SBF1

SBF1
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1V5U
識別子
エイリアス	SBF1、CMT4B3、DENND7A、MTMR5、SET結合因子1
外部ID	オミム：603560; MGI : 1925230;ホモロジーン: 84710;ジーンカード：SBF1; OMA :SBF1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 22番染色体（ヒト）[1] バンド 22q13.33 始める 50,443,219 bp [1] 終わり 50,483,923 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 15番染色体（マウス）[2] バンド 15|15 E3 始める 89,172,439 bp [2] 終わり 89,199,514 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 左精巣 右精巣 甲状腺の右葉 甲状腺の左葉 小脳の右半球 右前頭葉 帯状回 C1セグメント 前帯状皮質 扁桃体 上位の表現 海馬歯状回顆粒細胞 網膜の神経層 精母細胞 上前頭回 心室帯 一次視覚野 胸腺 顆粒球 リップ 食道 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 ホスファターゼ調節活性 タンパク質チロシン/セリン/スレオニンホスファターゼ活性 グアニルヌクレオチド交換因子活性 ホスファターゼ活性 細胞成分 膜の不可欠な構成要素 核 細胞質 小胞体膜 細胞質 核体 細胞質の核周囲領域 生物学的プロセス GTPase活性の調節 タンパク質の脱リン酸化 精子形成 ホスファチジルイノシトール生合成プロセス 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 6305 77980 アンサンブル ENSG00000100241 ENSMUSG00000036529 ユニプロット O95248 Q6ZPE2 RefSeq (mRNA) NM_002972 NM_001365819 NM_001081030 NM_001170561 NM_030019 RefSeq（タンパク質） NP_002963 NP_001352748 NP_001074499 NP_001164032 場所（UCSC） 22章: 50.44 – 50.48 MB 15章: 89.17 – 89.2 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

ミオチューブラリン関連タンパク質5は、ヒトではSBF1遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[5] [6] [7]}

相互作用

SBF1はMTMR2 ^[8]およびSUV39H1 ^[9]と相互作用することが示されている。

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000100241 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000036529 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Cui X, De Vivo I, Slany R, Miyamoto A, Firestein R, Cleary ML (1998年4月). 「SETドメインとミオチューブラリン関連タンパク質の会合が成長制御を調節する」Nat. Genet . 18 (4): 331–7 . doi :10.1038/ng0498-331. PMID  9537414. S2CID  25209204.
6. Laporte J, Blondeau F, Buj-Bello A, Tentler D, Kretz C, Dahl N, Mandel JL (1998年12月). 「酵母からヒトまでのミオチューブラリン二重特異性ホスファターゼ遺伝子ファミリーの特性評価」Hum. Mol. Genet . 7 (11): 1703–12 . doi : 10.1093/hmg/7.11.1703 . PMID  9736772.
7. 「Entrez Gene: SBF1 SET 結合因子 1」。
8. Kim SA, Vacratsis PO, Firestein R, Cleary ML, Dixon JE (2003年4月). 「触媒的に不活性なホスファターゼMTMR5によるミオチューブラリン関連（MTMR）2ホスファチジルイノシトールホスファターゼの制御」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 100 (8): 4492–7 . Bibcode :2003PNAS..100.4492K. doi : 10.1073/pnas.0431052100 . PMC 153583. PMID  12668758 . 
9. Firestein R, Cui X, Huie P, Cleary ML (2000年7月). 「ショウジョウバエSu(var)3-9の哺乳類相同遺伝子であるSUV39H1による転写サイレンシングと成長制御のSetドメイン依存性制御」Mol. Cell. Biol . 20 (13): 4900–9 . doi :10.1128/MCB.20.13.4900-4909.2000. PMC 85941. PMID 10848615  . 

さらに読む

• Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN, Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (1999). 「ヒト22番染色体のDNA配列」. Nature . 402 (6761): 489–95 .書誌コード:1999Natur.402..489D. doi : 10.1038/990031 . PMID  10591208.
• Firestein R, Cui X, Huie P, Cleary ML (2000). 「ショウジョウバエSu(var)3-9の哺乳類相同遺伝子であるSUV39H1による転写サイレンシングと成長制御のSetドメイン依存性制御」Mol. Cell. Biol . 20 (13): 4900–9 . doi :10.1128/MCB.20.13.4900-4909.2000. PMC  85941. PMID 10848615  .
• Firestein R, Cleary ML (2001). 「擬似ホスファターゼSbf1は、その成長制御特性を調節するN末端GEF相同ドメインを含む」J. Cell Sci . 114 (Pt 16): 2921–7 . doi :10.1242/jcs.114.16.2921. PMID  11686296.
• Firestein R, Nagy PL, Daly M, Huie P, Conti M, Cleary ML (2002). 「擬似ホスファターゼSbf1を欠損したマウスにおける男性不妊、精子形成障害、および無精子症」J. Clin. Invest . 109 (9): 1165–72 . doi :10.1172/JCI12589. PMC 150957.  PMID 11994405  .
• Kim SA, Vacratsis PO, Firestein R, Cleary ML, Dixon JE (2003). 「触媒的に不活性なホスファターゼMTMR5によるミオチューブラリン関連（MTMR）2ホスファチジルイノシトールホスファターゼの制御」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 100 (8): 4492–7 . Bibcode :2003PNAS..100.4492K. doi : 10.1073/pnas.0431052100 . PMC  153583. PMID 12668758  .

外部リンク

• PDBe-KBのUniProt : Q6ZPE2 (マウス ミオチューブラリン関連タンパク質 5)のPDBで利用可能なすべての構造情報の概要。