SPSB1

SPSB1
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2JK9、3F2O
識別子
エイリアス	SPSB1、SSB-1、SSB1、splA/リアノジン受容体ドメインおよび1を含むSOCSボックス
外部ID	オミム：611657; MGI : 1921896;ホモロジーン: 11832;ジーンカード：SPSB1; OMA :SPSB1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 染色体1（ヒト）[1] バンド 1p36.22 始める 9,292,894 bp [1] 終わり 9,369,532 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 4番染色体（マウス）[2] バンド 4|4 E2 始める 149,980,740 bp [2] 終わり 1億5003万9500年前[2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 脱落膜 下行胸部大動脈 上行大動脈 脛骨動脈 胃粘膜 伏在静脈 胆嚢 大静脈 右冠動脈 左冠動脈 上位の表現 脱落膜 積雲細胞 原腸胚 左心室の心筋組織 大臼歯 上行大動脈 水晶体上皮 大動脈弁 大動脈領域の中膜 足首 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 タンパク質結合 ユビキチンタンパク質転移酵素活性 ユビキチンリガーゼ-基質アダプター活性 細胞成分 細胞質 細胞質 SCFユビキチンリガーゼ複合体 生物学的プロセス タンパク質のユビキチン化 タンパク質ポリユビキチン化 翻訳後タンパク質修飾 ユビキチン依存性タンパク質分解プロセス プロテアソームを介したユビキチン依存性タンパク質分解プロセス 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 80176 74646 アンサンブル ENSG00000171621 ENSMUSG00000039911 ユニプロット Q96BD6 Q9D5L7 RefSeq (mRNA) NM_025106 NM_029035 RefSeq（タンパク質） NP_079382 NP_083311 場所（UCSC） 1章: 9.29 – 9.37 Mb 4章: 149.98 – 150.04 MB PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

SPRYドメイン含有SOCSボックスタンパク質1は、ヒトではSPSB1遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[5] [6] [7]}

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000171621 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000039911 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Wang D, Li Z, Messing EM, Wu G (2005年4月). 「SPRYドメイン含有SOCSボックスタンパク質1（SSB-1）はMETと相互作用し、肝細胞増殖因子誘導性Erk-Elk-1-血清応答エレメント経路を増強する」. J Biol Chem . 280 (16): 16393– 401. doi : 10.1074/jbc.M413897200 . PMID  15713673.
6. Kile BT, Schulman BA, Alexander WS, Nicola NA, Martin HM, Hilton DJ (2002年6月). 「SOCSボックス：破壊と劣化の物語」. Trends Biochem Sci . 27 (5): 235–41 . doi :10.1016/S0968-0004(02)02085-6. PMID  12076535.
7. 「Entrez Gene: SPSB1 splA/リアノジン受容体ドメインおよびSOCSボックス含有1」。

さらに読む

• 丸山 憲治, 菅野 誠 (1994). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」.遺伝子. 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, et al. (1996). 「改良されたショットガンライブラリー構築のための「ダブルアダプター」法」Anal. Biochem . 236 (1): 107–13 . doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Yu W, Andersson B, Worley KC, et al. (1997). 「大規模連結cDNAシークエンシング」Genome Res . 7 (4): 353–8 . doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC  139146 . PMID  9110174.
• 鈴木雄三、中川吉智、丸山健、他 (1997). 「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」. Gene . 200 ( 1–2 ): 149–56 . doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID  9373149.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクト：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）の現状、品質、そして拡大」Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928.  PMID 15489334  .
• Woo JS, Imm JH, Min CK, et al. (2006). 「B30.2/SPRYドメインの構造と機能に関する知見」. EMBO J. 25 ( 6): 1353–63 . doi :10.1038/sj.emboj.7600994. PMC  1422157. PMID  16498413 .
• Gregory SG, Barlow KF, McLay KE, et al. (2006). 「ヒト染色体1のDNA配列と生物学的アノテーション」. Nature . 441 (7091): 315–21 . Bibcode :2006Natur.441..315G. doi : 10.1038/nature04727 . PMID  16710414.