RNA治療薬

RNA治療薬は、リボ核酸(RNA)をベースにした新しいクラスの医薬品です。 1990年代から臨床応用に向けた研究が行われており、 2010年代初頭にはがん治療で大きな成功を収めました。 [ 1 ] 2020年と2021年には、新型コロナウイルス感染症(COVID-19パンデミック)対策として、mRNAワクチンが世界中で開発されました。[ 2 ]ファイザー・ビオンテックのCOVID-19ワクチンは、医薬品規制当局に承認された最初のmRNAワクチンであり、その後、モデルナのCOVID-19ワクチンなどが続きました。

RNA治療の主なタイプは、メッセンジャーRNA(mRNA)、アンチセンスRNA(asRNA)、RNA干渉(RNAi)、RNA活性化(RNAa)、およびRNAアプタマーをベースにしたものである。4つのタイプのうち、mRNAベースの治療は細胞内でのタンパク質合成の誘発をベースにした唯一のタイプであり、ワクチン開発で特に有用である。[ 3 ]アンチセンスRNAはコーディングmRNAを補完し、mRNAがタンパク質翻訳に使用されないようにmRNAの不活性化を誘発するために使用される。[ 4 ] RNAiベースのシステムは同様のメカニズムを使用し、 mRNAの翻訳を防止および/またはmRNAを分解するために、低分子干渉RNA(siRNA)とマイクロRNA(miRNA)の両方を使用する。[ 5 ] [ 6 ]低分子活性化RNA(saRNA)は、RNAaメカニズムを介して遺伝子発現をアップレギュレーションする新しいクラスのRNA治療であり、他のRNAベースの治療と比較してユニークなメカニズムを提供する。[ 7 ]しかし、RNAアプタマーは、指向性進化によって生成された短い一本鎖RNA分子であり、さまざまな生体分子標的に高い親和性で結合し、それによってそれらの通常の生体内活性に影響を与える。[ 8 ] [ 9 ] [ 10 ]

RNAはRNAポリメラーゼによって鋳型DNAから合成され、メッセンジャーRNA (mRNA)はDNA発現とタンパク質翻訳の間の媒介分子として機能します。その独特な特性(典型的には一本鎖であることや2'-OH基を有することなど)と、様々な二次構造/三次構造をとる能力のため、コーディングRNAとノンコーディングRNAの両方が医学において注目を集めています。RNAの治療効果への可能性を探る研究が始まり、創薬とRNA治療の実現においては特有の課題が生じています。[ 11 ]

mRNA

メッセンジャーRNA(mRNA )は、遺伝子のDNA鎖の1つと相補的な一本鎖RNA分子である。[ 12 ] mRNA分子は、タンパク質を作るためにDNAコードの一部を細胞の他の部分に運ぶ。[ 13 ] DNA治療薬は、RNAに転写されるために核にアクセスする必要があり、その機能は細胞分裂中の核膜の崩壊に依存する。しかし、mRNA治療薬は細胞質に到達するとすぐに翻訳されるため、機能するために核内に入る必要はない。[ 14 ]さらに、プラスミドウイルスベクターとは異なり、mRNAはゲノムに組み込まれないため、挿入変異のリスクがなく、[ 15 ]癌ワクチン、腫瘍免疫療法、感染症予防への使用に適している。[ 16 ]

発見と開発

1953年、アルフレッド・デイ・ハーシーは、細菌がファージに感染するとすぐに、ある形態のRNAを大量に生成し、このRNAも急速に分解されると報告した。[ 17 ]しかし、mRNAの存在を明確に示したのは、1956年のエリオット・ヴォルキンとラザルス・アストラカンの研究で、大腸菌にT2バクテリオファージを感染させそれ32P含む培地に投入した。[ 18 ] [ 19 ]彼らは、大腸菌のタンパク質合成が停止し、ファージのタンパク質が合成されることを発見した。[ 20 ]その後、1961年5月、彼らの共同研究者であるシドニー・ブレナーフランソワ・ジャコブ、ジム・ワトソンmRNAを単離したと発表した。[ 21 ] [ 22しかし、1990年にジョン・A・ウォルフは、マウスの骨格筋に体外転写(IVT)mRNAまたはプラスミドDNA(pDNA)を直接注入し、注入した筋肉でコード化されたタンパク質を発現させることで、核酸コード化薬剤のアイデアを実証しました。[ 23 ] [ 24 ] [ 25 ]

