SS18
ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
SS18
識別子
エイリアスSS18、SSXT、SYT、nBAFクロマチンリモデリング複合体サブユニット、BAFクロマチンリモデリング複合体のSS18サブユニット、SMARCL1
外部IDオミム：600192; MGI : 107708;ホモロジーン：38080;ジーンカード：SS18; OMA :SS18 - オルソログ
オーソログ
種人間ねずみ
エントレズ

6760

268996

アンサンブル

ENSG00000141380

ENSMUSG00000037013

ユニプロット

Q15532
Q4VAX0

Q62280

RefSeq (mRNA)

NM_001007559
NM_001308201
NM_005637

NM_001161369
NM_001161370
NM_001161371
NM_009280

RefSeq（タンパク質）

NP_001007560
NP_001295130
NP_005628
NP_005628.2

NP_001154841
NP_001154842
NP_001154843
NP_033306

場所（UCSC）18章: 26.02 – 26.09 Mb18章: 14.76 – 14.82 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
人間の表示/編集マウスの表示/編集

タンパク質SSXTは、ヒトではSS18遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]

関数

SS18はヒトSWI/SNFクロマチンリモデリング複合体のメンバーである。[8] [9] [10]

臨床的意義

SS18は滑膜​​肉腫によく見られる染色体転座に関与している。[11]

相互作用

SS18 は以下と相互作用することがわかっています:

参考文献

  1. ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000141380 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000037013 – Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  5. ^ Shipley JM, Clark J, Crew AJ, Birdsall S, Rocques PJ, Gill S, Chelly J, Monaco AP, Abe S, Gusterson BA (1994年5月). 「ヒト滑膜肉腫で発見されたt(X;18)(p11.2;q11.2)転座は、X染色体上の2つの異なる遺伝子座に関与している」. Oncogene . 9 (5): 1447–53 . PMID  8152806.
  6. ^ Clark J, Rocques PJ, Crew AJ, Gill S, Shipley J, Chan AM, Gusterson BA, Cooper CS (1994年8月). 「ヒト滑膜肉腫で発見されたt(X;18)(p11.2;q11.2)転座に関与する新規遺伝子SYTおよびSSXの同定」. Nature Genetics . 7 (4): 502–8 . doi :10.1038/ng0894-502. PMID  7951320. S2CID  20503729.
  7. ^ de Bruijn DR, Geurts van Kessel A (2006). 「ヒト滑膜肉腫関連SS18およびSS18L1遺伝子座の共通起源」. Cytogenetic and Genome Research . 112 ( 3–4 ): 222–6 . doi :10.1159/000089874. PMID  16484776.
  8. ^ Middeljans E, Wan X, Jansen PW, Sharma V, Stunnenberg HG, Logie C (2012). 「SS18と動物特異的因子がヒトBAF型SWI/SNF複合体を規定する」. PLOS ONE . 7 (3) e33834. Bibcode :2012PLoSO...733834M. doi : 10.1371/journal.pone.0033834 . PMC 3307773. PMID  22442726 . 
  9. ^ ab 加藤 H、Tjernberg A、Zhang W、Krutchinsky AN、An W、竹内 T、大月 Y、Sugano S、de Bruijn DR、Chait BT、Roeder RG (2002 年 2 月)。 「SYTはヒトSNF/SWI複合体と会合し、その融合パートナーであるSSX1のC末端領域はヒストンを標的とします。」生物化学ジャーナル。277 (7): 5498–505 .土井: 10.1074/jbc.M108702200。hdl : 2066/170683。PMID  11734557。
  10. ^ ab Perani M, Ingram CJ, Cooper CS, Garrett MD, Goodwin GH (2003年11月). 「プロトオンコプロテインSYTの保存されたSNHドメインはヒトクロマチンリモデリング複合体の構成要素と相互作用し、QPGYリピートドメインはホモオリゴマーを形成する」Oncogene . 22 (50): 8156–67 . doi : 10.1038/sj.onc.1207031 . PMID  14603256.
  11. ^ Yang K, Lui WO, Xie Y, Zhang A, Skytting B, Mandahl N, Larsson C, Larsson O (2002年6月). 「滑膜肉腫におけるSYT-SSX1およびSYT-SSX2融合の共存」. Oncogene . 21 (26): 4181–90 . doi : 10.1038/sj.onc.1205569 . PMID  12037676.
  12. ^ Eid JE, Kung AL, Scully R, Livingston DM (2000年9月). 「p300は細胞接着の能動制御の一環として核プロトオンコプロテインSYTと相互作用する」. Cell . 102 (6): 839–48 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)00072-6 . PMID  11030627. S2CID  17342132.
  13. ^ デ・ブルイン DR、ドス・サントス NR、タイセン J、ベールマンス M、デベルナルディ S、リンダー B、ヤング BD、ゲルツ・ファン・ケッセル A (2001 年 5 月)。 「滑膜肉腫関連タンパク質SYTは、急性白血病関連タンパク質AF10と相互作用します。」がん遺伝子。20 (25): 3281–9 .土井: 10.1038/sj.onc.1204419。PMID  11423977。

