ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
SNX1 利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス SNX1 、HsT17379、VPS5、nexin 1 のソート 外部ID オミム ：601272; MGI : 1928395; ホモロジーン : 99716; ジーンカード ：SNX1; OMA :SNX1 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） キリスト 9番染色体（マウス） [2] バンド 9|9 C 始める 65,995,415 bp [2] 終わり 66,033,869 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） 上位の表現 甲状腺の右葉 甲状腺の左葉 右副腎 右副腎皮質 左副腎 単球 左肺の上葉 子宮頸管 C1セグメント 左副腎皮質
上位の表現 精母細胞 原腸胚 精子細胞 脱落膜 胚盤胞 球形嚢 桑実胚 卵黄嚢 レンズ 心室帯
より多くの参照表現データ
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
タンパク質ホモ二量体化活性 インスリン受容体結合 レプチン受容体結合 上皮成長因子受容体結合 タンパク質結合 ホスファチジルイノシトール結合 同一のタンパク質結合 タンパク質ヘテロ二量体形成活性 トランスフェリン受容体結合 脂質結合 カドヘリン結合 細胞成分
細胞質 細胞質 ゴルジ体 細胞投影 初期エンドソーム膜 膜 レトロマー、管状複合体 細胞内膜小器官 レトロマー複合体 初期エンドソーム エンドソーム膜 ラメリポディウム 膜の外因性成分 小胞 リソソーム エンドソーム タンパク質含有複合体 生物学的プロセス
タンパク質分解プロセスの正の調節 小胞組織 初期エンドソームからゴルジ体への輸送 受容体の内在化 エンドソーム輸送 逆行輸送、エンドソームからゴルジ体へ タンパク質輸送 細胞内タンパク質輸送 ラメリポディウムの形態形成 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001242933 NM_003099 NM_148955 NM_152826
RefSeq（タンパク質） NP_001229862 NP_003090 NP_683758
場所（UCSC） 15章: 64.09 – 64.15 Mb 9章: 66 – 66.03 MB PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
ソーティングネキシン1 は、 ヒトではSNX1 遺伝子によってコードされる タンパク質 である。この遺伝子によってコードされるタンパク質は ソーティングネキシン である。 [5] SNX1は レトロマー 複合体の構成要素である。 [6] [7]
関数 この遺伝子はソーティングネキシンファミリーのメンバーをコードしています。このファミリーのメンバーは、 ホスホイノシチド結合ドメインであるフォックス（ PX ）ドメインを含み 、細胞内 輸送 に関与しています。この エンドソームタンパク質は、 上皮成長因子受容体 の細胞表面発現を制御します。このタンパク質は、 プロテアーゼ活性化受容体1を 初期エンドソームから リソソーム へ選別する役割も担っています 。このタンパク質は、他のファミリーメンバーとオリゴマー複合体を形成する可能性があります。 [8]
参考文献
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さらに読む
Parks WT, Frank DB, Huff C, et al. (2001). 「新規SNXであるソーティングネキシン6は、受容体型セリン-スレオニンキナーゼであるトランスフォーミング成長因子βファミリーと相互作用する」 J. Biol. Chem . 276 (22): 19332–9 . doi : 10.1074/jbc.M100606200 . PMID 11279102. Cozier GE, Carlton J, McGregor AH, et al. (2002). 「フォックス相同性（PX）ドメイン依存性、3-ホスホイノシチドを介したソーティングネキシン-1と初期ソーティングエンドソームコンパートメントの会合は、上皮成長因子受容体の分解を制御する能力に必要である」 J. Biol. Chem . 277 (50): 48730–6 . doi : 10.1074/jbc.M206986200 . PMID 12198132. Shank BB, Wiley HS, Kurten RC (2001). 「ヒトソーティングネキシン1遺伝子（SNX1）の構造および機能解析」 DNA Cell Biol . 20 (5): 287–96 . doi :10.1089/104454901750232481. PMID 11410165. Liu H, Liu ZQ, Chen CX, et al. (2006). 「ソーティングネキシン5によるEGF受容体分解の抑制制御」 Biochem. Biophys. Res. Commun . 342 (2): 537– 46. Bibcode :2006BBRC..342..537L. doi :10.1016/j.bbrc.2006.01.179. PMID 16487940. Bryant DM, Kerr MC, Hammond LA, et al. (2007). 「EGFはマクロピノサイトーシスを誘導し、SNX1を介したE-カドヘリンのリサイクリングを促進する」 J. Cell Sci . 120 (Pt 10): 1818–28 . doi :10.1242/jcs.000653. PMID 17502486. S2CID 24175340. Simpson F, Martin S, Evans TM, et al. (2005). 