ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| RFC2 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | RFC2、RFC40、複製因子Cサブユニット2 |
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| 外部ID | オミム:600404; MGI : 1341868;ホモロジーン: 6885;ジーンカード:RFC2; OMA :RFC2 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 5番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 5 G2|5 74.68 cM | 始める | 1億3461万220bp [2] |
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| 終わり | 134,630,659 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 心室帯
- 神経節隆起
- 生殖腺
- 単球
- 顆粒球
- 太ももの筋肉
- 睾丸
- 脚の皮膚
- 横行結腸粘膜
- 腹部の皮膚
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| | 上位の表現 | - 精子細胞
- 精母細胞
- 心室帯
- 精細管
- 顆粒球
- 胎児肝造血前駆細胞
- 胚
- 胚葉上層
- 腹壁
- 胚
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS | 
 | | より多くの参照表現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- ヌクレオチド結合
- DNA結合
- 一本鎖DNAヘリカーゼ活性
- タンパク質結合
- 酵素結合
- ATP結合
- DNAクランプローダー活性
| | 細胞成分 |
- DNA複製因子C複合体
- Ctf18 RFC様複合体
- 核質
- 核
| | 生物学的プロセス |
- ヌクレオチド除去修復、DNAギャップフィリング
- エラーのないトランスレジョン合成
- エラーを起こしやすいトランスレジョン合成
- DNA複製
- DNA指向性DNAポリメラーゼ活性の正の調節
- トランスレジョン合成
- 転写連動ヌクレオチド除去修復
- ヌクレオチド除去修復、DNA切断
- ヌクレオチド除去修復、DNA切断、5'-損傷
- DNA修復
- 半保存的複製によるテロメア維持
- DNA依存性DNA複製
- p53クラスメディエーターによるシグナル伝達の制御
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オーソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001278791 NM_001278792 NM_001278793 NM_002914 NM_181471 |
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| RefSeq(タンパク質) | NP_001265720 NP_001265721 NP_001265722 NP_002905 NP_852136
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NP_002905.2 |
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| 場所(UCSC) | 7章: 74.23 – 74.25 Mb | 5番目の文字: 134.61 – 134.63 MB |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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複製因子Cサブユニット2は、ヒトではRFC2遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
関数
DNAポリメラーゼδおよびεによるプライミングされたDNAテンプレートの伸長には、補助タンパク質である増殖細胞核抗原(PCNA)と複製因子C(RFC)の作用が必要である。RFCはアクチベーター1とも呼ばれ、145、40、38、37、および36.5 kDの5つの異なるサブユニットからなるタンパク質複合体である。この遺伝子は、ATP結合に関与することが示されている40 kDサブユニットをコードしている。この遺伝子の欠失はウィリアムズ症候群と関連している。異なるアイソフォームをコードする選択的スプライシング転写バリアントが報告されている。[7]
相互作用
RFC2はBRD4、[8] CHTF18、[9] [10] PCNA、[11] [12] [13] RFC4 [11] [14]およびRFC5と相互作用することが示されている。[11] [14]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000049541 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000023104 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Chen M, Pan ZQ, Hurwitz J (1992年4月). 「HeLa細胞アクチベーター1(複製因子C)の40kDaサブユニットの配列と大腸菌における発現」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 89 (7): 2516–20 . Bibcode :1992PNAS...89.2516C. doi : 10.1073/pnas.89.7.2516 . PMC 48692. PMID 1313560 .
- ^ 奥村 憲治、野上 正之、田口 秀、ディーン・FB、陳 正治、潘 哲也、ハーウィッツ 淳、白鳥 明、村上 雄志、小澤 憲治 (1995年1月). 「ヒト複製因子Cの36.5kDa (RFC5), 37kDa (RFC4), 38kDa (RFC3), 40kDa (RFC2) サブユニット遺伝子の染色体バンド12q24.2-q24.3, 3q27, 13q12.3-q13, 7q11.23への割り当て」. Genomics . 25 (1): 274–8 . doi :10.1016/0888-7543(95)80135-9. PMID 7774928.