IVT mRNAは細胞質に到達すると即座に翻訳されます。そのため、機能を発揮するために核内に入る必要はありません。[ 26 ]また、ゲノムに組み込まれないため、挿入変異のリスクもありません。[ 27 ]さらに、IVT mRNAは一時的に活性化し、生理的な代謝経路によって完全に分解されます。[ 28 ]これらの理由から、IVT mRNAは広範な前臨床研究が行われています。

メカニズム

標的コード配列を含む線状DNAプラスミドテンプレートを用いて、in vitro転写(IVT)を行う。その後、裸のmRNAまたはナノ粒子に複合化されたmRNAが全身または局所に送達される。その後、外因性の裸のmRNAまたは複合化されたmRNAの一部が細胞特異的なメカニズムを経る。細胞質内に到達すると、IVT mRNAはタンパク質合成機構によって翻訳される。[ 29 ] [ 30 ]

RNAセンサーとしては、Toll様受容体(TLR)とRIG-I様受容体ファミリーの2種類が同定されている。TLRは樹状細胞やマクロファージなどの細胞のエンドソーム区画に局在する。[ 31 ] RIG-I様ファミリーはパターン認識受容体(PRR)として機能している。[ 32 ]しかし、細胞センサーによるmRNAワクチンの認識過程や免疫応答のメカニズム、そしてセンサー活性化のメカニズムは未だ解明されていない。[ 30 ]

アプリケーション

がん免疫療法

1995年、ロバート・コンリーは癌胎児性抗原をコードする裸のRNAを筋肉内注射すると、抗原特異的抗体反応が誘発されることを実証した。[ 33 ]その後、特定の抗原をコードするmRNAまたは腫瘍細胞から抽出して腫瘍を持つマウスに注射した全mRNAに曝露した樹状細胞(DC)がT細胞免疫反応を誘導し、腫瘍の増殖を阻害することを実証することで、この理論は発展した。[ 34 ]その後、研究者らは、体外IVT mRNAを導入したDCに基づくワクチンを用いて、mRNAを導入したDCにアプローチし始めた。[ 35 ]一方、アルゴス・セラピューティクスは2015年に進行腎細胞癌のDCを用いた第III相臨床試験を開始したが(NCT01582672)、有効性の欠如のために中止された。[ 36 ]

さらなる応用として、IVT mRNAは生体内での樹状細胞へのin situトランスフェクション用に最適化されました。これにより、IVT mRNAの翻訳効率と安定性が向上し、mRNAにエンコードされた抗原のMHCクラスIおよびII分子への提示が強化されました。[ 37 ] [ 38 ]そして、裸のIVT mRNAをリンパ節に直接注入することが、 T細胞応答を誘導する最も効果的な方法であることがわかりました。[ 39 ]この発見に基づき、 BioNTechは、癌抗原をコードする裸のIVT mRNAを注入するヒト初の臨床試験を、メラノーマ患者を対象に開始しました(NCT01684241)。[ 40 ]

最近、 RXi Pharmaceuticals社カロリンスカ研究所は、自己送達RNA(sd-rxRNA)と養子細胞移植(ACT)療法を組み合わせた新たな癌免疫療法を発明しました。この療法では、sd-rxRNAが治療免疫細胞における免疫抑制受容体およびタンパク質の発現を抑制し、免疫細胞の腫瘍細胞破壊能力を向上させます。そして、PD -1を標的としたsd-rxRNAが、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)のメラノーマ細胞に対する抗腫瘍活性を高めるのに役立ちました。 [ 41 ] [ 42 ]このアイデアに基づき、mRNA-4157が試験され、第I相臨床試験に合格しました。[ 43 ]

