| コンテンツ | |
|---|---|
| 説明 | 抗菌薬耐性遺伝子のデータベース。 |
キャプチャされたデータの種類 | 抗菌薬耐性 |
| 生物 | 細菌 |
| 接触 | |
| 主な引用 | PMID 22782487 |
| アクセス | |
| Webサイト | www.genomicepidemiology.org. |
| その他 | |
| ブックマーク可能な エンティティ | はい |
ResFinderは、全ゲノムデータセットから抗菌薬耐性遺伝子を捕捉するデータベースです。[1]このデータベースはBLASTを用いてこれを実現しています。このデータベースでは、全配列、部分配列、または他のシーケンシングプラットフォームからの短い配列リードを入力できます。[1]さらに、ユーザーは検出の閾値を独自に設定できます。デフォルトでは100% IDです。ResFinderは、Marilyn Robertsデータベース、Laheyデータベース(現在は廃止)、 ARDBなどの他のデータベースから情報を取得します。その他の情報源には、レビューを含む出版文献が含まれます。[2] [3]
参照
参考文献
- ^ ab Zankari, E.; Hasman, H.; Cosentino, S.; Vestergaard, M.; Rasmussen, S.; Lund, O.; Aarestrup, FM; Larsen, MV (2012-11-01). 「獲得性抗菌薬耐性遺伝子の同定」. Journal of Antimicrobial Chemotherapy . 67 (11): 2640– 2644. doi :10.1093/jac/dks261. ISSN 0305-7453. PMC 3468078. PMID 22782487 .
- ^ RATHER, P (1998). 「アミノグリコシド修飾酵素の起源」. Drug Resistance Updates . 1 (5): 285– 291. doi :10.1016/s1368-7646(98)80044-7. ISSN 1368-7646. PMID 17092809.
- ^ van Hoek, Angela HAM; Mevius, Dik; Guerra, Beatriz; Mullany, Peter; Roberts, Adam Paul; Aarts, Henk JM (2011). 「獲得性抗生物質耐性遺伝子:概要」. Frontiers in Microbiology . 2 : 203. doi : 10.3389/fmicb.2011.00203 . ISSN 1664-302X. PMC 3202223. PMID 22046172 .