スポンジン1

SPON1
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2ZOT、2ZOU、3COO、3Q13
識別子
別名	SPON1、VSGP/F-スポンジン、f-スポンジン、スポンジン1
外部ID	OMIM : 604989 ; MGI : 2385287 ; HomoloGene : 4453 ; GeneCards : SPON1 ; OMA : SPON1 - オーソログ
遺伝子の位置（ヒト） 染色体 11番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 11p15.2 開始 13,962,723 bp [ 1 ] 終了 14,268,133 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） 染色体 7番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 7|7 F1 開始 113,365,235 bp [ 2 ] 終了 113,642,605 bp [ 2 ]
RNA発現パターン Bgee ヒト マウス（相同遺伝子） 最もよく発現している 胆嚢 S状結腸粘膜 心膜 肺下葉 噴門 膀胱粘膜 外淡蒼球 右肺 臓側胸膜 壁側胸膜 最もよく発現している 水晶体上皮 虹彩 毛様体 外頸動脈 子宮頸部 内頸動脈 網膜色素上皮 心房 脱落膜 視交叉上核 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 タンパク質結合 金属イオン結合 細胞外マトリックスの構造構成要素 LBDドメイン結合 細胞成分 細胞外マトリックス 細胞外領域 小胞体腔 細胞外空間 コラーゲン含有細胞外マトリックス 生物学的プロセス 細胞接着 タンパク質のO結合型フコシル化 タンパク質プロセシングの正の制御 タンパク質結合の正の調節 アミロイドβ形成の負の調節 アミロイド前駆体タンパク質の分解プロセスの正の調節 出典：Amigo / QuickGO
相同遺伝子 種 ヒト マウス Entrez 10418 233744 アンサンブル ENSG00000262655 ENSMUSG00000038156 ユニプロット Q9HCB6 Q8VCC9 RefSeq (mRNA) NM_006108 NM_145584 RefSeq（タンパク質） NP_006099 NP_663559 場所（UCSC） 11番地: 13.96～14.27 MB 7番地: 113.37～113.64 MB PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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スポンジン-1（F-スポンジンとも呼ばれる）は、ヒトではSPON1遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ]}これは底板の細胞から分泌され、軸索誘導に関与している可能性がある。 ^{[ 6 ]}このタンパク質は807個のアミノ酸を含み、構造的には6つのトロンボスポンジンドメイン、1つのリーリンドメイン、および1つのスポンジンドメインから構成される。

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000262655 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000038156 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
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さらに詳しい情報

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外部リンク

• PDBe-KBのUniProt : Q9HCB6 （ Spondin-1）のPDBで利用可能なすべての構造情報の概要