ヒトに存在するタンパク質
| RPL8 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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4CCM、4CCN、4CCO、4UG0、4V6X、5AJ0、4D67、3J7Q、4Y3O、4UJC、3J7R、4D5Y、4UJE、4UJD、3J7P、3J7O、3J92、4V5Z |
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| 識別子 |
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| エイリアス | RPL8、L8、リボソームタンパク質L8 |
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| 外部ID | オミム:604177; MGI : 1350927;ホモロジーン:32141;ジーンカード:RPL8; OMA :RPL8 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 15番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 15|15 D3 | 始める | 76,788,278 bp [2] |
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| 終わり | 76,790,514 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 生殖腺
- 卵巣
- 左卵巣
- 気管
- 右卵巣
- 胸腺
- 横行結腸粘膜
- 心室帯
- 下垂体
- 脚の皮膚
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| | 上位の表現 | - 原始的な条線
- 毛包
- 腹壁
- 輸出管
- 膀胱の移行上皮
- 内側神経節隆起
- リンパ管の内皮細胞
- 下顎突出
- 上顎突出
- 顆頭
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS |  | | より多くの参照表現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- rRNA結合
- リボソームの構造構成要素
- RNA結合
- 5.8S rRNA結合
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- リボソーム
- 膜
- 焦点接着
- 大リボソームサブユニット
- 細胞内解剖学的構造
- 細胞質
- 細胞質大リボソームサブユニット
- シナプス後密度
- ポリソームリボソーム
- シナプス
- シナプス後部
| | 生物学的プロセス |
- 細胞質翻訳
- タンパク質生合成
- ウイルス転写
- SRP依存性共翻訳タンパク質の膜への標的化
- 翻訳開始
- 核転写されたmRNAの分解過程、ナンセンス変異による分解
- rRNA処理
- 神経成長因子刺激に対する細胞反応
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_000973 NM_033301 NM_001317771 NM_001317782 |
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| RefSeq(タンパク質) | |
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NP_000964 NP_001304700 NP_001304711 NP_150644 |
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| 場所(UCSC) | 8章: 144.79 – 144.79 Mb | 15章: 76.79 – 76.79 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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60Sリボソームタンパク質L8は、ヒトではRPL8遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
リボソームは、タンパク質合成を触媒する細胞小器官であり、小さな40Sサブユニットと大きな60Sサブユニットから構成されています。これらのサブユニットは、4種類のRNAと約80種類の構造的に異なるタンパク質で構成されています。この遺伝子は、 60Sサブユニットの構成要素であるリボソームタンパク質をコードしています。このタンパク質は、リボソームタンパク質のL2Pファミリーに属し、細胞質に局在しています。ラットでは、このタンパク質は5.8S rRNAと会合し、アミノアシルtRNAの結合に関与している可能性が高く、リボソームサブユニット界面の伸長因子2結合部位の構成要素となっています。同じタンパク質をコードする選択的スプライシング転写バリアントも存在します。リボソームタンパク質をコードする遺伝子に典型的であるように、この遺伝子の複数の処理された擬遺伝子がゲノム中に散在しています。[7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000161016 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000003970 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ ヘインズ J、クラウディニー J、フォン デア カマー H、シャイト KH (1994 年 2 月)。 「ヒトリボソームタンパク質 L8 の mRNA の cDNA クローニングによる特性評価」。Biochem Biophys Res Commun。197 (3): 1223–8 .土井:10.1006/bbrc.1993.2607。PMID 7506540。
- ^ Kenmochi N, Kawaguchi T, Rozen S, Davis E, Goodman N, Hudson TJ, Tanaka T, Page DC (1998年8月). 「ヒトリボソームタンパク質遺伝子75種の地図」. Genome Res . 8 (5): 509–23 . doi : 10.1101/gr.8.5.509 . PMID 9582194.
- ^ ab 「Entrez Gene: RPL8 リボソームタンパク質 L8」。
さらに読む
- Wool IG, Chan YL, Glück A (1996). 「哺乳類リボソームタンパク質の構造と進化」. Biochem. Cell Biol . 73 ( 11–12 ): 933–47 . doi :10.1139/o95-101. PMID 8722009.
- Uhlein M, Weglöhner W, Urlaub H, Wittmann-Liebold B (1998). 「in vivo置換試験によるリボソームタンパク質L2のタンパク質生合成における機能的意義」Biochem. J. 331 ( 2): 423–30 . doi :10.1042/bj3310423. PMC 1219371. PMID 9531480 .
- Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, et al. (2002). 「ヒト核小体の指向性プロテオーム解析」. Curr. Biol . 12 (1): 1– 11. Bibcode :2002CBio...12....1A. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID 11790298. S2CID 14132033.
- 吉浜 正之、上地 剛志、浅川 聡、他 (2002). 「ヒトリボソームタンパク質遺伝子:73遺伝子の配列決定と比較解析」Genome Res . 12 (3): 379–90 . doi :10.1101/gr.214202. PMC 155282. PMID 11875025 .
- Brezillon S, Lannoy V, Franssen JD, et al. (2003). 「オーファンGタンパク質共役受容体GPR7およびGPR8に対する天然リガンドの同定」J. Biol. Chem . 278 (2): 776– 83. doi : 10.1074/jbc.M206396200 . PMID 12401809.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Odintsova TI, Müller EC, Ivanov AV, et al. (2004). 「質量分析法およびエドマン法によるヒト大細胞質リボソームサブユニットタンパク質の翻訳後修飾の特性評価と解析」J. Protein Chem . 22 (3): 249–58 . doi :10.1023/A:1025068419698. PMID 12962325. S2CID 10710245.
- Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, et al. (2004). 「ヒトTNF-α/NF-κBシグナル伝達経路の物理的および機能的マップ」Nat. Cell Biol . 6 (2): 97– 105. doi :10.1038/ncb1086. PMID 14743216. S2CID 11683986.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
- Rush J, Moritz A, Lee KA, et al. (2005). 「癌細胞におけるチロシンリン酸化の免疫親和性プロファイリング」Nat. Biotechnol . 23 (1): 94– 101. doi :10.1038/nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
- Andersen JS, Lam YW, Leung AK, et al. (2005). 「核小体プロテオームダイナミクス」. Nature . 433 (7021): 77– 83. Bibcode :2005Natur.433...77A. doi :10.1038/nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
- Stelzl U, Worm U, Lalowski M, et al. (2005). 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワーク:プロテオーム注釈のためのリソース」. Cell . 122 (6): 957–68 . doi :10.1016/j.cell.2005.08.029. hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID 16169070. S2CID 8235923.
外部リンク