RTL3

RTL3
識別子
エイリアス	RTL3、Mar3、Mart3、ZHC5、ZCCHC5、ジンクフィンガーCCHC型含有5、SIRH9、レトロトランスポゾンGag様3
外部ID	MGI : 2685221 ; HomoloGene : 19397 ; GeneCards : RTL3 ; OMA : RTL3 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト X染色体（ヒト）[ 1 ] バンド Xq21.1 始める 78,656,068 bp [ 1 ] 終わり 78,659,328 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト X染色体（マウス）[ 2 ] バンド X|XD 始める 105,880,688 bp [ 2 ] 終わり 105,884,250 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 胃粘膜 右冠動脈 上行大動脈 脛骨 アキレス腱 心臓の頂点 平滑筋組織 膝窩動脈 脛骨動脈 左冠動脈 上位の表現 輸出管 舌の筋肉 真皮 人間の胎児 顆頭 内頸動脈 舌の内在筋 外頸動脈 舌の外在筋 房室弁 より多くの参照表現データ バイオGPS 該当なし
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 203430 213436 アンサンブル ENSG00000179300 ENSMUSG00000047686 ユニプロット Q8N8U3 Q6P1Y1 RefSeq (mRNA) NM_152694 NM_199468 RefSeq（タンパク質） NP_689907 NP_955762 場所（UCSC） 染色体X: 78.66 – 78.66 Mb 染色体X: 105.88 – 105.88 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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レトロトランスポゾンGag like 3は、ヒトではRTL3遺伝子によってコードされるタンパク質である。 ^{[ 5 ]}

関数

この遺伝子は、gag関連レトロトランスポゾン遺伝子ファミリーの一員である。これらの遺伝子はレトロトランスポーズ能力を失っているように見えるが、オープンリーディングフレームはそのまま残っており、細胞内で新しい機能を獲得した可能性を示唆している。レトロトランスポゾンgag-like-3（RTL3/ZCCHC5/MART3）は、ヒトゲノムで同定された11のSushi-like新遺伝子の1つである7。RTL3は、核酸結合ドメイン（CX2CX4HX4C）、オープンリーディングフレーム内のgag様領域、およびssDNA/RNA結合ホメオボックス関連ロイシンジッパーモチーフを持つ53 kDaのタンパク質をコードしている。^{[ 6 ]} RTL3とSOX-9は軟骨細胞においてCOL2A1の発現を共制御することが報告されている。^{[ 6 ]}

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000179300 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000047686 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. 「Entrez Gene: Retrotransposon Gag like 3」 。 2017年9月18日閲覧。
6. Ball HC, Ansari MY, Ahmad N, Novak K, Haqqi TM (2021年11月). 「レトロトランスポゾンgag-like-3遺伝子RTL3とSOX-9は軟骨細胞におけるCOL2A1の発現を共制御する」 .結合組織研究. 62 (6): 615– 628. doi : 10.1080/03008207.2020.1828380 . PMC 8404968. PMID 33043724 .  

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