細胞質核酸感知経路は癌に対する免疫応答を増強することができる。RIG -Iアゴニスト、ステムループRNA(SLR)14。マウスにおいて腫瘍の成長が有意に遅延し、生存期間が延長した。SLR14は、単剤治療よりも抗PD1抗体の抗腫瘍効果を改善した。SLR14は腫瘍微小環境中のCD11b+骨髄細胞に吸収された。免疫防御に関連する遺伝子は、CD8+ Tリンパ球NK細胞、およびCD11b+細胞の増加とともに、有意に上方制御された。SLR14は非免疫原性B16腫瘍の成長を阻害し、免疫記憶を残した。[ 44 ]

ワクチン

1993年に、インフルエンザの核タンパク質をコードするリポソーム封入IVT mRNAを用いて、ウイルス特異的T細胞を誘導するmRNAワクチンの最初の成功がマウスで報告されました。 [ 45 ]その後、IVT mRNAは合成脂質ナノ粒子と共に配合され、マウスで呼吸器合胞体ウイルス(RSV)およびインフルエンザウイルスに対する防御抗体反応を誘導しました。[ 46 ]

感染症に対するIVT mRNAベースのワクチン開発には、いくつかの種類があります。成功例の一つは、プラス鎖RNAウイルスの配列を持つ自己増幅型IVT mRNAを使用するものです。これはもともとフラビウイルス用に開発され、皮内注射で使用できました。もう一つの方法は、mRNAアジュバントとインフルエンザヘマグルチニン抗原をコードする裸のIVT mRNAのみ、またはIVT mRNAをコードするノイラミニダーゼと組み合わせて含む二成分ワクチンを注射する方法です。[ 47 ]

例えば、HIV治療では、HIVタンパク質をコードするIVT mRNAを導入した樹状細胞(DC)を用いたワクチンが開発されています。IVT mRNAをコードする組み合わせを用いた第I相および第II相臨床試験がいくつか実施されており、抗原特異的なCD8+およびCD4+ T細胞応答を誘導できることが示されています。しかしながら、臨床試験では抗ウイルス効果は観察されていません。[ 48 ] [ 49 ]

他のmRNAワクチンの一つはCOVID-19用である。重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2(SARS-CoV-2)は2019年12月に発生し、世界中に広がり、コロナウイルス感染症2019(COVID-19)と呼ばれる呼吸器疾患のパンデミックを引き起こした。[ 50 ]モダナ社が2020年から製造している モダナCOVID-19ワクチンは、膜貫通アンカーを持つSARS-CoV-2の全長の融合前安定化スパイク(S)-2P抗原をコードする脂質ナノ粒子(LNP)でカプセル化されたmRNAベースのワクチンである。[ 51 ] [ 52 ]

抗ウィルス薬

2021年、SLR14はマウスにおいてインターフェロンI型(IFN-I)依存的に下気道感染と重症化を予防することが報告されました。慢性SARS-CoV-2感染を伴う免疫不全マウスは、獲得免疫系の助けを借りずに、ほぼ殺菌効果のある自然免疫を経験しました。[ 53 ]

組織再生

メイヨークリニックマーストリヒト大学、そしてRNA治療に特化したバイオテクノロジー企業Ethris GmBHの研究者らによる2022年の研究では、BMP-2をコードする化学的に修飾されたmRNAが、雄ラットの大腿骨骨切り術において用量依存的に治癒を促進することが明らかになった。mRNA分子は非ウイルス性脂質粒子と複合体を形成し、スポンジに充填されて骨欠損部に外科的に移植された。それらは適用部位周辺に局在した。mRNA治療後に再生した骨組織は、rhBMP-2を直接投与された場合と比較して、優れた強度を示し、巨大な骨化が少ないことが示された。[ 54 ]

制限事項

mRNAは非常に大きく重い分子(10^5〜10^6 Da)であるため、mRNAを薬剤にうまく翻訳するには多くの課題があります。さらに、mRNAは不安定でヌクレアーゼにより分解されやすく、免疫系を活性化します。[ 55 ]さらに、mRNAは高い負電荷密度を持ち、細胞膜を介したmRNAの浸透を低下させます。[ 56 ]これらの理由から、適切な送達システムがなければ、mRNAは容易に分解され、送達システムなしのmRNAの半減期は約7時間しかありません。[ 57 ]ある程度の課題は化学修飾によって克服できるかもしれませんが、mRNAの送達は依然として障害となっています。mRNAの送達システムを改善するために研究されてきた方法には、マイクロインジェクション、RNAパッチ(溶解するマイクロニードルに装填されたmRNA)、遺伝子銃プロタミン凝縮、RNAアジュバント、および脂質を含むナノ粒子へのmRNAのカプセル化の使用があります。[ 55 ] [ 58 ] [ 59 ]

