シェルXle

シェルXle
開発者クリスチャン・B・ヒュブシュレ
初回リリース2011
安定版リリース
1.0.1229 [1]  / 2021年2月26日; 4年前 (2021年2月26日
書かれたC++
オペレーティング·システムWindowsLinuxmacOS
タイプ分子モデリング
ライセンスGNU劣等一般公衆利用許諾書
Webサイトhttp://www.shelxle.org/index.php

ShelXleプログラム[2]は、構造改良プログラムSHELXL [3]のグラフィカルユーザーインターフェースです。ShelXleは、SHELXL関連の.ins(入力)ファイルと.res(出力)ファイルの構文強調表示機能を備えたエディターと、電子密度(Fo)マップと差密度(Fo-Fc)マップを含む3次元構造を視覚化する対話型グラフィカルディスプレイを組み合わせています。

概要

ShelXleは高分子プログラムCootと同様に電子密度マップを表示できますが、より低分子向けに設計されています。SHELXを用いた低分子結晶構造の精密化には、WINGX、[4] Olex2[5] XSEED、[6] PLATONおよびSYSTEM-S、[7] BrukerプログラムXPおよびXSHELLなど、優れたグラフィカルユーザーインターフェース(GUI) が数多く存在します。

ShelXleはフリーソフトウェアであり、GNU LGPLの下で配布されています。ShelXleのウェブサイトまたはSourceForgeから入手できます。[8] [9]バイナリはWindows、macOS、LinuxディストリビューションのSuSEDebianUbuntuで利用可能です。WindowsバイナリはNSISインストーラと共に配布されています。

特徴

  • SHELX 命令の構文強調表示コード補完機能を備えたエディター。
  • 構造ビューで原子をクリックすると、テキスト カーソルがその原子を含む行に設定されます。
  • エディターから構造ビューで原子を見つけます。
  • 残基と無秩序な部分および自由変数をサポートする名前変更モード

プログラムアーキテクチャ

ShelXleはQt(フレームワーク)を使用しています。完全にC++で記述されており、スクリプト言語は一切使用していません。改良のために、SHELXLの外部バイナリ( George M. SheldrickのSHELXH、SHELXLMP 、またはBrukerのXL)を呼び出します。

シェルクス

SHELX [3]は、1960年代後半からGeorge M. Sheldrickによって開発されています。重要なリリースはSHELX76とSHELX97です。現在も開発が続けられていますが、リリースは通常10年間のテストを経て行われます。学術ユーザーは登録後、SHELXプログラムを自由にダウンロードできます。[10]

  • ShelXleウェブサイト
  • xrayforum.co.uk の ShelXle サポートフォーラム
  • Sourceforge の ShelXle

参考文献

  1. ^ https://www.shelxle.org/shelx/chlg/changelog.php. {{cite web}}:欠落または空|title=(ヘルプ)
  2. ^ Hübschle, Christian B.; Sheldrick, George M.; Dittrich, Birger (2011年11月12日). 「ShelXle: SHELXL用Qtグラフィカルユーザーインターフェース」. Journal of Applied Crystallography . 44 (6): 1281– 1284. Bibcode :2011JApCr..44.1281H. doi :10.1107/S0021889811043202. PMC 3246833. PMID 22477785  . 
  3. ^ ab Sheldrick, George M. (2007年12月21日). 「SHELXの短い歴史」. Acta Crystallographica Section A. 64 ( 1): 112– 122. Bibcode :2008AcCrA..64..112S. doi : 10.1107/S0108767307043930 . PMID  18156677.
  4. ^ Farrugia, Louis J. (1999年8月1日). 「小分子単結晶結晶学のためのWinGXスイート」. Journal of Applied Crystallography . 32 (4): 837– 838. Bibcode :1999JApCr..32..837F. doi :10.1107/S0021889899006020.
  5. ^ Dolomanov, Oleg V.; Bourhis, Luc J.; Gildea, Richard J.; Howard, Judith AK; Puschmann, Horst (2009年1月24日). 「OLEX2:完全な構造解析、精密化、解析プログラム」. Journal of Applied Crystallography . 42 (2): 339– 341. doi :10.1107/S0021889808042726.
  6. ^ Barbour, Leonard J. (2001). 「X-Seed — 超分子結晶構造解析のためのソフトウェアツール」. J​​. Supramol. Chem . 1 ( 4–6 ): 189–19 . doi :10.1016/S1472-7862(02)00030-8.
  7. ^ Spek, Anthony L. (2009年1月20日). 「化学結晶学における構造検証」. Acta Crystallographica Section D. 65 ( 2): 148– 155. Bibcode :2009AcCrD..65..148S. doi :10.1107/S090744490804362X. PMC 2631630. PMID  19171970 . 
  8. ^ 「ShelXleダウンロードページ」www.shelxle.org . 2021年9月15日閲覧
  9. ^ “ShelXle”. SourceForge . 2021年9月15日閲覧。
  10. ^ 「SHELXホームページ」shelx.uni-goettingen.de . 2016年9月6日閲覧
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