ロバート・J・シュミッツ
ロバート・J・シュミッツ | |
|---|---|
| 生まれる | 1980年（45～46歳） |
| 市民権 | アメリカ合衆国 |
| 教育 | ソーク研究所 |
| 母校 | アリゾナ大学、ウィスコンシン大学マディソン校 |
| 知られている | エピアレルのゲノムワイドな特性解析 |
| 科学者としてのキャリア | |
| フィールド | ゲノミクス、エピジェネティクス、植物生物学 |
| 機関 | ジョージア大学 |
| 論文 | 春化：シロイヌナズナにおけるエピジェネティクスと真核生物の遺伝子制御を研究するためのモデル （2007） |
| 博士課程の指導教員 | リチャード・アマシーノ |
| その他の学術アドバイザー | ジョセフ・R・エッカー |
| Webサイト | シュミッツラボ |
ロバート・J・シュミッツは、ジョージア大学のアメリカ人植物生物学者およびエピゲノミストであり、植物エピアレルの生成と表現型への影響を研究するとともに、シス制御配列を同定・研究するための新技術の開発に取り組んでいる。彼はジョージア大学遺伝学科の准教授であり、ジョージア大学財団寄付講座の植物科学教授でもある。[ 1 ]
教育とキャリア
シュミッツはアリゾナ大学で学士号を取得し、ウィスコンシン大学で博士号を取得しました。[ 2 ]博士課程の学生として、リチャード・アマシーノの研究室で、シロイヌナズナにおけるエピジェネティック修飾が春化に及ぼす役割について研究しました。2007年にウィスコンシン大学を卒業しました。 [ 1 ] 2007年から2013年まで、ソーク研究所でジョー・エッカーのポスドク研究員を務めました。2013年にジョージア大学アセンズ校遺伝学科の助教授に採用され、現在もジョージア・ゲノミクス＆バイオインフォマティクス・コアの准教授兼ディレクターとして働いています。[ 1 ]
研究
博士研究員として、シュミッツは植物ゲノム内の個々のシトシンのメチル化状態をシーケンシング技術を用いて判定する技術を開発し、それを用いて同種の異なる個体間でメチル化パターンがどのように変化するかを定量化した。[ 3 ] [ 4 ]彼は同じ技術を用いて、大豆の組み換え近交集団におけるメチル化の異なる領域を分離してマッピングし、基礎となる遺伝子ハプロタイプが、特定の遺伝子型においてどの親のメチル化状態が観察されるかを一貫して予測するわけではないことを発見した。[ 5 ]彼は、植物メチルトランスフェラーゼであるクロモメチラーゼ3の喪失が遺伝子本体のメチル化を廃止すること、そしてこの喪失が野生植物種において繰り返し発生していることを実証した。[ 6 ]
彼の研究グループは、エピジェネティック変異を用いて植物の表現型を改変する研究を行っています。彼らは自然発生するエピ突然変異を研究するだけでなく、DNAは同一だがDNAメチル化が異なるエピRILセットも開発しています。[ 1 ] [ 7 ]ヒト由来の酵素を用いることで、植物の標的遺伝子のメチル化を除去し、ゲノム内で長らく休眠状態にあった遺伝子を活性化することができます。[ 8 ] [ 9 ]
彼はまた、エピゲノムプロファイリングをさまざまな植物種の非コード制御配列の発見に応用する研究を行っています。[ 1 ]彼の研究室では、トウモロコシにおいてゲノム内で遠く離れた位置にある遺伝子の発現を制御するシス制御要素を特定しました。[ 10 ]彼らは、ATAC-seqと蛍光活性化核選別法を組み合わせて、植物ゲノム内のオープンクロマチン領域と転写因子結合部位の位置を特定しています。[ 11 ]
認識
参考文献
- ^ a b c d e「ボブ・シュミッツ | 遺伝学部」。
- ^ 「ボブ・シュミッツ」 2018年4月8日。
- ^ a b「ロバート・J・シュミッツ博士」
- ^ Schmitz, Robert J.; Schultz, Matthew D.; Urich, Mark A.; Nery, Joseph R.; Pelizzola, Mattia; Libiger, Ondrej; Alix, Andrew; McCosh, Richard B.; Chen, Huaming; Schork, Nicholas J.; Ecker, Joseph R. (2013). 「集団エピゲノム多様性のパターン」 . Nature . 495 ( 7440): 193– 198. Bibcode : 2013Natur.495..193S . doi : 10.1038/nature11968 . PMC 3798000. PMID 23467092 .