送達剤を用いた体外翻訳(IVT)mRNAは分解に対する耐性が向上しているが、体内での裸のmRNAの送達効率を向上させる方法についてはさらなる研究が必要である。[ 24 ]

承認されたRNA治療薬

アンチセンスRNA

アンチセンスRNAは、mRNAのコード配列と相補的な非コード一本鎖RNAである。mRNAがタンパク質に翻訳される能力を阻害する。[ 65 ]短いアンチセンスRNA転写産物は、核内でダイサー酵素の作用によって生成される。ダイサー酵素は、二本鎖RNA前駆体を21~26ヌクレオチド長のRNAに切断する。[ 4 ]

アンチセンスに基づく発見戦略、スクリーニングアッセイの理論的根拠と設計、および天然物抽出物のスクリーニングと脂肪酸縮合酵素阻害剤の発見へのそのようなアッセイの応用がある。[ 66 ]アンチセンスRNAは、癌の治療と転移の阻害、およびアンチセンス隔離用ベクターに使用されている。特にマイクロRNA(miR)15と16は、癌の診断と予防の治療を必要とする患者に使用されている。[ 67 ]アンチセンス薬は、アンチセンスRNAがmRNAとハイブリダイズして不活性化するという事実に基づいている。これらの薬はmRNAに結合して特定の遺伝子がコードするタンパク質を生成するのを阻止するRNAの短い配列である。アンチセンス薬は、肺癌、糖尿病、および主要な炎症性要素を伴う関節炎や喘息などの疾患を治療するために開発されている。[ 68 ] MLLT4アンチセンスRNA 1(MLLT4-AS1)の発現低下は、胃癌の潜在的なバイオマーカーであり、予後不良の予測因子であることを示しています。これまでに、アンチセンスRNAの抗ウイルス治療や抗癌治療、植物や微生物における関連遺伝子の発現制御への応用が検討されています。[ 69 ] [ 70 ]

非ウイルスベクター、ウイルスベクター、リポソームは、アンチセンスRNAを細胞膜を通して細胞質や核に送達するために用いられてきました。ウイルスベクターによる送達は、高いトランスフェクション効率を有するため、様々な送達システムの中で最も有利であることが分かっています。[ 71 ]しかし、アンチセンスRNAを標的部位にのみ送達することは困難です。また、アンチセンスRNAのサイズと安定性の問題により、その使用にはいくつかの制限があります。送達の問題を改善するために、化学修飾や新しいオリゴヌクレオチド設計が研究され、薬物分布、副作用、忍容性の向上が図られています。[ 72 ] [ 73 ]

RNAi

干渉RNAは、翻訳段階または翻訳後に遺伝子発現を抑制する短い非コードRNAの一種である。 [ 74 ] [ 5 ]それらの発見と、それに続く転写後遺伝子調節の重要なエフェクターとしての同定により、低分子干渉RNA(siRNA)とマイクロRNA(miRNA)は、全身性疾患の治療薬となる可能性がある。[ 74 ] [ 5 ] [ 75 ] RNAiシステムは、もともと1990年にペチュニアへの着色遺伝子の導入に関する研究をしていたJorgensenらによって発見された。[ 75 ] [ 76 ]このシステムはもともと二本鎖RNAウイルスに対する自然免疫の手段として開発されたと考えられている。[ 77 ]

