Protein-coding gene in the species Homo sapiens
| タダ2A |
|---|
 |
| 利用可能な構造 |
|---|
| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
|---|
|
|
| 識別子 |
|---|
| エイリアス | TADA2A、ADA2、ADA2A、TADA2L、hADA2、KL04P、転写アダプター 2A |
|---|
| 外部ID | オミム:602276; MGI : 2144471;ホモロジーン: 38834;ジーンカード:TADA2A; OMA :TADA2A - オルソログ |
|---|
|
| 遺伝子の位置(マウス) |
|---|
 | | キリスト | 11番染色体(マウス)[2] |
|---|
| | バンド | 11|11 世紀 | 始める | 83,969,746 bp [2] |
|---|
| 終わり | 84,020,426 bp [2] |
|---|
|
| RNA発現パターン |
|---|
| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
|---|
| 上位の表現 | - 睾丸
- アキレス腱
- 脳梁
- 心室帯
- 神経節隆起
- 右精巣
- 左精巣
- 骨髄細胞
- 骨格筋組織
- 子宮内膜
|
| | 上位の表現 | - 耳小胞
- 球形嚢
- 網膜の神経層
- 胚葉上層
- 腎小体
- 心室帯
- 耳板
- 二次卵母細胞
- 一次卵母細胞
- 髄質集合管
|
| | より多くの参照表現データ |
|
|---|
| バイオGPS | 
 | | より多くの参照表現データ |
|
|---|
|
| 遺伝子オントロジー |
|---|
| 分子機能 |
- タンパク質結合
- ヒストンアセチルトランスフェラーゼ活性
- DNA結合転写因子活性
- DNA結合
- クロマチン結合
- 転写コレギュレーター活性
- 転写コアクチベーター活性
- DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- ヒストンのアセチル化の正の制御
- ヒストンH3のアセチル化
- 転写の制御、DNAテンプレート
- RNAポリメラーゼIIによる転写
- RNAポリメラーゼIIによる転写の調節
- 転写、DNAテンプレート
- クロマチンリモデリング
- ヒストンのアセチル化の調節
- 核酸テンプレート転写の正の制御
| | 出典:Amigo / QuickGO |
|
| オーソログ |
|---|
| 種 | 人間 | ねずみ |
|---|
| エントレズ | | |
|---|
| アンサンブル | |
|---|
ENSG00000276234 ENSG00000277104 |
| |
|---|
| ユニプロット | | |
|---|
| RefSeq (mRNA) | |
|---|
NM_001166105 NM_001291918 NM_001488 NM_133439 |
| |
|---|
| RefSeq(タンパク質) | |
|---|
NP_001159577 NP_001278847 NP_001479 NP_597683 |
| |
|---|
| 場所(UCSC) | 17章: 37.41 – 37.48 Mb | 11章: 83.97 – 84.02 Mb |
|---|
| PubMed検索 | [3] | [4] |
|---|
|
| ウィキデータ |
|
転写アダプター2-αは、ヒトではTADA2A遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
関数
多くのDNA結合性転写活性化タンパク質は、基底プロモーターに結合した転写機構と機能的に相互作用することにより、RNAポリメラーゼIIを介した遺伝子転写の開始速度を高める。この活性化には通常、アダプタータンパク質が必要であり、おそらくヌクレオソームをアセチル化して不安定化し、プロモーターにおけるクロマチン制約を緩和すると考えられる。この遺伝子によってコードされるタンパク質は転写活性化アダプターであり、PCAFヒストンアセチル化酵素複合体の一部であることが分かっている。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする2つの転写バリアントが同定されている。[6]
相互作用
TADA2LはGCN5L2 [ 7] [8]、TADA3L [9] [10]、Myc [11]と相互作用することが示されている。
参考文献
- ^ abc ENSG00000277104 GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000276234, ENSG00000277104 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000018651 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Candau R, Moore PA, Wang L, Barlev N, Ying CY, Rosen CA, Berger SL (1996年2月). 「酵母の推定アダプターADA2およびGCN5と機能的に保存されているヒトタンパク質の同定」. Molecular and Cellular Biology . 16 (2): 593– 602. doi :10.1128/mcb.16.2.593. PMC 231038. PMID 8552087 .
- ^ ab "Entrez Gene: TADA2L 転写アダプター 2 (ADA2 ホモログ、酵母) 様".
