| ポリヌクレオチド5′-ホスファターゼ | |||||||||
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| 識別子 | |||||||||
| EC番号 | 3.1.3.33 | ||||||||
| CAS番号 | 37288-17-8 | ||||||||
| データベース | |||||||||
| インテンズ | IntEnzビュー | ||||||||
| ブレンダ | ブレンダエントリー | ||||||||
| エクスパス | NiceZymeビュー | ||||||||
| ケッグ | KEGGエントリー | ||||||||
| メタサイクル | 代謝経路 | ||||||||
| プリアモス | プロフィール | ||||||||
| PDB構造 | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| 遺伝子オントロジー | アミゴー / クイックゴー | ||||||||
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ポリヌクレオチド5′-ホスファターゼ（RNA 5′-トリホスファターゼ、RTPase、EC 3.1.3.33）は、反応 を触媒する酵素である。
- 5′-ホスホポリヌクレオチド + H 2 Oポリヌクレオチド + リン酸
この酵素は加水分解酵素ファミリーに属し、特にリン酸モノエステル結合に作用します。系統名はポリヌクレオチド5′-ホスホヒドロラーゼです。この酵素は5′-ポリヌクレオチダーゼとも呼ばれます。
唯一知られている分子の機能は、反応の触媒作用です。
- mRNAの5′末端トリホスホ（プリンリボヌクレオチド） + H 2 O = mRNAの5′末端ジホスホ（プリンリボヌクレオシド） + リン酸
RTPaseは新生メッセンジャーRNA分子の5'末端γ-βリン酸無水物結合を切断し、転写後修飾の一環として5'キャップの付加を可能にする。RTPaseは5'-三リン酸末端前駆体mRNAから5'-二リン酸末端mRNAとリン酸イオンを生成する。次にmRNAグアニリルトランスフェラーゼがGTPから逆グアノシン一リン酸（GMP）基を付加してピロリン酸を生成し、mRNA（グアニン-N7-）-メチルトランスフェラーゼがグアニンをメチル化して最終的な5'キャップ構造を形成する。[1] [2] [3] [4] [5]
これまでに知られている RTPase ファミリーは 2 つあります。
- 金属依存性ファミリー。酵母[ 4] [6] [7] 、 原生動物[4] [8] 、ウイルス[4] [8] RTPaseは活性に金属補因子を必要とし、ほとんどの場合Mg 2+またはMn 2+のいずれかである。このクラスの酵素は、Mn 2+またはCo 2+の存在下で遊離ヌクレオシド三リン酸を加水分解することもできる。[1]
- 金属非依存性ファミリー。これらのグループは活性に金属を必要とせず、一部の酵素は金属イオンの存在下で不活性化されることが示されている。これらの酵素は、構造と機構においてタンパク質チロシンホスファターゼと非常によく似ている。 [9] [10] [11] このファミリーには、哺乳類、植物、その他の高等真核生物由来のRTPaseが含まれており、[8]金属依存性RTPaseファミリーとは構造的にも機構的にも異なる。[4] [5] [7]
構造研究
2007 年末現在、このクラスの酵素については 5 つの構造が解明されており、PDBアクセス コードは 1D8H、1D8I、1I9S、1I9T、1YN9 です。
参照
参考文献
- ^ ab Gross CH, Shuman S (1998年9月). 「バキュロウイルスがコードするRNA 5′-トリホスファターゼの特性評価」. Journal of Virology . 72 (9): 7057–63 . doi : 10.1128/JVI.72.9.7057-7063.1998 . PMC 109926. PMID 9696798 .
- ^ Ho CK, Schwer B, Shuman S (1998年9月). 「酵母mRNAキャッピング装置におけるトリホスファターゼとグアニル酸転移酵素構成要素間の遺伝的、物理的、および機能的相互作用」. Molecular and Cellular Biology . 18 (9): 5189–98 . doi :10.1128/MCB.18.9.5189. PMC 109104. PMID 9710603 .
- ^ Shuman S (2000). 「mRNAキャッピング装置の構造、メカニズム、そして進化」.核酸研究と分子生物学の進歩. 66 : 1–40 . doi :10.1016/s0079-6603(00)66025-7. ISBN 9780125400664. PMID 11051760。
- ^ abcd Takagi T, Moore CR, Diehn F, Buratowski S (1997年6月). 「タンパク質チロシンホスファターゼに関連するRNA 5′-トリホスファターゼ」. Cell . 89 (6): 867–73 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)80272-X . PMID 9200605. S2CID 10484079.
- ^ ab Wen Y, Yue Z, Shatkin AJ (1998年10月). 「哺乳類キャッピング酵素はRNAに結合し、タンパク質チロシンホスファターゼのメカニズムを利用する」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 95 (21): 12226–31 . Bibcode :1998PNAS...9512226W. doi : 10.1073/pnas.95.21.12226 . PMC 22813. PMID 9770468 .
- ^ Bisaillon M, Bougie I (2003年9月). 「酵母RNAトリホスファターゼの触媒機構における金属イオンの役割の調査」. The Journal of Biological Chemistry . 278 (36): 33963–71 . doi : 10.1074/jbc.M303007200 . PMID 12819229.
- ^ ab Lima CD, Wang LK, Shuman S (1999年11月). 「酵母RNAトリホスファターゼの構造とメカニズム：mRNAキャッピング装置の必須構成要素」. Cell . 99 (5): 533–43 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)81541-X . PMID 10589681. S2CID 1785538.
- ^ ab Karpe YA, Lole KS (2010年9月). 「E型肝炎ウイルスヘリカーゼドメインのRNA 5'-トリホスファターゼ活性」. Journal of Virology . 84 (18): 9637–41 . doi :10.1128/JVI.00492-10. PMC 2937651. PMID 20592074 .
- ^ Barford D, Flint AJ, Tonks NK (1994年3月). 「ヒトタンパク質チロシンホスファターゼ1Bの結晶構造」. Science . 263 (5152): 1397–404 . Bibcode :1994Sci...263.1397B. doi :10.1126/science.8128219. PMID: 8128219.
- ^ Denu JM, Dixon JE (1998年10月). 「タンパク質チロシンホスファターゼ：触媒と制御のメカニズム」. Current Opinion in Chemical Biology . 2 (5): 633–41 . doi :10.1016/S1367-5931(98)80095-1. PMID 9818190.
- ^ Deshpande T, Takagi T, Hao L, Buratowski S, Charbonneau H (1999年6月). 「タンパク質チロシンホスファターゼスーパーファミリーに属するヒトPIR1はRNA 5'-トリホスファターゼ活性およびジホスファターゼ活性を有する」. The Journal of Biological Chemistry . 274 (23): 16590–4 . doi : 10.1074/jbc.274.23.16590 . PMID 10347225.
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