siRNA

生体内でのsiRNA および miRNA 遺伝子制御のメカニズムの概略図

低分子干渉RNA(siRNA)は、RNA誘導サイレンシング複合体(RISC)に関与し、遺伝子サイレンシングを行う、19~23塩基対(3'末端に2ヌクレオチドのオーバーハングを持つ)の短い二本鎖RNAです。[ 5 ] [ 75 ]具体的には、siRNAはRISC複合体に結合し、ATP加水分解によってほどかれます。[ 75 ] [ 78 ] [ 79 ]次に、siRNAは「スライサー」酵素のガイドとして使用され、標的mRNAとの相補的な塩基対形成に基づいて、mRNAを分解します。 [ 75 ] [ 78 ] [ 79 ]治療薬として、siRNAは目や鼻を通して局所的に送達され、さまざまな疾患を治療することができます。[ 5 ]局所送達の利点は、シンプルな製剤と薬物送達、そして薬物の高い生物学的利用能です。[ 5 ]がんやその他の疾患を標的とするには、全身送達が必要です。[ 5 ] siRNAを局所に送達する際にsiRNAを標的とすることは、siRNA治療における主な課題の1つです。[ 5 ] siRNA療法を送達するために静脈注射を使用することは可能ですが、注射に使用される量が多く、総血液量の約20-30%になる必要がある場合が多いため、懸念が生じています。[ 75 ]その他の送達方法には、リポソーム包装、膜透過性ペプチドへの結合、および直接組織/臓器電気穿孔法があります。[ 75 ]さらに、外因性siRNAは体内で数日間(非分裂細胞では最大で数週間)しか持続しないことがわかっています。[ 80 ] [ 81 ] siRNAが標的に到達できれば、mRNA標的と塩基対を形成し、RISCシステムを介して分解を促進する能力を通じて、遺伝子発現を治療的に制御できる可能性がある。[ 5 ] [ 75 ]現在、siRNAベースの治療法は、加齢黄斑変性症の治療のための第I相臨床試験の段階にある。[ 75 ]siRNAは癌治療への応用も検討されています。例えば、siRNAはVEGF受容体やテロメラーゼ酵素など、腫瘍の増殖を促進するタンパク質をコードするmRNAを標的とすることができます。[ 75 ]

miRNA

マイクロRNA(miRNA)は、約19~23塩基対の短いRNAオリゴヌクレオチドで、マイクロRNA誘導サイレンシング複合体に関与しています。[ 75 ] [ 6 ]具体的には、ARGONAUTE酵素にロードされると、miRNAはmRNAと連携して翻訳を抑制し、翻訳後mRNAを不安定化させます。[ 6 ]機能的にはsiRNAに似ていますが、miRNAはmRNAサイレンシングに広範な塩基対形成を必要とせず(標的とわずか7塩基対で済む場合があります)、[ 82 ] [ 83 ]そのため、より広範囲のmRNA標的に広く影響を及ぼすことができます。[ 84 ]細胞内で、miRNAはスイッチ、チューニング、および中立的な相互作用を使用して遺伝子抑制を細かく制御します。[ 6 ]治療薬として、miRNAは生物全体の生化学的経路に影響を及ぼす可能性があります。[ 74 ]

ヒトでは400種類以上のmiRNAが同定されており、その抑制対象となる遺伝子を特定することが最初の課題となっている。[ 6 ] miRNAシードマッチングを用いたTargetScanなど、複数のデータベースが構築されている。 [ 74 ] in vitroアッセイはmiRNAの表現型への影響の判定に役立つが、 [ 74 ]遺伝子調節の複雑な性質のため、同定されたmiRNAの全てが期待通りの効果を発揮するわけではない。[ 6 ]さらに、がん原性miR-155やmiR-17-92など、いくつかのmiRNAはin vivoで腫瘍抑制因子またはがん遺伝子として作用することが分かっている。 [ 84 ]

臨床試験では、miRNAは様々な疾患のバイオマーカーとして一般的に使用されており、早期診断や疾患の進行、ステージ、遺伝的関連性を提供できる可能性があります。[ 74 ]現在、第1相および第2相試験では、がんやその他の疾患の患者を対象に、miRNA模倣体(遺伝子発現用)とmiRNA(遺伝子抑制用)を試験しています。 [ 74 ]特に、模倣miRNAは腫瘍抑制因子として働くmiRNAをがん組織に導入するために使用され、miRNA拮抗薬は発がん性miRNAを標的としてそのがん促進活性を阻害するために使用されます。[ 84 ]治療用miRNAは、患者のmiRNAレベルを過剰発現または不安定化させることが知られている一般的な治療法(がん治療など)に加えて使用されることもあります。[ 74 ]マウス研究で肺がんの腫瘍増殖を阻害する効果が実証された模倣miRNA療法の1つの例は、miR-34aです。[ 84 ] [ 85 ]

miRNAベースの治療法の懸念点の1つは、外因性miRNAが正常な体細胞内のmiRNAサイレンシング機構に影響を与え、それによって正常な細胞生化学的経路に影響を及ぼす可能性があることである。[ 84 ]しかし、生体内研究では、miRNAは標的以外の組織/臓器にはほとんど影響を与えないことが示されている。[ 85 ] [ 86 ]

