SSU rRNA
 | この記事には構造（普遍性）に関する情報が不足しています。（2020年12月） |
小サブユニットリボソームリボ核酸（SSU rRNA ）は、リボソームを構成する2つの主要なRNA成分のうち、小さい方のRNAです。SSU rRNAは、いくつかのリボソームタンパク質と結合して、リボソームの小サブユニットを形成します。SSU rRNAはSSU- rDNAによってコードされています。
| SSU rRNA | |
|---|---|
| 識別子 | |
| シンボル | SSU |
| Rfam | CL00111 |
| その他のデータ | |
| PDB構造 | PDBe |
特徴
| タイプ | SSU rRNAのサイズ | 種 | 長さ | 加盟 | 参照 |
|---|---|---|---|---|---|
| 細菌（原核生物） | 16S | 大腸菌 | 1,541 nt | J01859.1 | [ 1 ] |
| 古細菌（原核生物） | 16S | ハロバクテリウム・サリナラム | 1,473 nt | M38280.1 | [ 2 ] |
| 真核生物 | 18S | ホモ・サピエンス | 1,969 nt | M10098.1 | [ 3 ] |
| ミトコンドリア | 12S | ホモ・サピエンス | 954 nt | NC_012920.1 | [ 4 ] [ 5 ] |
| プラスチド | 16S | シロイヌナズナ | 1,491 nt | NC_000932.1 | [ 6 ] |
系統学における使用
SSU rRNA配列は古代に起源を持ち、既知のすべての生命体に見られるため、生物間の進化関係を決定するために広く利用されている。 [ 7 ]
参照
- LSU rRNA :巨大なサブユニットであるリボソームリボ核酸。
参考文献
- ^ 「大腸菌16SリボソームRNA」 2017年6月13日。
- ^ “ハロバクテリウム・サリナルム16S リボソーム RNA” . 1991年8月7日。
- ^ 「ホモサピエンス18SリボソームRNA（核）」 1986年5月2日。
- ^ホモ・サピエンスミトコンドリア、完全ゲノム。「改訂ケンブリッジ参照配列（rCRS）：アクセッション番号NC_012920」、国立生物工学情報センター。2017年2月20日閲覧。
- ^ Anderson S, Bankier AT, Barrell BG, de Bruijn MH, Coulson AR, Drouin J, et al. (1981年4月). 「ヒトミトコンドリアゲノムの配列と構成」. Nature . 290 ( 5806): 457– 465. Bibcode : 1981Natur.290..457A . doi : 10.1038/290457a0 . PMID 7219534. S2CID 4355527 .
- ^ 「シロイヌナズナ16SリボソームRNA（葉緑体）」 2019年9月26日。
- ^ Woese CR , Kandler O, Wheelis ML (1990年6月). 「生物の自然システムに向けて：古細菌、細菌、真核生物ドメインへの提案」.米国科学アカデミー紀要. 87 (12): 4576–4579 . Bibcode : 1990PNAS...87.4576W . doi : 10.1073/pnas.87.12.4576 . PMC 54159. PMID 2112744 .
