ホモ・サピエンス種の遺伝子
| SNX13 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | SNX13、RGS-PX1、ソーティングネキシン13 |
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| 外部ID | オミム：606589; MGI : 2661416;ホモロジーン：41011;ジーンカード：SNX13; OMA :SNX13 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置（マウス） |
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 | | キリスト | 12番染色体（マウス）[1] |
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| | バンド | 12|12 A3 | 始める | 35,097,185 bp [1] |
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| 終わり | 35,197,478 bp [1] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス（相同遺伝子） |
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| | 上位の表現 | - 耳下腺
- 外側広筋
- 耳石器官
- 上腕三頭筋
- 卵形嚢
- 小脳葉
- 側頭筋
- 涙腺
- 胸鎖乳突筋
- 小脳虫部
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- ホスファチジルイノシトール結合
- ホスファチジルイノシトール-3-リン酸結合
- 脂質結合
| | 細胞成分 |
- エンドソーム
- 初期エンドソーム
- 初期エンドソーム膜
- 膜
| | 生物学的プロセス |
- タンパク質輸送
- シグナル伝達の負の調節
- 細胞内タンパク質輸送
- GTPase活性の正の調節
| | 出典：Amigo / QuickGO |
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| オーソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | | |
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| RefSeq（タンパク質） | NP_055947
NP_001337791
NP_001337792
NP_001337793
NP_001337795
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NP_001337796
NP_001337797
NP_001337799 |
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| 場所（UCSC） | 該当なし | 12章: 35.1 – 35.2 Mb |
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| PubMed検索 | [2] | [3] |
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| ウィキデータ |
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ソーティングネキシン13は、ヒトではSNX13遺伝子によってコードされるタンパク質である。[4] [5] [6]
関数
この遺伝子は、ソーティングネキシン（SNX）ファミリーおよびGタンパク質シグナル伝達調節因子（RGS）ファミリーに属する、PHOXドメインおよびRGSドメイン含有タンパク質をコードしています。PHOXドメインはホスホイノシチド結合ドメインであり、SNXファミリーのメンバーは細胞内輸送に関与しています。RGSファミリーのメンバーは、ヘテロ三量体Gタンパク質のGαサブユニットに対するGTPase活性化タンパク質として機能する調節分子です。このタンパク質のRGSドメインはGαと相互作用し、GTP加水分解を促進し、Gαを介したシグナル伝達を減弱させます。このタンパク質の過剰発現は、上皮成長因子受容体のリソソーム分解を遅延させます。このタンパク質は二重機能を持つことから、ヘテロ三量体Gタンパク質シグナル伝達と小胞輸送を結びつける役割を果たしている可能性があります。[6]
参考文献
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000020590 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Teasdale RD, Loci D, Houghton F, Karlsson L, Gleeson PA (2001年8月). 「ソーティングネキシン1に関連するエンドソーム局在タンパク質の大規模ファミリー」. The Biochemical Journal . 358 (Pt 1): 7– 16. doi :10.1042/0264-6021:3580007. PMC 1222026. PMID 11485546 .
- ^ Zheng B, Ma YC, Ostrom RS, Lavoie C, Gill GN, Insel PA, Huang XY, Farquhar MG (2001年11月). 「RGS-PX1はGalphaSのGAPであり、小胞輸送におけるソーティングネキシンである」. Science . 294 (5548): 1939–42 . Bibcode :2001Sci...294.1939Z. doi :10.1126/science.1064757. PMID 11729322. S2CID 85169394.
- ^ ab "Entrez Gene: SNX13 ソート nexin 13".
さらに読む
- Worby CA, Dixon JE (2002年12月). 「ソーティングネキシンの細胞機能の解明」. Nature Reviews. Molecular Cell Biology . 3 (12): 919–31 . doi :10.1038/nrm974. PMID 12461558. S2CID 36361630.
- 長瀬 剛志、石川 功、須山 正治、菊野 亮、宮島 暢、田中 章、小谷 秀、野村 暢、小原 修 (1998年10月). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測. XI. 脳由来の新規cDNAクローン100個の完全配列（in vitroで巨大タンパク質をコードする）. DNA Research . 5 (5): 277–86 . doi : 10.1093/dnares/5.5.277 . PMID 9872452.
- Kosan C, Kunz J (2003). 「微小欠失症候群の7p21領域に位置するTWIST NEIGHBOR遺伝子（TWISTNB）の同定と特性評価」.細胞遺伝学およびゲノム研究. 97 ( 3–4 ): 167–70 . doi :10.1159/000066618. PMID 12438708. S2CID 27223779.
- Hillman RT, Green RE, Brenner SE (2005). 「RNAサーベイランスの過小評価された役割」. Genome Biology . 5 (2): R8. doi : 10.1186/gb-2004-5-2-r8 . PMC 395752. PMID 14759258 .