低分子活性化RNA(saRNA)

低分子活性化RNA(saRNA)は、RNA活性化(RNAa)と呼ばれるプロセスを通じて標的遺伝子の転写活性化を誘導する短い二本鎖RNA分子(通常19~21ヌクレオチド長)である。[ 7 ]遺伝子発現をサイレンシングするRNA干渉(RNAi)とは異なり、saRNAはDNAのプロモーター領域を標的とし、転写機構をリクルートすることで遺伝子発現をアップレギュレーションする。[ 87 ]

RNAaのメカニズムは、RNA誘導転写活性化(RITA)複合体の形成に関与する。この複合体には、アルゴノートタンパク質(特にAgo2)、RNAヘリカーゼA(RHA)、およびその他の転写コアクチベーターが含まれており、標的プロモーターにおけるRNAポリメラーゼIIの活性化を促進する。このプロセスは、ヒストン修飾などのエピジェネティックな変化と関連しており、活発な転写を促進する。[ 87 ]

saRNAは、前臨床研究において、がんや代謝疾患など、遺伝子発現の不足によって引き起こされる疾患の治療における可能性を実証しています。例えば、saRNAはがん細胞における腫瘍抑制遺伝子の再活性化に用いられており、有望な治療法となっています。[ 88 ] さらに、saRNAは代謝調節、神経変性疾患、その他の疾患に関与する遺伝子の発現を上昇させる能力についても研究されています。[ 89 ]

臨床開発中のsaRNA治療薬の一例として、CEBPA遺伝子を標的とした肝癌治療薬MTL-CEBPAが挙げられます。MiNA Therapeutics社が開発したこの薬剤は、初期段階の臨床試験で有望な結果を示しています。[ 90 ] Ractigen Therapeutics社が開発した別のsaRNA治療薬RAG-01は、筋層非浸潤性膀胱癌(NMIBC)の治療薬として研究されており[ 91 ]、BCG非反応性患者を対象とした第I相試験で有望な早期完全奏効(CR)を示しています。[ 92 ]

saRNAはRNA治療における大きな進歩であり、RNAベースの治療の範囲を遺伝子サイレンシングに加えて遺伝子活性化まで拡大しました。[ 7 ]

RNAアプタマー

「ほうれん草」として知られるRNAアプタマーは、生体内での蛍光イメージングツールとして作成されました。[ 93 ]その蛍光活性は、 3,5-ジフルオロ-4-ヒドロキシベンジリデンイミダゾリジノン(DFHBI)への結合に基づいています。[ 93 ]

一般的に、アプタマーは一本鎖DNAまたはRNAから構成される小分子であり、通常は20〜100ヌクレオチド長、[ 8 ] [ 9 ] [ 94 ]または約3〜60 kDaです。[ 94 ] [ 95 ]一本鎖であるため、アプタマーは鎖内塩基対相互作用を介して、擬似ノット、ステムループ、バルジなど、多くの二次構造を形成できます。 [ 94 ]アプタマー中に存在する二次構造の組み合わせにより、特定の三次構造が形成され、それがアプタマーが選択的に結合する特定のターゲットを決定します。[ 94 ] [ 96 ]アプタマーは選択的結合能力があるため、医薬品に使用するための有望な生体分子と考えられています。[ 8 ] [ 9 ] [ 94 ]さらに、アプタマーは標的に強く結合し、解離定数はpMから nM の範囲であることが多い。 [ 8 ] [ 10 ]強力な結合能力に加えて、アプタマーは、ファージディスプレイや抗体によって生成された小さなペプチドが結合できない標的にも使用でき、コンフォメーション異性体とアミノ酸置換を区別できることも高く評価されている。[ 94 ] [ 97 ] [ 98 ]また、アプタマーは核酸ベースであるため、直接合成することができ、抗体産生の場合のように細胞ベースの発現と抽出の必要がない。[ 9 ] [ 99 ]特に RNA アプタマーは無数の異なる構造を生成することができるため、DNA アプタマーと比較して標的親和性においてより識別性が高いと推測されている。[ 94 ] [ 100 ]

