STX7

STX7
利用可能な構造
PDB	オーソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	1GL2
識別子
エイリアス	STX7、シンタキシン7
外部ID	オミム：603217; MGI : 1858210;ホモロジーン: 37823;ジーンカード：STX7; OMA :STX7 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
キリスト	染色体6（ヒト）
終わり	132,513,198 bp
遺伝子の位置（マウス）
キリスト	10番染色体（マウス）
終わり	24,066,120 bp
RNA発現パターン
	上位の表現
	内皮細胞; ; 単球; ; 上腕二頭筋腱; ; アキレス腱; ; 中側頭回; ; 神経節隆起; ; 羊水; ; 内淡蒼球; ; 糸球体; ; 二次卵母細胞;
	上位の表現
	卵黄嚢; ; 海馬歯状回顆粒細胞; ; 顎下腺; ; 骨髄間質; ; 右腎臓; ; 三叉神経節; ; 顆粒球; ; 結膜円蓋; ; バレル皮質; ; 黒質;
	より多くの参照表現データ
	; ; ; ;
	より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー
分子機能	SNAP受容体活性; タンパク質結合; 塩素イオンチャネル阻害活性; シンタキシン結合; SNARE結合;
細胞成分	膜の不可欠な構成要素; リサイクルエンドソーム; 小胞; エンドソーム; 後期エンドソーム; 初期エンドソーム膜; 膜; 三次顆粒; 細胞膜; エンドサイトーシス小胞; リソソーム膜; SNARE複合体; アズール顆粒; 初期エンドソーム; 免疫シナプス; 細胞質の核周囲領域; リソソーム; 細胞外エクソソーム; シナプス小胞; 内膜系;
生物学的プロセス	シナプスへの受容体の局在の正の制御; 細胞小器官の局在; T細胞を介した細胞傷害の正の制御; 小胞ドッキング; 細胞小器官の集合; 細胞内タンパク質輸送; 小胞融合; 小胞輸送; タンパク質の細胞膜への局在の制御; 分子機能の調節;
	出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
	8417
	53331
	ENSG00000079950
	ENSMUSG00000019998
	O15400
	O70439 ; Q8BH40
	NM_003569 ; NM_001326578 ; NM_001326579 ; NM_001326580
	NM_016797 ; NM_001358563
	NP_001313507 ; NP_001313508 ; NP_001313509 ; NP_003560
	NP_058077 ; NP_001345492
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

ヒトタンパク質とコード遺伝子

シンタキシン7はヒトではSTX7遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]

メラノサイト細胞ではSTX7遺伝子の発現はMITFによって制御されている可能性がある。^[7]

相互作用

STX7はSTX8、^{[8] 、}VPS18、^{[9] 、}小胞関連膜タンパク質8 ^[8]^[10]、およびVPS11と相互作用することが示されている。^[9]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000079950 – Ensembl、2017年5月
^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000019998 – Ensembl、2017年5月
^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
^ Wang H, Frelin L, Pevsner J (1997年10月). 「ヒトシンタキシン7：リソソームへの小胞輸送に関与するPep12p/Vps6pホモログ」. Gene . 199 ( 1–2 ): 39–48 . doi :10.1016/S0378-1119(97)00343-0. PMID 9358037.
^ 「Entrez Gene: STX7 シンタキシン7」。
^ Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM, Widmer DS, Praetorius C, Einarsson SO, Valgeirsdottir S, Bergsteinsdottir K, Schepsky A, Dummer R, Steingrimsson E (2008年12月). 「2段階DNAマイクロアレイ戦略を用いた新規MITF標的の同定」. Pigment Cell & Melanoma Research . 21 (6): 665– 76. doi : 10.1111/j.1755-148X.2008.00505.x . PMID 19067971. S2CID 24698373.
^ ab Antonin W, Holroyd C, Fasshauer D, Pabst S, Von Mollard GF, Jahn R (2000年12月). 「後期エンドソームの融合を媒介するSNARE複合体は、SNAREの構造と機能の保存された特性を定義する」. The EMBO Journal . 19 (23): 6453–64 . doi :10.1093/emboj/19.23.6453. PMC 305878. PMID 11101518 .
^ ab Kim BY, Krämer H, Yamamoto A, Kominami E, Kohsaka S, Akazawa C (2001年8月). 「シンタキシン7と相互作用するクラスC Vpsタンパク質の哺乳類ホモログの分子特性解析」. The Journal of Biological Chemistry . 276 (31): 29393– 402. doi : 10.1074/jbc.M101778200 . PMID 11382755.
^ Wade N, Bryant NJ, Connolly LM, Simpson RJ, Luzio JP, Piper RC, James DE (2001年6月). 「b16メラノーマ細胞におけるシンタキシン7とマウスVps10pテールインタラクター1b、シンタキシン6、小胞関連膜タンパク質（VAMP）8、およびVAMP7との複合体形成」. The Journal of Biological Chemistry . 276 (23): 19820–7 . doi : 10.1074/jbc.M010838200 . PMID 11278762.