- ^ Schmitz, RJ; He, Y.; Valdes-Lopez, O.; Khan, SM; Joshi, T.; Urich, MA; Nery, JR; Diers, B.; Xu, D.; Stacey, G.; Ecker, JR (2013). 「組換え近交系集団におけるシトシンメチル化変異体のエピゲノムワイドな継承」 . Genome Research . 23 (10): 1663– 1674. doi : 10.1101/gr.152538.112 . PMC 3787263. PMID 23739894 .
- ^ビューイック、アダム J.;ジー、レクシャン。ニーダーフース、チャド E.喜んで、エヴァ＝マリア。ホフマイスター、ブリギッテ T.シー・シュウリン。王、李。ルー、ゼフ。ロール、ニコラス A.ハートウィッグ、ベンジャミン。キーファー、クリスティアン。ディール、ロジャー B.シュムッツ、ジェレミー。ジェーン・グリムウッド。ストラウド、ヒューム。ジェイコブセン、スティーブン E.シュネーベルガー、コルビニアン。チャン・シャオユウ。シュミッツ、ロバート J. (2016)。「遺伝子体のDNAメチル化の起源と進化的結果について」。米国科学アカデミーの議事録。113 (32): 9111–9116。Bibcode : 2016PNAS..113.9111B。doi : 10.1073/pnas.1604666113 . PMC 4987809 . PMID 27457936 .
- ^ Hofmeister, Brigitte T.; Lee, Kevin; Rohr, Nicholas A.; Hall, David W.; Schmitz, Robert J. (2017). 「DNAメチル化の安定継承は、遺伝的変異がない場合のエピジェノタイプマップの作成とエピアレル継承パターンの研究を可能にする」 . Genome Biology . 18 (1): 155. doi : 10.1186 / s13059-017-1288-x . PMC 5559844. PMID 28814343 .
- ^ 「ジョージア大学の研究者が作物の改良法を開発」 2018年3月6日。
- ^ジー、レクシャン;ジョーダン、ウィリアム・T.シー・シュウリン。胡、ルル。彼、チュアン。シュミッツ、ロバート J. (2018)。「シロイヌナズナのメチロームの TET 媒介エピ突然変異誘発」。ネイチャーコミュニケーションズ。9 (1): 895。Bibcode : 2018NatCo...9..895J。土井：10.1038/s41467-018-03289-7。PMC 5832761。PMID 29497035。
- ^リッチ、ウィリアム A.;ルー、ゼフ。ジー、レクシャン。マランド、アレクサンドル P.エスリッジ、クリスティーナ L.マーフィー、ナタリー G.ノシェイ、ジャクリン・M.ガリ、メアリー。メヒア＝グエラ、マリア・キャサリン。コロメ・タッシェ、マリア。ヨハネス、フランク。ローリー、M. ジョーダン。コルセス、ビクター G.ザイ、ジシアン。スキャンロン、マイケル J.バックラー、エドワード S.アンドレア・ガラヴォッティ。スプリンガー、ネイサン M.シュミッツ、ロバート J.張暁宇（2019）。「トウモロコシゲノムにおける広範な長距離シス調節要素」。自然の植物。5 (12): 1237–1249。Bibcode : 2019NatPl...5.1237R。doi : 10.1038/s41477-019-0547-0 . PMC 6904520 . PMID 31740773 .
- ^ Lu, Zefu; Hofmeister, Brigitte T.; Vollmers, Christopher; Dubois, Rebecca M.; Schmitz, Robert J. (2017). 「植物ゲノムにおけるシス調節領域の発見のためのATAC-seqと核ソーティングの組み合わせ」 . Nucleic Acids Research . 45 (6): e41. doi : 10.1093/nar/ gkw1179 . PMC 5389718. PMID 27903897 .
- ^ 「シュミッツ、ロバート J. - 高等研究所 (IAS)」。
外部リンク
