スキャン1

スキャン1
識別子
エイリアス	SCAND1、RAZ1、SDP1、1を含むSCANドメイン
外部ID	オミム: 610416 ; MGI : 1343132 ;ホモロジーン: 10642 ;ジーンカード: SCAND1 ; OMA : SCAND1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 20番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 20q11.23 始める 35,953,617 bp [ 1 ] 終わり 35,959,472 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 2番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 2|2 H1 始める 156,153,766 bp [ 2 ] 終わり 156,154,667 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 横行結腸粘膜 鼻粘膜の嗅覚領域 右副腎 右副腎皮質 左副腎皮質 下垂体前葉 肝臓の右葉 心臓の頂点 右卵管 胃粘膜 上位の表現 顆粒球 脛大腿関節 精細管 卵黄嚢 太ももの筋肉 内側神経節隆起 頭蓋冠 内頸動脈 右腎臓 外頸動脈 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合転写因子活性 転写コアクチベーター活性 タンパク質結合 同一のタンパク質結合 DNA結合 細胞成分 核 生物学的プロセス 転写の制御、DNAテンプレート 核酸テンプレート転写の正の制御 出典：Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 51282 19018 アンサンブル ENSG00000171222 ENSMUSG00000046229 ユニプロット P57086 Q2M4I6 RefSeq (mRNA) NM_033630 NM_016558 NM_001385710 NM_020255 RefSeq（タンパク質） NP_057642 NP_361012 NP_064651 場所（UCSC） 20章: 35.95 – 35.96 MB 2番目の文字: 156.15 – 156.15 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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SCANドメイン含有タンパク質1は、ヒトではSCAND1遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]}

関数

SCANドメインは、約60アミノ酸からなる高度に保存されたロイシンリッチなモチーフであり、元々はジンクフィンガータンパク質のサブファミリーに存在していました。この遺伝子は、単独のSCANドメインをコードするがジンクフィンガーモチーフを持たない遺伝子ファミリーに属します。機能研究により、SCANボックスはヘテロタンパク質とホモタンパク質の両方の会合を媒介するタンパク質相互作用ドメインであり、転写活性の調節に関与している可能性が示唆されています。この遺伝子には、5' UTRが異なるものの同じタンパク質をコードする2つの転写バリアントが報告されています。^{[ 8 ]}

相互作用

SCAND1はMZF1と相互作用することが示されている。^{[ 5 ]}

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000171222 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000046229 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Sander TL, Haas AL, Peterson MJ, Morris JF (2000年4月). 「MZF1Bと相互作用する新規SCANボックス関連タンパク質の同定。ロイシンに富むSCANボックスはヘテロタンパク質とホモタンパク質の会合を媒介する」 . The Journal of Biological Chemistry . 275 (17): 12857–67 . doi : 10.1074/jbc.275.17.12857 . PMID 10777584 . 
6. Schumacher C, Wang H, Honer C, Ding W, Koehn J, Lawrence Q, Coulis CM, Wang LL, Ballinger D, Bowen BR, Wagner S (2000年6月). 「SCANドメインは選択的オリゴマー化を媒介する」 . The Journal of Biological Chemistry . 275 (22): 17173–9 . doi : 10.1074/jbc.M000119200 . PMID 10747874 . 
7. Babb R, Bowen BR (2003年3月). 「SDP1はSCANドメインを介して結合するペルオキシソーム増殖因子活性化受容体γ2の共活性化因子である」 . The Biochemical Journal . 370 (Pt 2): 719–27 . doi : 10.1042/BJ20021378 . PMC 1223195. PMID 12444922 .  
8. 「Entrez Gene: SCAND1 SCANドメインを含む1」。

さらに読む

• Williams AJ, Blacklow SC, Collins T (1999年12月). 「ジンクフィンガー関連SCANボックスは保存されたオリゴマー形成ドメインである」 . Molecular and Cellular Biology . 19 (12): 8526–35 . doi : 10.1128/ mcb.19.12.8526 . PMC  84969. PMID  10567577 .
• Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2000年11月). 「in vitro部位特異的組換えを用いたDNAクローニング」 . Genome Research . 10 (11): 1788–95 . doi : 10.1101/gr.143000 . PMC  310948. PMID  11076863 .
• Sander TL, Morris JF (2002年8月). 「RAZ1遺伝子をコードするSCANボックスの特性解析：cDNA転写産物、発現、細胞内局在の解析」. Gene . 296 ( 1– 2): 53– 64. doi : 10.1016/S0378-1119(02)00792-8 . PMID  12383503 .
• Wiemann S、Arlt D、Huber W、Wellenreuther R、Schleeger S、Mehrle A、Bechtel S、Sauermann M、Korf U、Pepperkok R、Sültmann H、Poustka A (2004 年 10 月)。「ORFeome から生物学へ: 機能的ゲノミクス パイプライン」。ゲノム研究。14 (10B): 2136–44 .土井: 10.1101/gr.2576704。PMC  528930。PMID  15489336。
• ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實・岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ＝グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセット・スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M (2005 年 10 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173– 8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID  16189514 . S2CID  4427026 .
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