さらに読む

Wong SH, Xu Y, Zhang T, Hong W (1998年1月). 「シンタキシン7：初期エンドソーム区画に関連する新規シンタキシンメンバー」. The Journal of Biological Chemistry . 273 (1): 375–80 . doi : 10.1074/jbc.273.1.375 . PMID 9417091.
Steegmaier M, Yang B, Yoo JS, Huang B, Shen M, Yu S, Luo Y, Scheller RH (1998年12月). 「シンタキシン/SNAP-25ファミリーの3つの新規タンパク質」. The Journal of Biological Chemistry . 273 (51): 34171–9 . doi : 10.1074/jbc.273.51.34171 . PMID 9852078.
Prekeris R, Yang B, Oorschot V, Klumperman J, Scheller RH (1999年11月). 「エンドソーム輸送におけるシンタキシン7とシンタキシン8の異なる役割」. Molecular Biology of the Cell . 10 (11): 3891–908 . doi :10.1091/mbc.10.11.3891. PMC 25687. PMID 10564279 .
中村暢、山本明、和田雄、二井正（2000年3月）. 「シンタキシン7は後期エンドソームへのエンドサイトーシス輸送を媒介する」. The Journal of Biological Chemistry . 275 (9): 6523–9 . doi : 10.1074/jbc.275.9.6523 . PMID 10692457.
Scales SJ, Chen YA, Yoo BY, Patel SM, Doung YC, Scheller RH (2000年5月). 「SNAREは膜融合の特異性に寄与する」. Neuron . 26 (2): 457–64 . doi : 10.1016/S0896-6273(00)81177-0 . PMID 10839363.
Mullock BM, Smith CW, Ihrke G, Bright NA, Lindsay M, Parkinson EJ, Brooks DA, Parton RG, James DE, Luzio JP, Piper RC (2000年9月). 「シンタキシン7は後期エンドソーム区画に局在し、Vamp8と会合し、後期エンドソーム-リソソーム融合に必須である」. Molecular Biology of the Cell . 11 (9): 3137–53 . doi :10.1091/mbc.11.9.3137. PMC 14981. PMID 10982406 .
Antonin W, Holroyd C, Fasshauer D, Pabst S, Von Mollard GF, Jahn R (2000年12月). 「後期エンドソームの融合を媒介するSNARE複合体は、SNAREの構造と機能の保存された特性を定義する」. The EMBO Journal . 19 (23): 6453–64 . doi :10.1093/emboj/19.23.6453. PMC 305878. PMID 11101518 .
Wade N, Bryant NJ, Connolly LM, Simpson RJ, Luzio JP, Piper RC, James DE (2001年6月). 「b16メラノーマ細胞におけるシンタキシン7とマウスVps10pテールインタラクター1b、シンタキシン6、小胞関連膜タンパク質（VAMP）8、およびVAMP7との複合体形成」. The Journal of Biological Chemistry . 276 (23): 19820–7 . doi : 10.1074/jbc.M010838200 . PMID 11278762.
Kim BY, Krämer H, Yamamoto A, Kominami E, Kohsaka S, Akazawa C (2001年8月). 「シンタキシン7と相互作用するクラスC Vpsタンパク質の哺乳類ホモログの分子生物学的特徴」. The Journal of Biological Chemistry . 276 (31): 29393– 402. doi : 10.1074/jbc.M101778200 . PMID 11382755.
Rotem-Yehudar R, Galperin E, Horowitz M (2001年8月). 「インスリン様成長因子1受容体とEHD1およびSNAP29の関連性」. The Journal of Biological Chemistry . 276 (35): 33054–60 . doi : 10.1074/jbc.M009913200 . PMID 11423532.
鈴木浩、福西雄一、香川郁、斉藤亮、小田秀、遠藤剛、近藤聡、坊野秀、岡崎雄一、林崎雄一 (2001年10月). 「マウス完全長cDNAを用いたタンパク質間相互作用パネル」.ゲノム研究. 11 (10): 1758–65 . doi :10.1101/gr.180101. PMC 311163. PMID 11591653 .
Antonin W, Fasshauer D, Becker S, Jahn R, Schneider TR (2002年2月). 「エンドソームSNARE複合体の結晶構造は、全てのSNAREに共通する構造原理を明らかにする」Nature Structural Biology . 9 (2): 107–11 . doi :10.1038/nsb746. hdl : 11858/00-001M-0000-0012-F459-F . PMID 11786915. S2CID 17724790.
Antonin W, Dulubova I, Arac D, Pabst S, Plitzner J, Rizo J, Jahn R (2002年9月). 「シンタキシン7とvti1bのN末端ドメインは3ヘリックス束を形成し、SNARE複合体の組み立てを制御する能力が異なる」. The Journal of Biological Chemistry . 277 (39): 36449–56 . doi : 10.1074/jbc.M204369200 . hdl : 11858/00-001M-0000-0012-F2E6-3 . PMID 12114520.
Bogdanovic A, Bennett N, Kieffer S, Louwagie M, Morio T, Garin J, Satre M, Bruckert F (2002年11月). 「シンタキシン7、シンタキシン8、Vti1、およびVAMP7（小胞関連膜タンパク質7）は、Dictyostelium discoideumにおける初期のマクロピノサイトーシスコンパートメント融合において活性SNARE複合体を形成する」. The Biochemical Journal . 368 (Pt 1): 29– 39. doi :10.1042/BJ20020845. PMC 1222979. PMID 12175335 .
Collins RF, Schreiber AD, Grinstein S, Trimble WS (2002年9月). 「シンタキシン13と7は貪食過程の異なる段階で機能する」. Journal of Immunology . 169 (6): 3250–6 . doi : 10.4049/jimmunol.169.6.3250 . PMID 12218144.
Adkins JN, Varnum SM, Auberry KJ, Moore RJ, Angell NH, Smith RD, Springer DL, Pounds JG (2002年12月). 「ヒト血清プロテオームの構築に向けて：多次元分離と質量分析を組み合わせた解析」. Molecular & Cellular Proteomics . 1 (12): 947–55 . doi : 10.1074/mcp.M200066-MCP200 . PMID 12543931.
Gevaert K, Goethals M, Martens L, Van Damme J, Staes A, Thomas GR, Vandekerckhove J (2003年5月). 「N末端ペプチドの質量分析によるプロテオームの探索とタンパク質プロセシングの解析」Nature Biotechnology 21 ( 5): 566–9 . doi :10.1038/nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563.
鈴木潤、大西秀、和田明、平山剛、大野秀、上田暢、安田秀、井入剛、和田雄、二井正之、真島秀 (2003年7月). 「ヘリコバクター・ピロリ菌産生細胞毒素VacA誘導性ヒト胃上皮細胞空胞化におけるシンタキシン7の関与」. The Journal of Biological Chemistry . 278 (28): 25585–90 . doi : 10.1074/jbc.M212445200 . PMID 12730232.

