SYT5

SYT5
識別子
エイリアス	SYT5、シナプトタグミン5
外部ID	オミム：600782; MGI : 1926368;ホモロジーン: 55722;ジーンカード：SYT5; OMA :SYT5 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 19番染色体（ヒト）[1] バンド 19q13.42|11p 始める 55,171,196 bp [1] 終わり 55,180,289 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 7番染色体（マウス）[2] バンド 7|7 A1 始める 4,542,764 bp [2] 終わり 4,550,540 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 前頭前皮質 右前頭葉 帯状回 前帯状皮質 側坐核 尾状核 背外側前頭前皮質 ブロードマン領域9 被殻 ブロードマン領域10 上位の表現 上前頭回 一次視覚野 嗅内皮質 海馬歯状回顆粒細胞 嗅周皮質 CA3領域 舌 前扁桃体領域 腹内側核 外側中隔核 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 クラスリン結合 金属イオン結合 タンパク質ヘテロ二量体形成活性 カルシウム依存性リン脂質結合 シンタキシン結合 SNARE結合 ホスファチジルイノシトール-4,5-ビスリン酸結合 ホスファチジルセリン結合 カルシウムイオン結合 細胞成分 膜の不可欠な構成要素 エンドソーム 膜 シナプス シナプス小胞膜 細胞接合 ソーマ エンドソーム膜のリサイクル 細胞質の核周囲領域 ニューロン投射 高密度コア顆粒 細胞質小胞 細胞膜 近位ニューロン投射 神経細胞の緻密核小胞膜の不可欠な成分 軸索 細胞外小胞 生物学的プロセス シナプス小胞エンドサイトーシス 化学シナプス伝達 小胞融合 カルシウムイオン依存性エキソサイトーシスの調節 カルシウムイオン制御による神経伝達物質の放出 ドーパミン分泌の調節 シナプス小胞のエキソサイトーシス 小胞輸送 カルシウムイオン制御によるエキソサイトーシス カルシウムイオンに対する細胞反応 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 6861 53420 アンサンブル ENSG00000129990 ENSMUSG00000004961 ユニプロット O00445 Q9R0N5 RefSeq (mRNA) NM_001297774 NM_003180 NM_016908 NM_001360421 NM_001360422 RefSeq（タンパク質） NP_001284703 NP_003171 NP_001347350 NP_001347351 場所（UCSC） 19章: 55.17 – 55.18 Mb 7章: 4.54 – 4.55 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
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シナプトタグミン-5は、ヒトではSYT5遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[5] [6]}

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000129990 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000004961 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Craxton M, Olsen A, Goedert M (1997年7月). 「ヒトシナプトタグミンV (SYT5): 配列、ゲノム構造、および染色体上の位置」. Genomics . 42 (1): 165–9 . doi :10.1006/geno.1997.4722. PMID  9177789.
6. 「Entrez Gene: SYT5 シナプトタグミン V」。

さらに読む

• Hudson AW, Birnbaum MJ (1995). 「シナプトタグミンの非神経細胞性アイソフォームの同定」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 92 (13): 5895–9 . Bibcode :1995PNAS...92.5895H. doi : 10.1073/pnas.92.13.5895 . PMC  41608. PMID  7597049 .
• Perin MS (1996). 「鏡像モチーフは、複数のシナプトタグミンのCOOH末端とニューレキシンおよびカルモジュリンとの相互作用を媒介する」.生化学. 35 (43): 13808–16 . doi :10.1021/bi960853x. PMID  8901523.
• 福田 正之、菅野 栄治、御子柴 健 (1999). 「保存されたN末端システインモチーフはシナプトタグミンIII、V、VI、Xのホモおよびヘテロ二量体形成に必須である。」J. Biol. Chem . 274 (44): 31421–7 . doi : 10.1074/jbc.274.44.31421 . PMID  10531343.
• Craxton M, Goedert M (1999). 「膜貫通エクソンスキッピングを伴うシナプトタグミンの選択的スプライシング」. FEBS Lett . 460 (3): 417–22 . Bibcode :1999FEBSL.460..417C. doi : 10.1016/S0014-5793(99)01382-4 . PMID  10556508. S2CID  19207631.
• 水谷 明、福田 正之、井端 健、他 (2000). 「SYNCRIPは、異種核リボ核タンパク質Rの細胞質側タンパク質であり、普遍的なシナプトタグミンアイソフォームと相互作用する」J. Biol. Chem . 275 (13): 9823–31 . doi : 10.1074/jbc.275.13.9823 . PMID  10734137.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID 15489334  .
• Sreenath AS, Kumar KR, Reddy GV, et al. (2005). 「シナプトタグミンとグルタチオンS-トランスフェラーゼの関連性を示す証拠：ヒト乳がんにおける新たな機能への示唆」. Clin. Biochem . 38 (5): 436– 43. doi :10.1016/j.clinbiochem.2005.01.009. PMID  15820774.
• 木村 功、若松 明、鈴木 雄一、他 (2006). 「転写調節の多様化：ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模同定と特性解析」Genome Res . 16 (1): 55– 65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129.  PMID 16344560  .