スマルセ1

スマルセ1
識別子
エイリアス	SMARCE1、BAF57、CSS5、SWI/SNF関連、マトリックス関連、アクチン依存性クロマチン調節因子、サブファミリーe、メンバー1
外部ID	オミム: 603111 ; MGI : 1927347 ;ホモロジーン: 37727 ;ジーンカード：SMARCE1 ; OMA : SMARCE1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
キリスト	17番染色体（ヒト）
終わり	40,648,654 bp
遺伝子の位置（マウス）
キリスト	11番染色体（マウス）
終わり	99,121,843 bp
RNA発現パターン
	上位の表現
	アキレス腱; 神経節隆起; 平滑筋組織; 心室帯; ランゲルハンス島; 子宮体部; 胆嚢; 子宮頸管; 直腸; 子宮内膜間質細胞;
	上位の表現
	性器結節; 胚の尾; 上頸部神経節; 心室帯; 神経節隆起; 手; 網膜の神経層; 上顎突出; 下顎突出; 腹壁;
	より多くの参照表現データ
	該当なし
遺伝子オントロジー
分子機能	RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合; DNA結合; タンパク質N末端結合; 転写コアクチベーター活性; N-アセチルトランスフェラーゼ活性; クロマチン結合; タンパク質結合; 核受容体結合; RNA結合; ヌクレオソームDNA結合; DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的;
細胞成分	nBAF複合体; SWI/SNF複合体; 転写抑制因子複合体; 核質; 核染色体; npBAF複合体; 核; タンパク質含有複合体;
生物学的プロセス	クロマチンリモデリング; 神経新生; RNAポリメラーゼIIによる転写の調節; 神経系の発達; ヌクレオソームの分解; 転写の負の制御、DNAテンプレート; クロマチン組織; 核酸テンプレート転写の正の制御;
	出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
	6605
	57376
	ENSG00000073584
	ENSMUSG00000037935
	Q969G3
	O54941
	NM_003079
	NM_020618
	NP_003070 NP_003070.3
	NP_065643
	ウィキデータ
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SWI/SNF関連マトリックス関連アクチン依存性クロマチン調節因子サブファミリーEメンバー1は、ヒトではSMARCE1遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[⁵^]^[⁶^]

関数

この遺伝子によってコードされるタンパク質は、通常はクロマチンによって抑制されている遺伝子の転写活性化に必要とされる、ATP依存性クロマチンリモデリング複合体SWI/SNFの一部である。コードされているタンパク質は、単独でもSWI/SNF複合体の一部であっても、DNAがヌクレオソームに出入りする際のトポロジーを模倣すると考えられる4方向ジャンクションDNAに結合することができる。このタンパク質はDNA結合HMGドメインを含むが、このドメインを破壊してもSWI/SNF複合体のDNA結合活性やヌクレオソーム置換活性は失われない。ほとんどのSWI/SNF複合体タンパク質とは異なり、このタンパク質には酵母に対応するタンパク質が存在しない。^{[ 6 ]}

相互作用

SMARCE1はエストロゲン受容体α ^[⁷^]、SMARCB1 ^[⁸^]^、[⁹^]、およびSMARCA4 ^[⁸^]^[⁹^]と相互作用することが示されている。

参考文献

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さらに読む

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