コンソーシアムはオープンソースのiRODS技術とその将来の開発のための標準規格の策定、技術の進歩の促進、そしてユーザーベースの拡大に取り組んでいます。また、コンソーシアムは、ミッションクリティカルな実稼働レベルのiRODS（現在バージョン4.1）の開発も支援しています。iRODSコンソーシアムには、世界中の多様なiRODSユーザー組織が参加しています。現在のコンソーシアムのメンバーには、RENCI、UNC-CH およびカリフォルニア大学サンディエゴ校の DICE センター、DataDirect Networks、Seagate Technology、Wellcome Trust Sanger Institute、EMC Corporation (EMC2)、IBM、NASA の大気科学データセンターが含まれます。

参考文献

  1. ^ RENCI ウェブサイト、renci.org。
  2. ^ ノースカロライナ大学チャペルヒル校 (2004-2010) 年次財務報告書。ノースカロライナ州チャペルヒル：ノースカロライナ大学チャペルヒル校。http://research.unc.edu/offices/vice-chancellor/about/annual-reports から入手可能。
  3. ^ ノースカロライナ大学チャペルヒル校 (2011-2014) 包括的年次財務報告書。ノースカロライナ州チャペルヒル：ノースカロライナ大学チャペルヒル校。http://finance.unc.edu/reports-and-data/financial-statements-archive から入手可能。
  4. ^ Baldin, I., Ruth, P., Xin, Y., Mandal, A., Chase, J., Tilson, J., & Prasad. S. (2013). 未来のインターネットのビジョン：ExoGENIの事例. RENCI/NCDS, ノースカロライナ大学チャペルヒル校, ノースカロライナ州チャペルヒル, 米国. doi :10.7921/G0CC0XM1.
  5. ^ Baldin, I., Xin, Y., Mandal, A., Ruth, P., Heerman, C., & Chase, J. (2012). ExoGENI: マルチドメインのIaaS（Infrastructure-as-a-Service）テストベッド. ネットワークとコミュニティの開発のためのテストベッドと研究インフラストラクチャに関する第8回国際ICST会議（TridentCom）議事録. https://www.cs.duke.edu/~chase/exogeni.pdf から入手可能.
  6. ^ Rajasekar, A.; Moore, R.; Hou, C.; Lee, CA; Marciano, R.; de Torcy, A.; Wan, M.; Schroeder, W.; Chen, S.; Gilbert, L.; Tooby, P.; Zhu, B. (2010a). 「iRODS入門：統合ルール指向データシステム」.情報概念、検索、およびサービスに関する統合講義. 2 (1): 1– 143. doi :10.2200/s00233ed1v01y200912icr012.
  7. ^ Rajasekar, A., Moore, R., Wan, M., Schroeder, W., Hasan, A. (2010b). 大規模データ共有におけるポリシーとしてのルールの適用．インテリジェントシステム、モデリング、シミュレーション (ISMS)，2010 International Conference on Intelligent Systems, Modelling and Simulation．https://ieeexplore.ieee.org/xpls/abs_all.jsp?arnumber=5416072 から入手可能．
  8. ^ Schmitt, C., Wilhelmsen, K., Krishnamurthy, A., Ahalt, S. & Fecho, K. (2013b). ビッグデータ時代のセキュリティとプライバシー：セキュリティとプライバシーに関するポリシーと手順の実装という課題に対する技術的ソリューション、iRODS. RENCI、ノースカロライナ大学チャペルヒル校。入手先：http://www.renci.org/wp-content/uploads/2014/02/0313WhitePaper-iRODS.pdf.
  9. ^ Fortner, B., Ahalt, S., Coposky, J., Fecho, K., Krishnamurthy, A., Moore, R., Rajasekar, A., Schmitt, C., & Schroeder, W. (2014). 「データをコントロール：統合ルール指向データシステム iRODS」RENCI, ノースカロライナ大学チャペルヒル校. 入手先：http://renci.org/wp-content/uploads/2014/07/0214WhitePaper-iRODS-2-FINAL-v6.pdf.
  10. ^ Rajasekar, A., Kum, H., Crosas, M., Crabtree, J., Sankaran, S., Lander, H., Carsey, T., King, G., & Zhan, J. (2013a). The DataBridge. Science Journal, ASE. 入手先: http://databridge.web.unc.edu/files/2013/01/DataBridge_Journal_Final.pdf.
