リケッチア科

リケッチア科
シカダニの細胞内の リケッチア・リケッチ（赤い点）
科学的分類
ドメイン：	細菌
界：	シュードモナス亜綱
門	シュードモナス亜綱
綱	アルファプロテオバクテリア
亜綱	「リケッチア科」
目	リケッチア目
科	リケッチア科 ピンカートン 1936 (承認リスト 1980)
族と属
「カンジダトゥス・アルカノバクター」Martijn他2015 「カンジダトゥス・クリプトプロドータ」コルリグ。フェランティーニら。 2009年 「デルマセントロクセヌス」ウォルバッハ 1919 「Candidatus Gigarickettsia」Vannini et al . 2014 [1] *「Candidatus Hemipteriphilus」Bing et al。 2013年 「Candidatus Megaira」シュラルハマーら。 2013年 Occidentia Mediannikov et al . 2017年 オリエンティア ・タムラ他1995 「Candidatus Phycorickettsia」Yurchenko et al . 2018年 リケッチア・ ダ・ロシャ・リマ 1916（1980年承認リスト） 「Candidatus Sarmatiella」Castelli et al . 2021年 「Candidatus Spectririckettsia」Castelli et al . 2019年 「Candidatus Tisiphia」Davison et al . 2022年 「Candidatus Trichorickettsia」Vannini et al . 2014年[1] 「Candidatus Xenohaliotis」フリードマンら。 2000年

リケッチア科は細菌の科である。この科の中で最も著名な属はリケッチア属である。ミトコンドリア（真核細胞の細胞器官）を最終的に形成した細菌は、この科に由来すると考えられている。この科のヒト病原体のほとんどはリケッチア属である。それらはダニやシラミなどの節足動物の体内で生活環の一部を過ごし、その後、節足動物に噛まれることでヒトや他の哺乳類に感染する。この科にはグラム陰性細菌が含まれており、環境曝露に非常に敏感であるため、絶対細胞内感染に適応している。 リケッチア・リケッチはこのグループの典型的な感染性生物と考えられている。

ゲノミクス

比較ゲノム解析により、リケッチア科に特異的に存在し、この科の分子マーカーとして機能する3つのタンパク質、RP030、RP187、RP192が同定されました。^[2]さらに、転写修復共役因子Mfdの4アミノ酸挿入、リボソームタンパク質L19の10アミノ酸挿入、 FtsZタンパク質と主要シグマ因子70のそれぞれ1アミノ酸挿入、およびリケッチア科に特異的なエキソヌクレアーゼVIIタンパク質の1アミノ酸欠失など、多くのタンパク質における保存されたシグネチャーインデルが同定されています。^[3]

アルファプロテオバクテリアのリボソームRNA系統図

マグネトコッカス科     マグネトコッカス・マリヌス   カウロバクテリダエ     ホロスポラ目   Hyphomicrobiales、Rhodobacteraceae、   Rhodospirillales、Sphingomonadalesなど。 ​   リケッチア科     ペラギバクテリア目     ペラギバクテリア科     ペラギバクター   サブグループIb、II、IIIa、IIIb、IV、V   リケッチア目     プロトミトコンドリア   アナプラズマ科     ネオリケッツシア   ボルバキア   アナプラズマ   エーリキア   ミディクロリア科     ミディクロリア   リケッチア科     オリエンティア   リケッチア

リケッチア科の系統樹は、Ferlaら [4]によって16S + 23SリボソームRNA配列 の比較から推定された。

参考文献

1. Vannini C, Boscaro V, Ferrantini F, Benken KA, Mironov TI, Schweikert M, Görtz HD, Fokin SI, Sabaneyeva EV, Petroni G (2014). 「リケッチア科細菌2種における鞭毛運動：進化論的観点からの運動性の再評価」. PLOS ONE . 9 (2) e87718. Bibcode :2014PLoSO...987718V. doi : 10.1371/journal.pone.0087718 . PMC  3914857. PMID  24505307 .
2. Gupta, RSおよびMok, A. (2007). アルファプロテオバクテリアとその主要グループの系統ゲノム解析とシグネチャータンパク質. BMC Microbiology. 7:106. doi : 10.1186/1471-2180-7-106 .
3. Gupta, RS (2005). アルファプロテオバクテリアとその亜群に特有のタンパク質シグネチャーとアルファプロテオバクテリアの進化モデル. Critical Reviews in Microbiology. 3:101-135. doi :10.1080/10408410590922393.
4. Ferla MP, Thrash JC, Giovannoni SJ, Patrick WM (2013). 「アルファプロテオバクテリアのrRNA遺伝子に基づく新たな系統発生は、主要グループ、ミトコンドリア祖先、系統学的不安定性に関する展望を提供する」. PLOS ONE . 8 (12) e83383. Bibcode :2013PLoSO...883383F. doi : 10.1371/journal.pone.0083383 . PMC 3859672. PMID  24349502 .