マウス遺伝学プロジェクト

マウス遺伝学プロジェクト（MGP）は、新しい疾患モデル生物の同定を目的とした大規模な変異マウスの作製と表現型解析プログラムである。^{[ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ]}

ウェルカム・トラスト・サンガー研究所を拠点とするこのプロジェクトでは、国際ノックアウトマウスコンソーシアムによって生成されたノックアウトマウスを使用しています。各変異株について、7匹のオスマウスと7匹のメスマウスのグループが、健康なC57BL/6マウスとは異なる形質を検出することを目的とした標準分析パイプラインを通過します。^{[ 1 ]}パイプラインは、生存率、繁殖力、体重、感染、聴力、形態、血液学、行動、血液化学、免疫に関する多くの測定値を収集し、統計的混合モデルを使用して野生型のコントロールと比較します。^{[ 5 ]}これらのデータは、特注のオープンアクセスデータベースを通じて科学研究コミュニティと医学研究コミュニティの間ですぐに共有され、^{[ 6 ]}マウスゲノムインフォマティクスデータベースやWikipediaベースのGene Wikiなどの他のオンラインリソースにも概要が表示されます。^{[ 4 ]}

2013年7月現在、MGPは900以上の変異株を国際研究コミュニティに公開しており、^{[ 4 ]} 650以上の変異株について「実質的に完全な」解析が行われており、^{[ 6 ]}そのうち75%以上に少なくとも1つの異常な表現型が見られると報告しています。^{[ 1 ]}これらの中には、疾患に関与する遺伝子の新たな発見も含まれており、以下のような発見が含まれています。

• SLX4の変異は新しいタイプのファンコニ貧血を引き起こす。^{[ 3 ] [ 7 ] [ 8 ]}
• 骨の強度に影響を与える9つの新しい遺伝子。^{[ 9 ]}
• CENPJの変異はセッケル症候群のモデルとなる。^{[ 10 ]}
• SPNS2は哺乳類の免疫システム機能において重要である。^{[ 11 ]}
• MYSM1は造血とリンパ球の分化に重要である。^{[ 12 ]}

参照

• 国際マウス表現型コンソーシアム
• シルパ

参考文献

1. Ayadi A, Birling MC, Bottomley J, 他 (2012年10月). 「マウス大規模表現型解析イニシアチブ：欧州マウス疾患クリニック（EUMODIC）とウェルカムトラスト・サンガー研究所マウス遺伝学プロジェクトの概要」. Mamm . Genome . 23 ( 9–10 ): 600–10 . doi : 10.1007/s00335-012-9418-y . PMC  3463797. PMID 22961258 . 
2. Gerdin AK (2010). 「サンガーマウス遺伝学プログラム：ノックアウトマウスのハイスループット特性評価」. Acta Ophthalmologica . 88 (S248). doi : 10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x . S2CID 85911512 . 
3. van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (2011). 「マウス遺伝学ツールキット：機能とメカニズムの解明」 . Genome Biol . 12 (6): 224. doi : 10.1186/gb-2011-12-6-224 . PMC 3218837. PMID 21722353 .  
4. White JK, Gerdin AK, Karp NA, et al. (2013年7月). 「ゲノムワイドなノックアウトマウスの作製と系統的表現型解析により、多くの遺伝子の新たな役割が明らかになる」. Cell . 154 ( 2): 452–64 . doi : 10.1016/j.cell.2013.06.022 . PMC 3717207. PMID 23870131 .  
5. Karp NA, Melvin D, Mott RF (2012). 「マウスノックアウト表現型の堅牢かつ高感度な解析」 . PLoS ONE . 7 (12) e52410. Bibcode : 2012PLoSO...752410K . doi : 10.1371 / journal.pone.0052410 . PMC 3530558. PMID 23300663 .  
6. マウスリソースポータル、ウェルカムトラストサンガー研究所。
7. Alderton GK (2011年3月) . 「ゲノム不安定性：ファンコニ貧血の範囲拡大」. Nat. Rev. Cancer . 11 (3): 158–159 . doi : 10.1038/nrc3027 . PMID 21451554. S2CID 26277627 .  
8. Crossan GP,​​ van der Weyden L, Rosado IV, Langevin F, Gaillard PH, McIntyre RE, Gallagher F, Kettunen MI, Lewis DY, Brindle K, Arends MJ, Adams DJ, Patel KJ (2011年2月). 「構造特異的ヌクレアーゼの制御因子であるマウスSlx4の破壊は、ファンコニ貧血の表現型を模倣する」 . Nat . Genet . 43 (2): 147– 52. doi : 10.1038/ng.752 . PMC 3624090. PMID 21240276 .  
9. Bassett JH, Gogakos A, White JK, Evans H, Jacques RM, van der Spek AH, Ramirez-Solis R, Ryder E, Sunter D, Boyde A, Campbell MJ, Croucher PI, Williams GR (2012). 「100匹のノックアウトマウスを用いたラピッドスループット骨格表現型解析により、骨強度を決定する9つの新規遺伝子が同定された」 . PLoS Genet. 8 (8) e1002858. doi : 10.1371/journal.pgen.1002858 . PMC 3410859. PMID 22876197 .  
10. McIntyre RE, Lakshminarasimhan Chavali P, Ismail O, Carragher DM, Sanchez-Andrade G, Forment JV, Fu B, Del Castillo Velasco-Herrera M, Edwards A, van der Weyden L, Yang F, Ramirez-Solis R, Estabel J, Gallagher FA, Logan DW, Arends MJ, Tsang SH, Mahajan VB, Scudamore CL, White JK, Jackson SP, Gergely F, Adams DJ (2012). 「マウスの中心小体発生制御因子Cenpjの破壊は、Seckel症候群の表現型を模倣する」 . PLOS Genet . 8 (11) e1003022. doi : 10.1371/journal.pgen.1003022 . PMC 3499256 . PMID 23166506。  
11. Nijnik A, Clare S, Hale C, Chen J, Raisen C, Mottram L, Lucas M, Estabel J, Ryder E, Adissu H, Adams NC, Ramirez-Solis R, White JK, Steel KP, Dougan G, Hancock RE (2012年7月). 「免疫系機能におけるスフィンゴシン-1-リン酸トランスポーターSpns2の役割」. J. Immunol. 189 (1): 102–11 . doi : 10.4049/jimmunol.1200282 . PMC 3381845. PMID 22664872 .  
12. Nijnik A, Clare S, Hale C, Raisen C, McIntyre RE, Yusa K, Everitt AR, Mottram L, Podrini C, Lucas M, Estabel J, Goulding D, Adams N, Ramirez-Solis R, White JK, Adams DJ, Hancock RE, Dougan G (2012年2月). 「造血およびリンパ球分化におけるヒストンH2A脱ユビキチン化酵素Mysm1の重要な役割」 . Blood . 119 (6): 1370–9 . doi : 10.1182/blood-2011-05-352666 . PMID 22184403 . 

外部リンク

• サンガーマウスポータルには、すべてのMGPデータが含まれています。
• 表現型データを抽出するためのMGP Biomart