ResFinder

生物学データベース
ResFinder
コンテンツ
説明抗菌薬耐性遺伝子のデータベース。

キャプチャされたデータの種類
抗菌薬耐性
生物細菌
接触
主な引用PMID  22782487
アクセス
Webサイトwww.genomicepidemiology.org.
その他
ブックマーク可能な
エンティティ
はい

ResFinderは、全ゲノムデータセットから抗菌薬耐性遺伝子を捕捉するデータベースです[1]このデータベースはBLASTを用いてこれを実現しています。このデータベースでは、全配列、部分配列、または他のシーケンシングプラットフォームからの短い配列リードを入力できます[1]さらに、ユーザーは検出の閾値を独自に設定できます。デフォルトでは100% IDです。ResFinderは、Marilyn Robertsデータベース、Laheyデータベース(現在は廃止)、 ARDBなどの他のデータベースから情報を取得します。その他の情報源には、レビューを含む出版文献が含まれます。[2] [3]

参照

参考文献

  1. ^ ab Zankari, E.; Hasman, H.; Cosentino, S.; Vestergaard, M.; Rasmussen, S.; Lund, O.; Aarestrup, FM; Larsen, MV (2012-11-01). 「獲得性抗菌薬耐性遺伝子の同定」. Journal of Antimicrobial Chemotherapy . 67 (11): 2640– 2644. doi :10.1093/jac/dks261. ISSN  0305-7453. PMC 3468078. PMID 22782487  . 
  2. ^ RATHER, P (1998). 「アミノグリコシド修飾酵素の起源」. Drug Resistance Updates . 1 (5): 285– 291. doi :10.1016/s1368-7646(98)80044-7. ISSN  1368-7646. PMID  17092809.
  3. ^ van Hoek, Angela HAM; Mevius, Dik; Guerra, Beatriz; Mullany, Peter; Roberts, Adam Paul; Aarts, Henk JM (2011). 「獲得性抗生物質耐性遺伝子:概要」. Frontiers in Microbiology . 2 : 203. doi : 10.3389/fmicb.2011.00203 . ISSN  1664-302X. PMC 3202223. PMID 22046172  . 
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