発見と開発

アプタマーは、1990年にラリー・ゴールドとクレイグ・トゥークがSELEXと呼ばれる指向性進化法を用いて、T4バクテリオファージDNAポリメラーゼに結合できる小さな一本鎖RNA分子を単離したときに最初に発見されました。[ 9 ] [ 101 ]さらに、「アプタマー」という用語は、アンドリュー・エリントンによって造られました。彼はジャック・ショスタックと協力して、特定の有機染料分子にしっかりと結合できるRNAアプタマーを選択しました。[ 94 ] [ 102 ]この用語自体は、ラテン語の「aptus」(適合する)とギリシャ語の「meros」(部分)を組み合わせたものです。[ 94 ] [ 102 ]

RNAアプタマーは「作成される」というよりは「選択される」ものです。分子標的に選択的に結合できるRNAアプタマーを開発するために、指数関数的濃縮によるリガンドの系統的進化(SELEX)と呼ばれる方法を使用して、約10^13~10^16の異なるアプタマーのプール(ライブラリとも呼ばれます)から固有のRNAアプタマーを単離します。[ 8 ] [ 9 ] [ 94 ] [ 101 ] [ 102 ]次に、潜在的なアプタマーオリゴヌクレオチドのライブラリを非標的種とともにインキュベートして、非特異的結合を示すアプタマーを除去します。[ 8 ]その後、非特異的アプタマーを除去した後、残りのライブラリメンバーを目的のターゲット(タンパク質、ペプチド、細胞型、または臓器(生きた動物ベースのSELEXの場合))にさらします。[ 8 ] [ 94 ] [ 103 ] [ 104 ] [ 105 ] [ 106 ] [ 107 ] [ 108 ]そこから、標的に結合したRNAアプタマーはcDNAに転写され、 PCRによって増幅され、PCR産物はRNAに再転写されます。[ 94 ]これらの新しいRNA転写産物は、選択サイクルを何度も繰り返すために使用され、最終的に、高特異性、高親和性の標的結合が可能なRNAアプタマーの均質なプールが生成されます。[ 8 ]

RNAアプタマーは、アンタゴニストアゴニスト、またはいわゆる「RNAデコイアプタマー」として機能するように設計することができる。 [ 94 ] [ 109 ]アンタゴニストの場合、RNAアプタマーは、特定のタンパク質が細胞膜受容体に結合するのを防ぐか、タンパク質の標的に結合してそのタンパク質が活動するのを防ぐために使用される。[ 94 ]現在、臨床試験に進んでいるRNAアプタマーベースの治療法は、アンタゴニストとして機能するもののみである。[ 94 ] RNAアプタマーがアゴニストとして機能するように設計されている場合、共刺激分子として免疫細胞の活性化を促進し、身体自身の防御システムの動員を助ける。[ 94 ] [ 110 ] RNAデコイアプタマーの場合、合成RNAアプタマーは天然のRNA分子に似ている。[ 94 ] [ 109 ]そのため、本来のRNA標的に結合するタンパク質はRNAアプタマーに結合し、特定の疾患の生体分子経路を阻害する可能性があります。[ 94 ] [ 109 ] RNAアプタマーは、直接的な治療薬としての有用性に加えて、他の治療的役割についても検討されています。例えば、RNAアプタマーを薬物化合物に結合させることで、RNAアプタマーはその薬物の標的送達システムとして機能することができます。[ 8 ]このようなRNAアプタマーはApDCとして知られています。[ 8 ]さらに、放射性同位元素または蛍光色素分子に結合させることで、RNAアプタマーは診断画像診断に有用となる可能性があります。[ 8 ] [ 111 ] [ 112 ]