さらに読む

  • Fligman I, Lonardo F, Jhanwar SC, Gerald WL, Woodruff J, Ladanyi M (1995年12月). 「滑膜肉腫の分子診断と変異SYT-SSX2融合転写産物の特徴解析」. The American Journal of Pathology . 147 (6): 1592–9 . PMC  1869933. PMID  7495284 .
  • Brett D, Whitehouse S, Antonson P, Shipley J, Cooper C, Goodwin G (1997年9月). 「t(X;18)滑膜肉腫転座に関与するSYTタンパク質は核小体に局在する転写活性化因子である」. Human Molecular Genetics . 6 (9): 1559–64 . doi : 10.1093/hmg/6.9.1559 . PMID  9285794.
  • Thaete C, Brett D, Monaghan P, Whitehouse S, Rennie G, Rayner E, Cooper CS, Goodwin G (1999年4月). 「SYTおよびSYT-SSX滑膜肉腫転座タンパク質の機能ドメインと核内におけるSNFタンパク質BRMとの共局在」. Human Molecular Genetics . 8 (4): 585–91 . doi : 10.1093/hmg/8.4.585 . PMID  10072425.
  • Eid JE, Kung AL, Scully R, Livingston DM (2000年9月). 「p300は細胞接着の能動制御の一環として核内プロトオンコタンパク質SYTと相互作用する」. Cell . 102 (6): 839–48 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)00072-6 . PMID  11030627. S2CID  17342132.
  • タンボリーニ E、アグス V、メッツェラーニ A、リーヴァ C、ソッツィ G、アッザレッリ A、ピエロッティ MA、ピロッティ S (2001 年 4 月)。 「正常組織および滑膜肉腫で発現されるSYT遺伝子の新規スプライス変異体の同定」。英国癌ジャーナル。84 (8): 1087–94 .土井:10.1054/bjoc.2000.1710。PMC  2363857。PMID  11308259。
  • Brodin B, Haslam K, Yang K, Bartolazzi A, Xie Y, Starborg M, Lundeberg J, Larsson O (2001年5月). 「滑膜肉腫のスプライス融合転写バリアントSYT/SSX4、SYT/SSX4v、およびSYT/SSX2vのクローニングと特性解析。融合遺伝子産物が野生型SYTの発現を制御する役割の可能性」Gene . 268 ( 1–2 ): 173–82 . doi :10.1016/S0378-1119(01)00412-7. PMID  11368913.
  • デ・ブルイン DR、ドス・サントス NR、タイセン J、ベールマンス M、デベルナルディ S、リンダー B、ヤング BD、ゲルツ・ファン・ケッセル A (2001 年 5 月)。 「滑膜肉腫関連タンパク質SYTは、急性白血病関連タンパク質AF10と相互作用します。」がん遺伝子。20 (25): 3281–9 .土井: 10.1038/sj.onc.1204419。PMID  11423977。
  • 鈴木 浩、福西 雄一、香川 郁、斉藤 亮、小田 秀、遠藤 剛、近藤 聡、坊野 秀、岡崎 雄一、林崎 雄一 (2001年10月). 「マウス完全長cDNAを用いたタンパク質間相互作用パネル」(PDF) .ゲノム研究. 11 (10): 1758–65 . doi :10.1101/gr.180101. PMC  311163. PMID  11591653 .
