ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| RFC5 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | RFC5、RFC36、複製因子Cサブユニット5 |
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| 外部ID | オミム:600407; MGI : 1919401;ホモロジーン:6730;ジーンカード:RFC5; OMA :RFC5 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 5番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 5|5 F | 始める | 117,516,168 bp [2] |
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| 終わり | 117,527,112 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 橋
- 上前庭神経核
- 舌体
- 内淡蒼球
- 上腕二頭筋の骨格筋組織
- 内皮細胞
- 迷走神経下神経節
- ブロードマン野23
- 視床下核
- 右心室
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| | | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- ヌクレオチド結合
- DNA結合
- 一本鎖DNAヘリカーゼ活性
- タンパク質結合
- ATP結合
- 酵素結合
- DNAクランプローダー活性
| | 細胞成分 |
- DNA複製因子C複合体
- Ctf18 RFC様複合体
- 核質
- 核
| | 生物学的プロセス |
- ヌクレオチド除去修復、DNAギャップフィリング
- エラーのないトランスレジョン合成
- エラーを起こしやすいトランスレジョン合成
- DNA指向性DNAポリメラーゼ活性の正の調節
- トランスレジョン合成
- 転写連動ヌクレオチド除去修復
- ヌクレオチド除去修復、DNA切断
- ヌクレオチド除去修復、DNA切断、5'-損傷
- DNA複製
- DNA修復
- 半保存的複製によるテロメア維持
- DNA依存性DNA複製
- p53クラスメディエーターによるシグナル伝達の制御
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オーソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | NM_001130112 NM_001130113 NM_001206801 NM_007370 NM_181578
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NM_001346815 |
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| RefSeq(タンパク質) | NP_001123584 NP_001123585 NP_001193730 NP_001333744 NP_031396
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NP_853556 |
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| 場所(UCSC) | 12章: 118.01 – 118.03 MB | 5章: 117.52 – 117.53 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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複製因子Cサブユニット5は、ヒトではRFC5遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
関数
DNAポリメラーゼデルタおよびDNAポリメラーゼイプシロンによるプライミングされたDNAテンプレートの伸長には、補助タンパク質である増殖細胞核抗原(PCNA)および複製因子C(RFC)が必要である。RFCはアクチベーター1とも呼ばれ、140、40、38、37、および36 kDの5つの異なるサブユニットからなるタンパク質複合体である。この遺伝子は36 kDサブユニットをコードしている。このサブユニットはPCNAのC末端領域と相互作用することができる。38 kDaおよび40 kDaサブユニットとコア複合体を形成する。コア複合体はDNA依存性ATPase活性を有し、in vitro系においてPCNAによって刺激されることが報告されている。異なるアイソフォームをコードする選択的スプライシング転写バリアントが報告されている。[6]
相互作用
RFC5 は以下と相互作用することが示されています。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000111445 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000029363 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 奥村 憲治、野上 正之、田口 秀、ディーン・FB、陳 正治、潘 哲也、ハーウィッツ 淳、白鳥 明、村上 雄志、小澤 憲治 (1995年1月). 「ヒト複製因子Cの36.5kDa (RFC5), 37kDa (RFC4), 38kDa (RFC3), 40kDa (RFC2) サブユニット遺伝子の染色体バンド12q24.2-q24.3, 3q27, 13q12.3-q13, 7q11.23への割り当て」. Genomics . 25 (1): 274–8 . doi :10.1016/0888-7543(95)80135-9. PMID 7774928.
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さらに読む
- O'Donnell M, Onrust R, Dean FB, Chen M, Hurwitz J (1993年1月). 「複製ポリメラーゼの補助タンパク質における相同性 ― 大腸菌とヒト」. Nucleic Acids Research . 21 (1): 1– 3. doi :10.1093/nar/21.1.1. PMC 309057. PMID 8441605 .
- Uhlmann F, Cai J, Flores-Rozas H, Dean FB, Finkelstein J, O'Donnell M, Hurwitz J (1996年6月). 「ヒト複製因子Cの5つのサブユニットからのin vitro再構成」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 93 (13): 6521–6 . Bibcode :1996PNAS...93.6521U. doi : 10.1073/pnas.93.13.6521 . PMC 39056. PMID 8692848 .
- Mossi R, Jónsson ZO, Allen BL, Hardin SH, Hübscher U (1997年1月). 「複製因子Cは増殖細胞核抗原のC末端側と相互作用する」. The Journal of Biological Chemistry . 272 (3): 1769–76 . doi : 10.1074/jbc.272.3.1769 . PMID 8999859.
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- Bermudez VP, Maniwa Y, Tappin I, Ozato K, Yokomori K, Hurwitz J (2003年9月). 「姉妹染色分体接着に必要な代替Ctf18-Dcc1-Ctf8-複製因子C複合体は、増殖細胞核抗原をDNA上にロードする」米国科学アカデミー紀要. 100 (18): 10237–42 . Bibcode :2003PNAS..10010237B. doi : 10.1073/pnas.1434308100 . PMC 193545. PMID 12930902 .
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