Rad50

RAD50
識別子
エイリアス	RAD50、NBSLD、RAD502、hRad50、Rad50、RAD50二本鎖切断修復タンパク質
外部ID	OMIM : 604040、613078 ;​​ MGI : 109292 ;ホモロジーン: 38092 ;ジーンカード: RAD50 ; OMA : RAD50 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 5番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 5q31.1 始める 132,556,019 bp [ 1 ] 終わり 132,646,349 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 11番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 11 B1.3|11 31.98 cM 始める 53,540,346 bp [ 2 ] 終わり 53,598,146 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 脳梁 アキレス腱 結腸上皮 睾丸 生殖腺 ランゲルハンス島 子宮内膜間質細胞 心室帯 扁桃腺 腓骨神経 上位の表現 胚の尾 性器結節 接合子 一次卵母細胞 二次卵母細胞 内頸動脈 回腸上皮 胚葉上層 パネートセル 卵巣 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合 タンパク質-高分子アダプター活性 ヌクレオチド結合 DNAヘリカーゼ活性 金属イオン結合 一本鎖DNAエンドデオキシリボヌクレアーゼ活性 ATPase活性 タンパク質結合 3'-5'エキソヌクレアーゼ活性 加水分解酵素活性 ATP結合 二本鎖テロメアDNA結合 アデニル酸キナーゼ活性 G四重鎖DNA結合 一本鎖テロメアDNA結合 細胞成分 二本鎖切断部位 膜 核質 染色体 テロメア 核 凝縮核染色体 Mre11複合体 生物学的プロセス 相互減数分裂組換え DNA組み換え テロメラーゼによるテロメア維持 キナーゼ活性の正の調節 テロメア3'オーバーハング形成 DNA損傷刺激に対する細胞応答 テロメア維持の正の調節 テロメアキャッピングの負の制御 DNA二重鎖の巻き戻し 減数分裂 二本鎖切断修復 タンパク質の自己リン酸化の正の制御 細胞周期 ウイルスプロセス 非相同末端結合による二本鎖切断修復 テロメア維持 有糸分裂組換えの調節 核酸ホスホジエステル結合の加水分解 DNA複製 DNA二本鎖切断処理 組み換えによるテロメア維持 DNA修復に関わるDNA合成 減数分裂細胞周期に関与する染色体構成 p53クラスメディエーターによるシグナル伝達の制御 ヌクレオチドのリン酸化 DNA修復 相同組換えによる二本鎖切断修復 ストランド変位 テロメアキャッピング ヌクレオシド一リン酸のリン酸化 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 10111 19360 アンサンブル ENSG00000113522 ENSMUSG00000020380 ユニプロット Q92878 P70388 RefSeq (mRNA) NM_133482 NM_005732 NM_009012 RefSeq（タンパク質） NP_005723 該当なし 場所（UCSC） 5番目の文字: 132.56 – 132.65 MB 11章: 53.54 – 53.6 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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DNA修復タンパク質RAD50は、 RAD50としても知られ、ヒトではRAD50遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ]}

関数

この遺伝子によってコードされるタンパク質は、 DNA二本鎖切断修復に関与するタンパク質であるサッカロミセス・セレビシエ（Saccharomyces cerevisiae）のRad50と非常に類似しています。このタンパク質は、 MRE11およびNBS1（酵母ではXrs2としても知られる）と複合体を形成します。このMRN複合体（酵母ではMRX複合体）は、切断されたDNA末端に結合し、非相同末端結合または相同組換えによる二本鎖切断修復に必要な多数の酵素活性を示します。Rad50のマウスホモログの遺伝子ノックアウト研究では、Rad50が細胞の増殖と生存に不可欠であることが示唆されています。Rad50には、異なるタンパク質をコードする2つの選択的スプライシング転写バリアントが報告されています。^{[ 5 ]}

構造

Rad50は染色体構造維持（SMC）タンパク質ファミリーの一員である。 ^{[ 6 ]} 他のSMCタンパク質と同様に、Rad50は長い内部コイルドコイルドメインを有し、このドメインはN末端とC末端を折り畳んで球状のABC ATPaseヘッドドメインを形成する。Rad50は、ヘッドドメインと、コイルドコイルの反対側の末端にある「亜鉛フック」と呼ばれる亜鉛結合二量体化モチーフの両方を介して二量体化することができる。^{[ 7 ]} 原子間力顕微鏡による解析結果によると、遊離Mre11-Rad50-Nbs1複合体では、単一のRad50二量体の亜鉛フックが会合して閉ループを形成し、DNAに結合すると亜鉛フックが分離し、切断されたDNA末端を亜鉛フックを介して固定できると考えられる構造をとることが示唆されている。^{[ 8 ]}

相互作用

Rad50 は以下と相互作用することが示されています:

• BRCA1 , ^{[ 9 ] [ 10 ] [ 11 ]}
• MRE11A、^{[ 9 ] [ 10 ] [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ]}
• NBN、^{[ 9 ] [ 13 ] [ 15 ] [ 16 ]}
• RINT1 , ^{[ 17 ]}
• TERF2IP、^{[ 18 ]} および
• TERF2 . ^{[ 18 ] [ 19 ]}

進化的祖先

Rad50タンパク質は、主に真核生物で研究されてきた。しかし、最近の研究は、Rad50タンパク質の相同遺伝子が現存する原核古細菌にも保存されており、相同組換え修復に機能している可能性が高いことを示している。^{[ 20 ]} 超好熱古細菌Sulfolobus acidocaldariusでは、Rad50タンパク質とMre11タンパク質が相互作用し、ガンマ線によるDNA損傷の修復に積極的な役割を果たしていると思われる。^{[ 21 ]} これらの知見は、真核生物のRad50が、DNA損傷の相同組換え修復に役割を果たしていた祖先古細菌のRad50タンパク質から派生した可能性があることを示唆している。酵母では、RAD50遺伝子によって制御される機能は、正常な減数分裂に必須である。^{[ 22 ]} RAD50によって規定される正常な機能は、減数分裂の初期段階にも終末段階にも必須ではないが、組換えを成功させるために必要である と思われる。^{[ 22 ]}

病気

ヒトRAD50欠損症は、小頭症および低身長の患者で報告されている常染色体劣性症候群です。その臨床表現型はナイメーヘン染色体切断症候群に類似しています。これらの患者の細胞は、染色体切断に対する反応が障害され、放射線感受性が亢進していました。^{[ 23 ] [ 24 ] [ 25 ]}

参照

• MRN複合体
• 相同組換え
• ナイメーヘン骨折症候群

参考文献

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さらに読む

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外部リンク

• UCSC ゲノム ブラウザにおけるRAD50ヒト遺伝子の位置。
• UCSC ゲノム ブラウザにおけるRAD50ヒト遺伝子の詳細。