  11. ^ Rajasekar, A., Sankaran, S., Lander, H., Carsey, T., Crabtree, J., Kum, H., Crosas, M., King, G., & Zhan, J. (2013b). ロングテール科学データの関連性分析のための社会測定学的手法．ASE/IEEE 国際ビッグデータ会議．http://databridge.web.unc.edu/files/2013/01/Databridge-ConferenceVersion-final.pdf から入手可能．
  12. ^ Crabtree, J. (2013). DataBridge: 多様なデータセットを社会測定ネットワークにリンクするためのeサイエンスコラボレーション環境ツールの構築. IASSIST 2013. 入手先: http://databridge.web.unc.edu/files/2013/07/IASSIST2013DataBridgeFinal.ppt.
  13. ^ Luettich, RA, Westerink, JJ, & Scheffner, NW (1992). ADCIRC: 棚・海岸・河口域における先進的な3次元循環モデル、第1報：ADCIRC-2DDIおよびADCIRC-3DLの理論と手法。浚渫研究プログラム技術報告書 DRP-92-6。米国陸軍水路実験ステーション、ミシシッピ州ビックスバーグ。http://www.dtic.mil/dtic/tr/fulltext/u2/a261608.pdf から入手可能。
  14. ^ Westerink, J.; Luettich, R.; Feyen, J.; Atkinson, J.; Dawson, C.; Roberts, H.; Powell, M.; Dunion, J.; Kubatko, E.; Pourtaheri, H. (2008). 「流域規模から海峡規模の非構造化グリッドハリケーン高潮モデルのルイジアナ南部への適用」. Monthly Weather Review . 136 (3): 833– 864. Bibcode :2008MWRv..136..833W. doi : 10.1175/2007MWR1946.1 .
  15. ^ Caron, B. (2011). EarthCubeガバナンス・ホワイトペーパー：コミュニティ構築と民主的ガバナンスへのEarthCube投資による期待収益の実現. New Media Research Institute, サンタバーバラ, カリフォルニア州. 入手先：http://semanticommunity.info/@api/deki/files/13792/=004_Caron.pdf.
  16. ^ Gil, Y. , Chan, M., Gomez, B., & Caron, B. (2014). EarthCube: 過去、現在、そして未来. EarthCubeプロジェクトレポート. EC, 3. 入手先: http://earthcube.org/file/3616/download?token=bVernkf4.
  17. ^ Tarboton, DG, Idaszak, R., Horsburgh, JS, Heard, J., Ames, D., Goodall, JL, Band, LE, Merwade, V., Couch, A., Arrigo, J., Hooper, R., Valentine, D., & Maidment, D. (2014a). 水文データとモデルの共有を通じたコラボレーションを促進するリソース中心のアプローチ．第11回国際水情報学会議（HIC）2014，米国ニューヨーク市．http://www.hic2014.org/proceedings/bitstream/handle/123456789/1539/1566.pdf?sequence=1&isAllowed=y から入手可能．
  18. ^ Tarboton, DG, Idaszak, R., Horsburgh, JS, Heard, J., Ames, D., Goodall, JL, Band, LE, Merwade, V., Couch, A., Arrigo, J., Hooper, R., Valentine, D., & Maidment, D. (2014b). HydroShare: 水文データとモデル共有によるコラボレーションの促進. DP Ames, NWT Quinn, AE Rizzoli (編), Proceedings of the 7th International Congress on Environmental Modelling and Software. サンディエゴ, カリフォルニア州: 国際環境モデリング・ソフトウェア協会 (iEMSs). ISBN 978-88-9035-744-2. http://www.iemss.org/sites/iemss2014/papers/iemss2014_submission_243.pdf.
  19. ^ Heard, J., Tarboton, D., Idaszak, R., Horsburgh, J., Ames, D., Bedig, A., Castronova, AM, Couch, A., Dash, P., Frisby, C., Gan, T., Goodall, J., Jackson, S., Livingston, S., Maidment, D., Martin, N., Miles, B., Mills, S., Sadler, J., Valentine, D., & Zhao, L. (2014). 次世代水文情報システム「Hydroshare」のアーキテクチャ概要．第11回国際水文情報学会議（HIC 2014），ニューヨーク市，米国．入手先：http://www.hic2014.org/proceedings/bitstream/handle/123456789/1536/1562.pdf?sequence=1&isAllowed=y.
  20. ^ Owen, P., Ahalt, S., Berg, J., Coyle, J., Evans, J., Fecho, K., Gillis, D., Schmitt, C., Young, D. & Wilhelmsen, K. (2014): ゲノム医療のための技術：遺伝子医療ワークフローエンジンGMW. RENCI, ノースカロライナ大学チャペルヒル校. doi :10.7921/G0KW5CXC. 入手先：http://renci.org/technical-reports/tr-14-02-the-gmw-a-genetic-medical-workflow-engine.
