ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| RNF103 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | RNF103、HKF-1、KF-1、KF1、ZFP-103、ZFP103、薬指タンパク質103 |
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| 外部ID | オミム:602507; MGI : 109483;ホモロジーン: 4146;ジーンカード:RNF103; OMA :RNF103 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 6番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 6 C1|6 32.16 cM | 始める | 71,470,878 bp [2] |
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| 終わり | 71,487,865 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 中側頭回
- 羊水
- 精巣上体
- 小腸粘膜
- ブロードマン野23
- 回腸粘膜
- 胚上皮
- 三叉神経節
- 脳梁
- 小脳の傍小葉
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| | 上位の表現 | - 左結腸
- 毛様体
- 結膜円蓋
- 精嚢
- 黒質
- 涙腺
- 耳下腺
- 前立腺の葉
- 骨髄間質
- パネートセル
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- タンパク質結合
- 金属イオン結合
- ユビキチンタンパク質転移酵素活性
- トランスフェラーゼ活性
- ユビキチンタンパク質リガーゼ活性
| | 細胞成分 |
- 膜の不可欠な構成要素
- 小胞体
- 膜
- 小胞体膜
- 小胞体品質管理コンパートメント
| | 生物学的プロセス |
- 中枢神経系の発達
- タンパク質のユビキチン化
- ユビキチン依存性ERAD経路
- 小胞体マンノーストリミング
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オーソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_005667 NM_001198951 NM_001198952 |
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| RefSeq(タンパク質) | |
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NP_001185880 NP_001185881 NP_005658 |
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| 場所(UCSC) | 2番目の文字: 86.6 – 86.62 Mb | 6章: 71.47 – 71.49 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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リングフィンガータンパク質103は、ヒトではRNF103遺伝子によってコードされるタンパク質である。
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関数
この遺伝子によってコードされるタンパク質には、タンパク質間およびタンパク質-DNA相互作用に関与することが知られているRING-H2フィンガーモチーフが含まれています。この遺伝子は正常な小脳で高発現していますが、大脳皮質では低発現です。ラットの前頭皮質および海馬における対応する遺伝子の発現は、電気けいれん療法(ECT)および慢性抗うつ薬療法によって誘導されることが示されており、この遺伝子がECTおよび抗うつ薬の分子標的となる可能性が示唆されています。このタンパク質は、小胞体関連分解経路で機能するユビキチンリガーゼです。この遺伝子の選択的スプライシングにより、複数の転写バリアントが生じます。また、この遺伝子と下流のCHMP3(荷電多小胞体タンパク質3)遺伝子との間には、リードスルー転写が存在します。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000239305 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000052656 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「Entrez Gene: Ring finger protein 103」。2017年7月4日閲覧。
さらに読む
- Scheper J, Oliva B, Villà-Freixa J, Thomson TM (2009). 「RINGフィンガードメインとユビキチン結合酵素間の相互作用の選択性に対する静電的寄与の解析」. Proteins . 74 (1): 92– 103. doi :10.1002/prot.22120. PMID 18615712. S2CID 37900633.
この記事には、パブリック ドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。