RNAアプタマーを選択するために利用されるSELEXプロセスのおかげで、多くの潜在的な標的に対してRNAアプタマーを生成することができます。SELEX中にRNAアプタマーを標的に直接導入することにより、非常に選択的で、高親和性で、均質なRNAアプタマーのプールを生成することができます。このように、RNAアプタマーは、小さなペプチドやタンパク質だけでなく、細胞断片、細胞全体、さらには特定の組織を標的とするように作製できます。[ 8 ] [ 94 ] [ 113 ] [ 114 ] [ 106 ] [ 115 ] RNAアプタマーの分子標的および潜在的な標的の例としては、血管内皮増殖因子[ 116 ]骨芽細胞[ 117 ] CXCケモカインリガンド12(CXCL2)などがあります。[ 8 ] [ 9 ] [ 118 ]

加齢黄斑変性症の治療薬として知られているペガプタニブと呼ばれるRNAアプタマーの化学構造。[ 8 ]

RNAアプタマー療法の一例として、FDA承認を受けた唯一のRNAアプタマー治療薬であるペガプタニブ(別名マクゲン®)が挙げられます。 [ 8 ] [ 9 ] [ 94 ]ペガプタニブはもともと2004年に加齢黄斑変性症の治療薬として承認されたもので、 VEGF拮抗薬として機能する28ヌクレオチドのRNAアプタマーです。[ 8 ] [ 9 ] [ 94 ]しかし、ベバシズマブラニビズマブなどの抗体ベースの治療薬ほど効果的ではありません。[ 94 ] [ 119 ] [ 120 ] RNAアプタマー治療薬のもう1つの例としては、慢性リンパ性白血病膵臓癌、およびその他の癌に対する臨床試験が行われている45ヌクレオチドのRNAアプタマーであるNOX-A12があります。 [ 9 ] NOX-A12は腫瘍の増殖に関与するケモカインであるCXCL12/SDF-1の拮抗薬として作用する。[ 9 ]

制限事項

RNAアプタマーは選択性が高く結合が強いことから医薬品としての利用に興味が集まっているが、生体内での成功を阻む問題が数多くある。 1つには、改変を加えないと、RNAアプタマーは体内に導入された後、数分以内にヌクレアーゼによって分解される。 [ 9 ] [ 94 ] [ 121 ] [ 122 ]また、RNAアプタマーはサイズが小さいため、腎臓系によって血流から除去される可能性がある。[ 9 ] [ 94 ] [ 95 ] [ 121 ] [ 122 ]さらに、RNAアプタマーは負に帯電しているため、血流中のタンパク質に結合し、標的以外の組織への送達や毒性を引き起こすことが知られている。[ 94 ] [ 123 ] [ 124 ] RNAアプタマーを単離する際には注意が必要である。シトシン-リン酸-グアニン(CpG)配列の繰り返しを含むアプタマーは、Toll様受容体経路を介して免疫系の活性化を引き起こすからである。[ 9 ] [ 125 ] [ 126 ]

RNAアプタマーの生体内限界のいくつかに対処するために、アプタマーの有効性を高めるためにヌクレオチドに様々な修飾を加えることができる。例えば、ポリエチレングリコール(PEG)部分を付加してアプタマーのサイズを大きくし、それによってアプタマーが腎糸球体によって血流から除去されるのを防ぐことができる。[ 127 ] [ 128 ]しかし、PEGは生体内試験中にアレルギー反応に関係していることが示されている。 [ 94 ] [ 129 ] [ 130 ]さらに、2'フルオロ基またはアミノ基や3'反転チミジンなどの修飾を加えてヌクレアーゼによる分解を防ぐこともできる。[ 9 ] [ 94 ] [ 131 ] [ 132 ]さらに、リボース糖がD体ではなくL体になるようにアプタマーを合成して、ヌクレアーゼによる認識をさらに防ぐこともできる。[ 8 ] [ 94 ] [ 133 ] [ 134 ]このようなアプタマーはシュピーゲルマーとして知られている。[ 8 ] [ 134 ] Toll様受容体経路の活性化を防ぐために、アプタマー内のシトシン核酸塩基をメチル化することができる。[ 9 ]しかし、生体内での有効性の低下に対するこれらの潜在的な解決策にもかかわらず、アプタマーを化学的に修飾すると、標的に対する結合親和性が弱まる可能性がある。[ 94 ] [ 135 ]

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