科学的禁酒連盟は、女性キリスト教禁酒連合の科学的禁酒指導部門の責任者であったメアリー・ハントの死をきっかけに 1906 年に設立されました。
ハント夫人は、WCTUのために執筆・編集した禁酒教科書の印税を科学的禁酒協会に譲渡することで、ボランティア活動で利益を得ているという非難を免れていた。この協会は、メアリー・ハント、彼女の牧師、そして数人の友人で構成されており、その収入を科学的教育局の本部維持費に充てていた。その建物はハント夫人の大きな邸宅でもあった。
ハント夫人の死後、この取り決めによって財産の所有権が曖昧になり、科学的禁酒財団の設立につながりました。ハント夫人の個人秘書であるコーラ・ストッダードが新組織の代表を務めました。ハント夫人が義務的な禁酒教育の推進で築いた莫大な財産と、それに必要な数千万冊の教科書のおかげで、科学的禁酒連盟は禁酒運動と禁酒法の推進のために多岐にわたる活動を行うことができました。全国規模の主要プロジェクトの一つは、革新的な「移動式教育」プロジェクトで、人々の自宅や農場に直接禁酒教育を届けるものでした。
禁酒法の廃止と禁酒運動の衰退に伴い、連盟は1933年に禁酒教育財団に加盟した。