ソルブス3

ソルブス3
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2CT3、2DLM、2NWM、2YUP
識別子
エイリアス	SORBS3、SCAM-1、SCAM1、SH3D4、ソルビン、およびSH3ドメインを含む3
外部ID	オミム：610795; MGI : 700013;ホモロジーン: 4218;ジーンカード：SORBS3; OMA :SORBS3 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 8番染色体（ヒト）[1] バンド 8p21.3 始める 22,544,986 bp [1] 終わり 22,575,788 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 14番染色体（マウス）[2] バンド 14 D2|14 36.27 cM 始める 70,417,917 bp [2] 終わり 70,449,438 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 右精巣 左精巣 右冠動脈 膝窩動脈 脛骨動脈 脛骨神経 胃粘膜 左冠動脈 子宮頸管 上行大動脈 上位の表現 外頸動脈 太ももの筋肉 内頸動脈 性器結節 網膜色素上皮 蝸牛管の前庭膜 足首 右肺 右肺葉 第四脳室脈絡叢 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 ビンキュリン結合 転写因子結合 細胞骨格の構造成分 タンパク質結合 細胞成分 細胞質 細胞質 細胞接合 細胞骨格 核 焦点接着 生物学的プロセス 細胞基質接着 細胞接着 筋肉の収縮 RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 ストレスファイバー集合の正の調節 細胞骨格組織の正の調節 MAPKカスケードの正の制御 アクチンフィラメントの組織化 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 10174 20410 アンサンブル ENSG00000120896 ENSMUSG00000022091 ユニプロット O60504 Q9R1Z8 RefSeq (mRNA) NM_001018003 NM_005775 NM_001271407 NM_001271408 NM_001271409 NM_011366 RefSeq（タンパク質） NP_001018003 NP_005766 NP_001258336 NP_001258337 NP_001258338 NP_035496 場所（UCSC） 8章: 22.54 – 22.58 Mb 14章: 70.42 – 70.45 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

ビネキシンはヒトではSORBS3遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[5] [6] [7]}

相互作用

SORBS3はDLG5 ^[8]およびMAPK1 ^[9]と相互作用することが示されている。

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000120896 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000022091 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Kioka N, Sakata S, Kawauchi T, Amachi T, Akiyama SK, Okazaki K, Yaen C, Yamada KM, Aota S (1999年3月). 「Vinexin：複数のSH3ドメインを持つ新規ビンキュリン結合タンパク質はアクチン細胞骨格の組織化を促進する」. J Cell Biol . 144 (1): 59– 69. doi :10.1083/jcb.144.1.59. PMC 2148117. PMID  9885244 . 
6. Kioka N (2003年1月). 「細胞骨格形成とシグナル伝達を制御する新規アダプタータンパク質ファミリー ― Vinexin, CAP/ponsin, ArgBP2 ―」.生化学. 74 (11): 1356–60 . PMID  12510380.
7. 「Entrez Gene: SORBS3 ソルビンおよび SH3 ドメイン含有 3」。
8. 若林正之、伊藤卓也、満島勝、相澤早苗、上田一光、天地輝夫、木岡典之 (2003年6月). 「膜結合型グアニル酸キナーゼファミリータンパク質lp-dlg/KIAA0583とビネキシンおよびβ-カテニンの細胞間接触部位における相互作用」. J. Biol. Chem . 278 (24): 21709–14 . doi : 10.1074/jbc.M211004200 . ISSN  0021-9258. PMID  12657639.
9. 満島正之、諏訪明、天地輝夫、上田一光、木岡紀之 (2004年8月). 「上皮成長因子および細胞接着によって活性化される細胞外シグナル制御キナーゼはビネキシンと相互作用し、ビネキシンをリン酸化」. J. Biol. Chem . 279 (33): 34570–7 . doi : 10.1074/jbc.M402304200 . ISSN  0021-9258. PMID  15184391.

さらに読む

• Akamatsu M, Aota S, Suwa A, et al. (2000). 「VinexinはSosとシグナル伝達複合体を形成し、上皮成長因子誘導性c-Jun N末端キナーゼ/ストレス活性化プロテインキナーゼ活性を調節する」J. Biol. Chem . 274 (50): 35933–7 . doi : 10.1074/jbc.274.50.35933 . PMID  10585480.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• 若林正治、伊藤 毅、光島 正治、他 (2003). 「膜結合型グアニル酸キナーゼファミリータンパク質lp-dlg/KIAA0583とビネキシンおよびβ-カテニンの細胞間接触部位における相互作用」J. Biol. Chem . 278 (24): 21709–14 . doi : 10.1074/jbc.M211004200 . PMID  12657639.
• Townson SM, Dobrzycka KM, Lee AV, et al. (2003). 「SAFB2、新規スキャフォールド接着因子ホモログおよびエストロゲン受容体コリプレッサー」J. Biol. Chem . 278 (22): 20059–68 . doi : 10.1074/jbc.M212988200 . PMID  12660241.
• Mitsushima M, Suwa A, Amachi T, et al. (2004). 「上皮成長因子および細胞接着によって活性化される細胞外シグナル制御キナーゼはビネキシンと相互作用し、それをリン酸化します」. J. Biol. Chem . 279 (33): 34570–7 . doi : 10.1074/jbc.M402304200 . PMID  15184391.
• Martens N, Wery M, Wang P, et al. (2004). 「サイトカインシグナル伝達抑制因子（SOCS）-7はビネキシンを介してアクチン細胞骨格と相互作用する」Exp. Cell Res . 298 (1): 239–48 . doi :10.1016/j.yexcr.2004.04.002. PMID  15242778.
• Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). 「HeLa細胞核リン酸化タンパク質の大規模解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5 . Bibcode :2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC  514446. PMID 15302935  .
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID 15489334  .
• Bour G, Plassat JL, Bauer A, et al. (2005). 「ビネキシンβはレチノイド受容体γ（RARγ）の非リン酸化AF-1ドメインと相互作用し、RARγを介した転写を抑制する」J. Biol. Chem . 280 (17): 17027–37 . doi : 10.1074/jbc.M501344200 . PMID  15734736.
• Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップの構築に向けて」Nature . 437 (7062): 1173–8 . Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• 光島正之、上田健、木岡尚文 (2006). 「ビネキシンβは細胞表面における上皮成長因子受容体のリン酸化を制御する」. Genes Cells . 11 (9): 971–82 . doi : 10.1111/j.1365-2443.2006.00995.x . PMID  16923119. S2CID  24238810.
• Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, et al. (2006). 「確率に基づくアプローチによるハイスループットタンパク質リン酸化解析と部位局在化」Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285–92 . doi :10.1038/nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
• Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). 「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、in vivo、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」. Cell . 127 (3): 635–48 . doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983. S2CID  7827573.
• 水谷 健、伊藤 秀、岩本 郁、他 (2007). 「細胞の伸展、遊走、および足場非依存性増殖におけるERKを介したビネキシンのリン酸化の重要な役割」. Oncogene . 26 (50): 7122–31 . doi :10.1038/sj.onc.1210512. hdl : 20.500.12099/23093 . PMID  17486060. S2CID  9284621.

外部リンク

• UCSC ゲノム ブラウザにおける SORBS3 ヒト遺伝子の位置。
• UCSC ゲノム ブラウザにおける SORBS3 ヒト遺伝子の詳細。