核内小リボ核タンパク質ポリペプチドF

SNRPF
利用可能な構造
PDB	オーソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	3CW1、3PGW、3S6N、4F7U、4PJO、4V98、4WZJ、3JCR
識別子
エイリアス	SNRPF、SMF、Sm-F、snRNP-F、小核リボ核タンパク質ポリペプチドF
外部ID	オミム：603541; MGI : 1917128;ホモロジーン: 130366;ジーンカード：SNRPF; OMA :SNRPF - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
キリスト	12番染色体（ヒト）
終わり	95,903,828 bp
遺伝子の位置（マウス）
キリスト	10番染色体（マウス）
終わり	93,425,568 bp
RNA発現パターン
	上位の表現
	卵母細胞; ; 胚; ; 神経節隆起; ; 結腸上皮; ; 心室帯; ; 咽頭粘膜; ; 骨髄; ; 横行結腸粘膜; ; 口腔; ; 心膜;
	上位の表現
	卵黄嚢; ; 胚; ; 胚; ; 胚葉上層; ; 心室帯; ; 神経節隆起; ; レンズ; ; 接合子; ; 神経管; ; 胎盤;
	より多くの参照表現データ
	より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー
分子機能	タンパク質結合; RNA結合;
細胞成分	U4 snRNP; SMN-Smタンパク質複合体; pICln-Smタンパク質複合体; 核; U7 snRNP; 触媒ステップ2スプライソソーム; U1 snRNP; 細胞質; sno(s)RNA含有リボ核タンパク質複合体; 核質; 小さな核リボ核タンパク質複合体; U12型スプライセオソーム複合体; メチロソーム; 細胞質; スプライセオソーム複合体; U2型触媒ステップ2スプライソソーム; U4/U6 x U5 トリスnRNP複合体; U2型プレカタラーゼスプライソソーム;
生物学的プロセス	RNAポリメラーゼII転写の終結; ヒストンmRNA代謝プロセス; mRNA処理; スプライソソームを介したmRNAスプライシング; RNAスプライシング; 核へのインポート; スプライソソーム snRNP アセンブリ;
	出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
	6636
	69878
	ENSG00000139343
	ENSMUSG00000020018
	P62306
	P62307
	NM_003095 ; NM_001394209
	NM_027246
	NP_003086
	NP_081522
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

Protein-coding gene in the species Homo sapiens

小核リボ核タンパク質Fは、ヒトではSNRPF遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]

相互作用

小核リボ核タンパク質ポリペプチドFは、DDX20 ^{[7] 、}小核リボ核タンパク質D2 ^[8]、小核リボ核タンパク質ポリペプチドE ^[8]と相互作用することが示されている。

参考文献

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さらに読む

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[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000139343 – Ensembl、2017年5月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000020018 – Ensembl、2017年5月

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[pmid7744013-5] Hermann H, Fabrizio P, Raker VA, Foulaki K, Hornig H, Brahms H, Lührmann R (1995年5月). 「snRNP Smタンパク質は、Smタンパク質間相互作用に関与する2つの進化的に保存された配列モチーフを共有している」. The EMBO Journal . 14 (9): 2076–88 . doi :10.1002/j.1460-2075.1995.tb07199.x. PMC 398308. PMID 7744013 .

[entrez-6] 「Entrez Gene: SNRPF 小型核リボ核タンパク質ポリペプチド F」。

[pmid10601333-7] Charroux B, Pellizzoni L, Perkinson RA, Shevchenko A, Mann M, Dreyfuss G (1999年12月). 「Gemin3：脊髄性筋萎縮症遺伝子産物SMNと相互作用し、gemsの構成要素となる新規DEADボックスタンパク質」. The Journal of Cell Biology . 147 (6): 1181–94 . doi :10.1083/jcb.147.6.1181. PMC 2168095. PMID 10601333 .

[pmid9417867-8] Fury MG, Zhang W, Christodoulopoulos I, Zieve GW (1997年11月). 「多重タンパク質：snRNP共通コアタンパク質間のタンパク質相互作用」. Experimental Cell Research . 237 (1): 63–9 . doi :10.1006/excr.1997.3750. PMID 9417867.