「新規フック関連タンパク質ファミリーとフック関連タンパク質1の特性解析」. Traffic . 6 (6): 442–58 . doi : 10.1111/j.1600-0854.2005.00289.x . PMID 15882442. S2CID 25389776. 今林 浩、森 剛、五條 誠、他 (2003). 「脱分化軟骨細胞の再分化とヒト骨髄間質細胞の軟骨球形成を介した軟骨形成、そして大規模cDNA解析による発現プロファイリング」. Exp. Cell Res . 288 (1): 35– 50. doi :10.1016/S0014-4827(03)00130-7. PMID 12878157. Zhong Q, Watson MJ, Lazar CS, et al. (2005). 「ソーティングネキシン1のエンドソーム局在の決定因子」. Mol. Biol. Cell . 16 (4): 2049–57 . doi :10.1091/mbc.E04-06-0504. PMC 1073682. PMID 15673616 . Mari M, Bujny MV, Zeuschner D, et al. (2008). 「SNX1はソルチリンおよびマンノース6-リン酸受容体のエンドソーム初期リサイクリング出口を定義する」. Traffic . 9 (3): 380–93 . doi : 10.1111/j.1600-0854.2007.00686.x . PMID 18088323. S2CID 31922423. Nguyen LN, Holdren MS, Nguyen AP, et al. (2006). 「ソーティングネキシン1のダウンレギュレーションは結腸腫瘍形成を促進する」. Clin. Cancer Res . 12 (23): 6952–9 . doi : 10.1158/1078-0432.CCR-06-0317 . hdl : 11336/31768 . PMID 17145813. Pons V, Hullin-Matsuda F, Nauze M, et al. (2003). 「ソーティングネキシン1の新たなパートナーであるエンテロフィリン-1は、細胞表面上皮成長因子受容体を減少させる」 J. Biol. Chem . 278 (23): 21155–61 . doi : 10.1074/jbc.M211008200 . PMID 12657642. Rojas R, Kametaka S, Haft CR, Bonifacino JS (2007). 「レトロマーとエンドソームの会合およびマンノース6リン酸受容体の輸送におけるSNX1とSNX2の互換性を持つが必須な機能」 Mol. Cell. Biol . 27 (3): 1112–24 . doi :10.1128/MCB.00156-06. PMC 1800681. PMID 17101778 . Gullapalli A, Wolfe BL, Griffin CT, et al. (2006). 「プロテアーゼ活性化受容体1（PSR-1）のリソソーム選別におけるSNX1の重要な役割：選別ネキシンのレトロマー、Hrs、およびTsg101非依存性機能の証拠」 Mol. Biol. Cell . 17 (3): 1228–38 . doi :10.1091/mbc.E05-09-0899. PMC 1382312. PMID 16407403 . Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 . Zhong Q, Lazar CS, Tronchère H, et al. (2002). 「エンドソーム局在とソーティングネキシン1の機能」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (10): 6767–72 . Bibcode :2002PNAS...99.6767Z. doi : 10.1073 /pnas.092142699 . PMC 124477. PMID 11997453. Wang Y, Zhou Y, Szabo K, et al. (2002). 「プロテアーゼ活性化受容体1のダウンレギュレーションはソーティングネキシン1によって制御される」. Mol. Biol. Cell . 13 (6): 1965–76 . doi :10.1091/mbc.E01-11-0131. PMC 117618. PMID 12058063 . Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2002). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 . Carlton J, Bujny M, Peter BJ, et al. (2004). 「ソーティングネキシン-1は、高曲率膜と3-ホスホイノシチドの同時感知を介して管状エンドソームからTGNへの輸送を媒介する」. Curr. Biol . 14 (20): 1791– 800. Bibcode :2004CBio...14.1791C. doi :10.1016/j.cub.2004.09.077. hdl : 1874/12362 . PMID : 15498486. S2CID : 10366991. Kurten RC, Eddington AD, Chowdhury P, et al. (2001). 「ソーティングネキシンの自己組織化とソーティングエンドソームへの結合」 J. Cell Sci . 114 (Pt 9): 1743–56 . doi : 10.1242/jcs.114.9.1743 . PMID 11309204.
外部リンク 米国国立医学図書館の 医学主題標目表 （MeSH）におけるソート+ネキシン この記事には、 パブリック ドメイン である 米国国立医学図書館 のテキストが組み込まれています。