  21. ^ Reilly, J., Ahalt, S., Fecho, K., Jones, C., McGee, J., Roach, J., Schmitt, C., & Wilhelmsen, K. (2014). ゲノム医療のための技術：MaPSeq：下流ゲノムシーケンシングのための計算・解析ワークフローマネージャー. RENCI, ノースカロライナ大学チャペルヒル校. doi :10.7921/G0VD6WCF. 入手先：http://renci.org/technical-reports/mapseq-computational-and-analytical-workflow-manager.
  22. ^ Bizon, C., Ahalt, S., Fecho, K., Nassar, N., Schmitt, C., Scott, E., & Wilhelmsen, K. (2014). ゲノム医療のための技術：CANVASとAnnoBot、ゲノムバリアントアノテーションソリューション. RENCI, ノースカロライナ大学チャペルヒル校. doi :10.7921/G0QN64N3. 入手先：http://renci.org/technical-reports/tr-14-04-canvas-and-annobot-solutions-for-genomic-variant-annotation.
  23. ^ Webb, AE (2011). 連鎖解析、関連解析、ハプロタイプ解析：複雑なヒト形質の遺伝的影響を解明するための多様なアプローチ（博士論文）. UNC電子学位論文コレクションより取得. (cdm 3992)
  24. ^ Schmitt, C., Shoffner, M., Owen P., Wang, X., Lamm, B., Mostafa, J., Barker, M., Krishnamurthy, A., Wilhelmsen, K., Ahalt, S., & Fecho, K. (2013a). ビッグデータ時代のセキュリティとプライバシー：データ漏洩の課題に対する技術的ソリューション、SMW. RENCI、ノースカロライナ大学チャペルヒル校。入手先：http://www.renci.org/wp-content/uploads/2014/02/0213WhitePaper-SMW.pdf.
  25. ^ Shoffner, M.; Owens, P.; Mostafa, J.; Lamm, B.; Wang, X.; Schmitt, CP; Ahalt, SP (2014). 「安全な医療研究ワークスペース：臨床データに基づく安全な研究を可能にするITインフラストラクチャ」. Clinical and Translational Science . 6 (3): 222– 225. doi :10.1111/cts.12060. PMC 3682797. PMID  23751029 . 
  26. ^ Ahalt, S.; Minsker, B .; Tiemann, M.; Band, L.; Palmer, M.; Idaszak, R.; Lenhardt, C.; Whitton, M. (2013). 「Water Science Software Institute：オープンソースエンゲージメントプロセス」.第5回計算科学・工学のためのソフトウェアエンジニアリングに関する国際ワークショップ議事録. pp.  40– 47. doi :10.1109/SECSE.2013.6615098.
  27. ^ Lenhardt, WC, Ahalt, S., Jones, M., Aukema, J., Hampton, S., Idaszak, R., Rebich-Hespanh, S., & Schildhauer, M. (2014). ISEES-WSSI による持続可能な科学ソフトウェアのための教訓：若手キャリア研修機関によるオープンサイエンス統合に関する考察. figshare. 入手先：http://files.figshare.com/1796332/ISEES_WSSI_TrainingInst_REV_20141115.pdf.
  28. ^ Ahalt, CS, Bizon, C., Evans, J., Erlich, Y., & Ginsburgh, GS, Krishnamurthy, A., Lange, L., Maltbie, D., Masys, D., Schmitt, C., Wilhelmsen, K. (2014). 「データから発見へ：ゲノムから健康へ」．全米データサイエンスコンソーシアムのホワイトペーパー．RENCI, ノースカロライナ大学チャペルヒル校（米国ノースカロライナ州チャペルヒル）。doi:10.7921/G03X84K4 で入手可能。http ://data2discovery.org/dev/wp-content/uploads/2014/02/NCDS-Summit-2013.pdf で入手可能。
  29. ^ iRODSコンソーシアム. 定款. 2014年12月1日. 参照先：http://irods.org/wp-content/uploads/2014/12/iRODS_ByLaws_V1120114.pdf.
  • 公式サイト

北緯35°56′22″ 西経79°01′08″ / 北緯35.939561° 西経79.018753° / 35.939561; -79.018753

「https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Renaissance_Computing_Institute&oldid=1323478325」より取得