RNPS1

RNPS1
利用可能な構造
PDBオーソログ検索: PDBe RCSB
識別子
エイリアスRNPS1、E5.1、セリンリッチドメイン1を持つRNA結合タンパク質
外部IDオミム: 606447 ; MGI : 97960 ;ホモロジーン: 40648 ;ジーンカード: RNPS1 ; OMA : RNPS1 - オルソログ
オーソログ
人間ねずみ
エントレズ
アンサンブル
ユニプロット
RefSeq (mRNA)

NM_001286625 NM_001286626 NM_001286627 NM_006711 NM_080594

NM_001080127 NM_001080128 NM_009070 NM_001357626

RefSeq(タンパク質)

NP_001273554 NP_001273555 NP_001273556 NP_006702 NP_542161

NP_001073596 NP_001073597 NP_033096 NP_001344555

場所(UCSC)16章: 2.25 – 2.27 MB17章: 24.63 – 24.64 Mb
PubMed検索[ 3 ][ 4 ]
ウィキデータ
人間の表示/編集マウスの表示/編集

セリンリッチドメイン1を有するRNA結合タンパク質は、ヒトではRNPS1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]

関数

この遺伝子は、スプライシング後の多タンパク質複合体であるエクソンジャンクション複合体の一部であるタンパク質をコードしており、mRNAの核外輸送とmRNA監視の両方に関与している。mRNA監視は、短縮されたオープンリーディングフレームを持つ輸送されたmRNAを検出し、ナンセンス依存性mRNA分解(NMD)を開始する。最後のエクソン-エクソンジャンクションの上流で翻訳が終了すると、NMDが引き起こされ、未熟な終止コドンを含むmRNAが分解される。このタンパク質はmRNAに結合し、核外輸送後も結合したまま核質間輸送タンパク質として機能する。このタンパク質は多くのセリン残基を含む。この遺伝子には2つのスプライスバリアントが見つかっており、どちらのバリアントも同じタンパク質をコードしている。[ 7 ]

相互作用

RNPS1はSART3 [ 8 ]およびピニン[ 9 ]と相互作用することが示されている[ 10 ]

参考文献

  1. ^ a b c GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000205937Ensembl、2017年5月
  2. ^ a b c GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000034681Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「ヒトPubMedリファレンス:」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス:」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  5. ^ Loyer P, Trembley JH, Lahti JM, Kidd VJ (1998年6月). 「RNPタンパク質RNPS1は、生体内でp34cdc2関連PITSLREタンパク質キナーゼの特定のアイソフォームと会合する」. Journal of Cell Science . 111 (Pt 11) (11): 1495– 506. doi : 10.1242/jcs.111.11.1495 . PMID 9580558 . 
  6. ^ Badolato J, Gardiner E, Morrison N, Eisman J (1995年12月). 「新規ヒトRNA結合タンパク質の同定と特性評価」. Gene . 166 (2): 323–7 . doi : 10.1016/0378-1119(95)00571-4 . PMID 8543184 . 
  7. ^ a b「Entrez遺伝子:RNPS1 RNA結合タンパク質S1、セリンリッチドメイン」
  8. ^原田 功、山田 明、楊 大輔、伊藤 功、七条 聡 (2001年9月). 「腫瘍拒絶抗原SART3のpre-mRNAスプライシング因子RNPS1への結合:複合体形成によるスプライシング制御の可能性」. International Journal of Cancer . 93 (5): 623–8 . doi : 10.1002/ijc.1391 . PMID 11477570. S2CID 24724555 .  
  9. ^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). 「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」 .分子システム生物学. 3 (1 ) : 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948. PMID 17353931 .  
  10. ^ Li C, Lin RI, Lai MC, Ouyang P, Tarn WY (2003年10月). 「核内Pnn/DRSタンパク質はスプライスされたmRNPに結合し、RNPS1との相互作用を介してmRNAプロセシングと輸送に関与する」 . Molecular and Cellular Biology . 23 (20): 7363–76 . doi : 10.1128/MCB.23.20.7363-7376.2003 . PMC 230327. PMID 14517304 .  

さらに読む

  • PDBe-KBのUniProt : Q15287 (セリンリッチドメイン 1 を持つ RNA 結合タンパク質)のPDBで利用可能なすべての構造情報の概要。