PCGF1

PCGF1
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 4HPL、4HPM
識別子
エイリアス	PCGF1、2010002K04Rik、NSPC1、RNF3A-2、RNF68、ポリコームグループリングフィンガー1
外部ID	オミム: 610231 ; MGI : 1917087 ;ホモロジーン: 13090 ;ジーンカード: PCGF1 ; OMA : PCGF1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 染色体2（ヒト）[ 1 ] バンド 2p13.1 始める 74,505,043 bp [ 1 ] 終わり 74,507,695 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 6番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 6 C3|6 35.94 cM 始める 83,054,85​​0 bp [ 2 ] 終わり 83,057,836 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 卵母細胞 二次卵母細胞 顆粒球 横行結腸粘膜 肝臓の右葉 小脳の右半球 下垂体 胃の体 膵臓の体 右卵管 上位の表現 二次卵母細胞 接合子 一次卵母細胞 副腎 性器結節 骨髄 桑実胚 網膜の神経層 嗅球 膵臓 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 タンパク質C末端結合 タンパク質結合 金属イオン結合 プロモーター特異的クロマチン結合 細胞成分 PcGタンパク質複合体 核 核質 PRC1複合体 生物学的プロセス ヒストンH2Aモノユビキチン化 転写、DNAテンプレート 転写の制御、DNAテンプレート ヒストンH2A-K119のモノユビキチン化 RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 84759 69837 アンサンブル ENSG00000115289 ENSMUSG00000069678 ユニプロット Q9BSM1 Q8R023 RefSeq (mRNA) NM_032673 NM_197992 RefSeq（タンパク質） NP_116062 NP_932109 NP_001390487 NP_001390488 NP_001390489 NP_001390490 場所（UCSC） 2番目の文字: 74.51 – 74.51 Mb 6章: 83.05 – 83.06 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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ポリコームグループRINGフィンガータンパク質1（PCGF1）は、NSPC1またはRNF68としても知られ、ヒトではPCGF1遺伝子によってコードされるRINGフィンガードメイン タンパク質である。^{[ 5 ] [ 6 ]}

PCGF1は、 RING1A/B、RYBP、BCOR、KDM2Bと相互作用する非標準ポリコーム抑制複合体1.1（ncPRC1）を定義する構成要素である。^{[ 7 ]} PCGF1-BCORはPCGF1のユビキチン様RAWULドメインを介して組み立てられ、KDM2B部位のクロマチン上にリクルートされる。^{[ 8 ] [ 9 ] [ 10 ]} PRC1様複合体内で、PCGF1はヒストンH2A上のLys119のユビキチン化を触媒するRING1Bユビキチンリガーゼ活性を制御し、 ^{[ 11 ]}これによりPRC2とH3K27me3がリクルートされ、ポリコームドメインが効果的に開始され、遺伝子抑制が媒介される。  ^{[ 12 ] [ 13 ] [ 14 ]}

参考文献

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1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000115289 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000069678 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Nunes M, Blanc I, Maes J, Fellous M, Robert B, McElreavey K (2001年4月). 「哺乳類の新規ポリコーム遺伝子NSPc1は、末梢神経系の神経堤由来構造において発現する」 .発達機構. 102 ( 1–2 ): 219–22 . doi : 10.1016 / S0925-4773(01)00288-X . PMID 11287196. S2CID 8344430 .  
6. 「Entrez Gene: PCGF1ポリコームグループリングフィンガー1」。
7. Gao Z, Zhang J, Bonasio R, Strino F, Sawai A, Parisi F, et al. (2012年2月). 「PCGFホモログ、CBXタンパク質、およびRYBPは機能的に異なるPRC1ファミリー複合体を定義する」 . Molecular Cell . 45 (3): 344– 56. doi : 10.1016/j.molcel.2012.01.002 . PMC 3293217. PMID 22325352 .  
8. Wong SJ, Gearhart MD, Taylor AB, Nanyes DR, Ha DJ, Robinson AK, et al. (2016年10月). 「KDM2Bによるポリコームグループ複合体PRC1.1のリクルートにはPCGF1とBCORL1の協力が必要である」 . Structure . 24 (10): 1795– 1801. doi : 10.1016/j.str.2016.07.011 . PMC 5088048. PMID 27568929 .  
9. Junco SE, Wang R, Gaipa JC, Taylor AB, Schirf V, Gearhart MD, et al. (2013年4月). 「BCORと複合体を形成したポリコームグループタンパク質PCGF1の構造は、PCGFホモログの結合選択性の基礎を明らかにする」 . Structure . 21 (4): 665–71 . doi : 10.1016/j.str.2013.02.013 . PMC 4003909. PMID 23523425 .  
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11. Taherbhoy AM、Huang OW、Cochran AG (2015 年 7 月)。「BMI1-RING1B は自己阻害された RING E3 ユビキチンリガーゼです。 」ネイチャーコミュニケーションズ。6 : 7621。ビブコード: 2015NatCo...6.7621T。土井: 10.1038/ncomms8621。PMID 26151332。 
12. タンブリ S、ラバローネ E、フェルナンデス ペレス D、コンウェイ E、ザノッティ M、マンガナーロ D、パシーニ D (2020 年 2 月)。「ヒストン H2AK119 のモノユビキチン化はポリコームを介した転写抑制に必須である」。分子細胞。77 (4): 840–856.e5。土井：10.1016/j.molcel.2019.11.021。PMC 7033561。PMID 31883952。  
13. Fursova NA, Blackledge NP, Nakayama M, Ito S, Koseki Y, Farcas AM, et al. (2019年6月). 「バリアントPRC1複合体間の相乗効果がポリコーム介在遺伝子抑制を規定する」 . Molecular Cell . 74 (5): 1020–1036.e8. doi : 10.1016/j.molcel.2019.03.024 . PMC 6561741. PMID 31029541 .  
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さらに読む

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• ファルク・リングベーク ME、ブルッゲマン SW、ヴァン・ローハイゼン M (2004 年 8 月)。「幹細胞とがん、ポリコームの関係」。セル。118 (4): 409–18 .土井: 10.1016/j.cell.2004.08.005。PMID  15315754。S2CID  16542938。
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• Gearhart MD, Corcoran CM, Wamstad JA, Bardwell VJ (2006年9月). 「ポリコームグループとSCFユビキチンリガーゼは、BCL6標的にリクルートされる新規BCOR複合体に存在する」 . Molecular and Cellular Biology . 26 (18): 6880–9 . doi : 10.1128/MCB.00630-06 . PMC  1592854. PMID  16943429 .
• Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, et al. (2005年10月). 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップの構築に向けて」Nature . 437 (7062): 1173–8 . Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID  16189514 . S2CID  4427026 .
• Gong Y, Wang X, Liu J, Shi L, Yin B, Peng X, et al. (2005年1月). 「新規PcGファミリーメンバーのうち、主に核局在するタンパク質であるNSPc1は、S183のPKCリン酸化部位に関連した転写抑制活性を有する」 . FEBS Letters . 579 (1): 115–21 . doi : 10.1016/j.febslet.2004.11.056 . PMID  15620699. S2CID  28187618 .
• Sugishita H, Kondo T, Ito S, et al. (2021年9月). 「バリアントPCGF1-PRC1はPRC2リクルートメントと標的遺伝子における分化関連転写不活性化を結びつける」 . Nat Commun . 12 (5341): 5341. Bibcode : 2021NatCo..12.5341S . doi : 10.1038/s41467-021-24894- z . PMC  8429492. PMID  34504070 .