この記事はヒト 6番染色体上の遺伝子に関するものです。この記事を拡張することで、Wikipedia に貢献できます。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000079950 – Ensembl、2017年5月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000019998 – Ensembl、2017年5月

[3] 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[4] 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[pmid9358037-5] Wang H, Frelin L, Pevsner J (1997年10月). 「ヒトシンタキシン7：リソソームへの小胞輸送に関与するPep12p/Vps6pホモログ」. Gene . 199 ( 1–2 ): 39–48 . doi :10.1016/S0378-1119(97)00343-0. PMID 9358037.

[entrez-6] 「Entrez Gene: STX7 シンタキシン7」。

[pmid19067971-7] Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM, Widmer DS, Praetorius C, Einarsson SO, Valgeirsdottir S, Bergsteinsdottir K, Schepsky A, Dummer R, Steingrimsson E (2008年12月). 「2段階DNAマイクロアレイ戦略を用いた新規MITF標的の同定」. Pigment Cell & Melanoma Research . 21 (6): 665– 76. doi : 10.1111/j.1755-148X.2008.00505.x . PMID 19067971. S2CID 24698373.

[pmid11101518-8] Antonin W, Holroyd C, Fasshauer D, Pabst S, Von Mollard GF, Jahn R (2000年12月). 「後期エンドソームの融合を媒介するSNARE複合体は、SNAREの構造と機能の保存された特性を定義する」. The EMBO Journal . 19 (23): 6453–64 . doi :10.1093/emboj/19.23.6453. PMC 305878. PMID 11101518 .

[pmid11382755-9] Kim BY, Krämer H, Yamamoto A, Kominami E, Kohsaka S, Akazawa C (2001年8月). 「シンタキシン7と相互作用するクラスC Vpsタンパク質の哺乳類ホモログの分子特性解析」. The Journal of Biological Chemistry . 276 (31): 29393– 402. doi : 10.1074/jbc.M101778200 . PMID 11382755.

[pmid11278762-10] Wade N, Bryant NJ, Connolly LM, Simpson RJ, Luzio JP, Piper RC, James DE (2001年6月). 「b16メラノーマ細胞におけるシンタキシン7とマウスVps10pテールインタラクター1b、シンタキシン6、小胞関連膜タンパク質（VAMP）8、およびVAMP7との複合体形成」. The Journal of Biological Chemistry . 276 (23): 19820–7 . doi : 10.1074/jbc.M010838200 . PMID 11278762.