RNF38

RNF38
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1X4J、4V3K、4V3L
識別子
エイリアス	RNF38、リングフィンガータンパク質38
外部ID	オミム：612488; MGI : 1920719;ホモロジーン: 32550;ジーンカード：RNF38; OMA :RNF38 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 9番染色体（ヒト）[1] バンド 9p13.2 始める 36,336,396 bp [1] 終わり 36,487,548 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 4番染色体（マウス）[2] バンド 4|4 B1 始める 44,126,210 bp [2] 終わり 44,233,789 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 精子 二次卵母細胞 左精巣 右精巣 神経節隆起 精巣上体尾部 後腎糸球体 胚上皮 脈絡叢上皮 ブロードマン野23 上位の表現 接合子 二次卵母細胞 精細管 一次卵母細胞 大動脈弁 上行大動脈 性器結節 胚の尾 血 神経節隆起 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 金属イオン結合 ユビキチンタンパク質転移酵素活性 ユビキチンタンパク質リガーゼ活性 トランスフェラーゼ活性 細胞成分 精子鞭毛 核 核質 生物学的プロセス 男性の生殖腺の発達 タンパク質のユビキチン化 プロテアソームを介したユビキチン依存性タンパク質分解プロセス 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 152006 73469 アンサンブル ENSG00000137075 ENSMUSG00000035696 ユニプロット Q9H0F5 Q8BI21 RefSeq (mRNA) NM_022781 NM_194328 NM_194329 NM_194330 NM_194331 NM_194332 NM_001038993 NM_175201 NM_001355181 NM_001379574 NM_001379575 NM_001379576 NM_001379577 NM_001379578 NM_001379579 NM_001379580 NM_001379581 RefSeq（タンパク質） NP_073618 NP_919309 NP_919310 NP_919311 NP_919313 NP_001034082 NP_780410 NP_001342110 NP_001366503 NP_001366504 NP_001366505 NP_001366506 NP_001366507 NP_001366508 NP_001366509 NP_001366510 場所（UCSC） 9章: 36.34 – 36.49 MB 4章: 44.13 – 44.23 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
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RINGフィンガータンパク質38は、ヒトではRNF38遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]

この遺伝子は、コイルドコイルモチーフとカルボキシ末端にRING-H2モチーフ（C3H2C2）を持つタンパク質をコードしています。RINGモチーフは、がん形成、発生、シグナル伝達、アポトーシスなど、多様な細胞プロセスにおいて役割を果たす多くのタンパク質に見られる亜鉛結合ドメインです。異なるアイソフォームをコードする代替転写スプライスバリアントが特徴付けられています。^[5]

参照

• 薬指ドメイン

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000137075 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000035696 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. "Entrez Gene: RNF38 リングフィンガータンパク質 38".

さらに読む

• Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, et al. (2006). 「LIFEdbデータベース 2006」Nucleic Acids Res . 34 (データベース号): D415 – D418 . doi :10.1093/nar/gkj139. PMC  1347501 . PMID  16381901.
• 木村 功、若松 明、鈴木 雄一、他 (2006). 「転写調節の多様化：ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模同定と特性解析」Genome Res . 16 (1): 55– 65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129.  PMID 16344560  .
• Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). 「ORFeomeから生物学へ：機能ゲノミクスパイプライン」Genome Res . 14 (10B): 2136– 2144. doi :10.1101/gr.2576704. PMC  528930. PMID  15489336 .
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• Humphray SJ, Oliver K, Hunt AR, et al. (2004). 「ヒト9番染色体のDNA配列と解析」. Nature . 429 (6990): 369– 374. Bibcode :2004Natur.429..369H. doi :10.1038/nature02465. PMC  2734081. PMID 15164053  .
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• Eisenberg I, Hochner H, Levi T, et al. (2002). 「RINGフィンガードメインを有する保存された推定タンパク質をコードする新規ヒト遺伝子RNF38のクローニングと特性解析」Biochem. Biophys. Res. Commun . 294 (5): 1169– 1176. doi : 10.1016/S0006-291X(02)00584-3 . PMID  12074600.
• Xu XR, Huang J, Xu ZG, et al. (2002). 「肝細胞癌と非癌性肝疾患の遺伝子発現プロファイルの比較によるトランスクリプトームレベルでの肝細胞癌発症の洞察」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 98 (26): 15089– 15094. Bibcode :2001PNAS...9815089X. doi : 10.1073/pnas.241522398 . PMC  64988. PMID  11752456 .
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). 「ヒト遺伝子およびタンパク質のカタログ作成に向けて：新規完全タンパク質コードヒトcDNA500個の配列決定と解析」Genome Res . 11 (3): 422– 435. doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072.  PMID 11230166  .
• Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). 「in vitro部位特異的組換えを用いたDNAクローニング」Genome Res . 10 (11): 1788– 1795. doi :10.1101/gr.143000. PMC  310948. PMID  11076863 .
• Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). 「正規化と減算：遺伝子発見を促進する2つのアプローチ」Genome Res . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID  8889548.

外部リンク

• RNF38+タンパク質、+ヒト（米国国立医学図書館医学件名表題集（MeSH））