  • 加藤 H、Tjernberg A、Zhang W、Krutchinsky AN、An W、竹内 T、大槻 Y、菅野 S、de Bruijn DR、Chait BT、Roeder RG (2002 年 2 月)。 「SYTはヒトSNF/SWI複合体と会合し、その融合パートナーであるSSX1のC末端領域はヒストンを標的とします。」生物化学ジャーナル。277 (7): 5498–505 .土井: 10.1074/jbc.M108702200。hdl : 2066/170683。PMID  11734557。
  • Yang K, Lui WO, Xie Y, Zhang A, Skytting B, Mandahl N, Larsson C, Larsson O (2002年6月). 「滑膜肉腫におけるSYT-SSX1およびSYT-SSX2融合の共存」. Oncogene . 21 (26): 4181–90 . doi : 10.1038/sj.onc.1205569 . PMID  12037676.
  • 今林 浩、森 剛、五條 誠、清野 剛、杉山 剛、入江 亮、磯貝 剛、畑 淳、外山 雄、梅澤 明 (2003年8月). 「脱分化軟骨細胞の再分化とヒト骨髄間質細胞の軟骨球形成を介した軟骨形成：大規模cDNA解析による発現プロファイリング」. Experimental Cell Research . 288 (1): 35– 50. doi :10.1016/S0014-4827(03)00130-7. PMID  12878157.
  • Perani M, Ingram CJ, Cooper CS, Garrett MD, Goodwin GH (2003年11月). 「プロトオンコプロテインSYTの保存されたSNHドメインはヒトクロマチンリモデリング複合体の構成要素と相互作用し、QPGYリピートドメインはホモオリゴマーを形成する」. Oncogene . 22 (50): 8156–67 . doi : 10.1038/sj.onc.1207031 . PMID  14603256.
  • 岩崎 剛志、鯉淵 暢、Chin WW (2005年9月). 「滑膜肉腫転座（SYT）は核内受容体コアクチベーターをコードする」.内分泌学. 146 (9): 3892–9 . doi : 10.1210/en.2004-1513 . PMID  15919756.
  • フェルネブロ J、フランシス P、エデン P、ボルグ A、パナゴプロス I、メルテンス F、ヴァロン＝クリスターソン J、アッカーマン M、ライドホルム A、バウアー HC、マンダール N、ニルベルト M (2006 年 3 月)。 「遺伝子発現プロファイルは、滑膜肉腫における SS18/SSX 融合型に関連しています。」国際がんジャーナル。118 (5): 1165–72 .土井: 10.1002/ijc.21475。PMID  16152617。S2CID 12084422  。
  • Perani M, Antonson P, Hamoudi R, Ingram CJ, Cooper CS, Garrett MD, Goodwin GH (2005年12月). 「プロトオンコタンパク質SYTは、EWSおよびTLS/FUSファミリータンパク質と類似性を示すヒト核内受容体コアクチベーターであるSYT相互作用タンパク質/コアクチベーター活性化因子（SIP/CoAA）と相互作用する」. The Journal of Biological Chemistry . 280 (52): 42863–76 . doi : 10.1074/jbc.M502963200 . PMID  16227627.
  • Sun Y, Gao D, Liu Y, Huang J, Lessnick S, Tanaka S (2006年2月). 「IGF2は滑膜肉腫腫瘍タンパク質SYT-SSX1による腫瘍形成に重要である」. Oncogene . 25 (7): 1042–52 . doi : 10.1038/sj.onc.1209143 . PMID  16247461.
「https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=SS18&oldid=1314629429」より取得