- ^ ab 「Entrez Gene: RFC2複製因子C(活性化因子1)2、40kDa」。
- ^ Maruyama T, Farina A, Dey A, Cheong J, Bermudez VP, Tamura T, Sciortino S, Shuman J, Hurwitz J, Ozato K (2002年9月). 「哺乳類ブロモドメインタンパク質brd4は複製因子Cと相互作用し、S期への進行を阻害する」. Molecular and Cellular Biology . 22 (18): 6509–20 . doi :10.1128/MCB.22.18.6509-6520.2002. PMC 135621. PMID 12192049 .
- ^ Bermudez VP, Maniwa Y, Tappin I, Ozato K, Yokomori K, Hurwitz J (2003年9月). 「姉妹染色分体接着に必要な代替Ctf18-Dcc1-Ctf8-複製因子C複合体は、増殖細胞核抗原をDNAにロードする」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 100 (18): 10237–42 . Bibcode :2003PNAS..10010237B. doi : 10.1073/pnas.1434308100 . PMC 193545. PMID 12930902 .
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- ^ abc Cai J, Gibbs E, Uhlmann F, Phillips B, Yao N, O'Donnell M, Hurwitz J (1997年7月). 「ヒト複製因子C p40、p37、およびp36サブユニットからなる複合体は、DNA依存性ATPaseであり、ホロ酵素の組み立てにおける中間体である」. The Journal of Biological Chemistry . 272 (30): 18974–81 . doi : 10.1074/jbc.272.30.18974 . PMID 9228079.
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さらに読む
- Pan ZQ, Chen M, Hurwitz J (1993年1月). 「活性化因子1(複製因子C)のサブユニットは、増殖細胞における核抗原依存性DNA合成に必須の複数の機能を担う」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 90 (1): 6– 10. Bibcode : 1993PNAS...90....6P. doi : 10.1073/pnas.90.1.6 . PMC 45588. PMID 8093561 .
- Peoples R, Perez-Jurado L, Wang YK, Kaplan P, Francke U (1996年6月). 「複製因子Cサブユニット2(RFC2)遺伝子は、ウィリアムズ症候群の7q11.23欠失領域に存在する」. American Journal of Human Genetics . 58 (6): 1370–3 . PMC 1915059. PMID 8651315 .
- Uhlmann F, Cai J, Flores-Rozas H, Dean FB, Finkelstein J, O'Donnell M, Hurwitz J (1996年6月). 「ヒト複製因子Cの5つのサブユニットからのin vitro再構成」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 93 (13): 6521–6 . Bibcode :1996PNAS...93.6521U. doi : 10.1073/pnas.93.13.6521 . PMC 39056. PMID 8692848 .
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- 太田 誠、塩見 雄一、杉本 健、小布施 千恵子、釣本 剛 (2002年10月). 「ヒト細胞ライセート中の増殖細胞核抗原(PCNA)結合タンパク質を同定するためのプロテオミクスアプローチ.新規PCNA結合タンパク質としてのヒトCHL12/RFCs2-5複合体の同定」. The Journal of Biological Chemistry . 277 (43): 40362–7 . doi : 10.1074/jbc.M206194200 . PMID 12171929.
- Maruyama T, Farina A, Dey A, Cheong J, Bermudez VP, Tamura T, Sciortino S, Shuman J, Hurwitz J, Ozato K (2002年9月). 「哺乳類ブロモドメインタンパク質brd4は複製因子Cと相互作用し、S期への進行を阻害する」. Molecular and Cellular Biology . 22 (18): 6509–20 . doi :10.1128/MCB.22.18.6509-6520.2002. PMC 135621. PMID 12192049 .
- Merkle CJ, Karnitz LM, Henry-Sánchez JT, Chen J (2003年8月). 「hCTF18、hCTF8、およびhDCC1のクローニングと特性解析。姉妹染色分体接着の確立に関与するサッカロミセス・セレビシエ複合体のヒトホモログ」The Journal of Biological Chemistry . 278 (32): 30051–6 . doi : 10.1074/jbc.M211591200 . PMID 12766176.
- Bermudez VP, Maniwa Y, Tappin I, Ozato K, Yokomori K, Hurwitz J (2003年9月). 「姉妹染色分体接着に必要な代替Ctf18-Dcc1-Ctf8-複製因子C複合体は、増殖細胞核抗原をDNA上にロードする」米国科学アカデミー紀要. 100 (18): 10237–42 . Bibcode :2003PNAS..10010237B. doi : 10.1073/pnas.1434308100 . PMC 193545. PMID 12930902 .