- ^ Barlev NA, Poltoratsky V, Owen-Hughes T, Ying C, Liu L, Workman JL, Berger SL (1998年3月). 「Ku-DNA依存性プロテインキナーゼ複合体によるブロモドメイン介在結合およびリン酸化を介したGCN5ヒストンアセチルトランスフェラーゼ活性の抑制」. Molecular and Cellular Biology . 18 (3): 1349–58 . doi :10.1128/mcb.18.3.1349. PMC 108848. PMID 9488450 .
- ^ Wang L, Mizzen C, Ying C, Candau R, Barlev N, Brownell J, Allis CD, Berger SL (1997年1月). 「ヒストンアセチルトランスフェラーゼ活性は酵母とヒトのGCN5間で保存されており、増殖と転写活性化の相補性に必要である」. Molecular and Cellular Biology . 17 (1): 519–27 . doi :10.1128/mcb.17.1.519. PMC 231776. PMID 8972232 .
- ^ ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實=岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ=グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサク S、セケーラ R、ドゥセット・スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M (2005 年 10 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173–8 . Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- ^ Wang T, Kobayashi T, Takimoto R, Denes AE, Snyder EL, el-Deiry WS, Brachmann RK (2001年11月). 「hADA3はp53の活性に必須である」. The EMBO Journal . 20 (22): 6404–13 . doi :10.1093/emboj/20.22.6404. PMC 125723. PMID 11707411 .
- ^ Liu X, Tesfai J, Evrard YA, Dent SY, Martinez E (2003年5月). 「c-Myc形質転換ドメインはヒトSTAGA複合体をリクルートし、転写活性化にはTRRAPおよびGCN5アセチラーゼ活性を必要とする」. The Journal of Biological Chemistry . 278 (22): 20405–12 . doi : 10.1074/jbc.M211795200 . PMC 4031917. PMID 12660246 .
さらに読む
- 丸山 憲治、菅野 誠 (1994年1月). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」.遺伝子. 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Wang L, Mizzen C, Ying C, Candau R, Barlev N, Brownell J, Allis CD, Berger SL (1997年1月). 「ヒストンアセチルトランスフェラーゼ活性は酵母とヒトのGCN5間で保存されており、増殖と転写活性化の相補性に必要である」. Molecular and Cellular Biology . 17 (1): 519–27 . doi :10.1128/mcb.17.1.519. PMC 231776. PMID 8972232 .
- Carter KC, Wang L, Shell BK, Zamir I, Berger SL, Moore PA (1997年3月). 「ヒト転写アダプター遺伝子TADA2LとGCN5L2は染色体17q12-q21に共局在し、類似した組織発現パターンを示す」Genomics . 40 (3): 497– 500. doi :10.1006/geno.1996.4605. PMID 9073520.
- Henriksson A, Almlöf T, Ford J, McEwan IJ, Gustafsson JA, Wright AP (1997年6月). 「グルココルチコイド受容体による遺伝子活性化におけるAdaアダプター複合体の役割」. Molecular and Cellular Biology . 17 (6): 3065–73 . doi :10.1128/mcb.17.6.3065. PMC 232159. PMID 9154805 .
- 鈴木雄三、中川吉智、丸山健、須山明生、菅野誠一 (1997年10月). 「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」. Gene . 200 ( 1–2 ): 149–56 . doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Ogryzko VV, Kotani T, Zhang X, Schiltz RL, Howard T, Yang XJ, Howard BH, Qin J, Nakatani Y (1998年7月). 「PCAFヒストンアセチル化酵素複合体内のヒストン様TAF」. Cell . 94 (1): 35– 44. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81219-2 . PMID 9674425. S2CID 18942972.
- ヴァシレフ A、山内 J、小谷 T、プリベス C、アヴァンタジャーティ ML、秦 J、中谷 Y (1998 年 12 月)。 「PCAF ヒストン アセチラーゼ複合体の 400 kDa サブユニットは、ATM スーパーファミリーに属します。」分子細胞。2 (6): 869–75 .土井: 10.1016/S1097-2765(00)80301-9。PMID 9885574。
- Wang T, Kobayashi T, Takimoto R, Denes AE, Snyder EL, el-Deiry WS, Brachmann RK (2001年11月). 「hADA3はp53の活性に必須である」. The EMBO Journal . 20 (22): 6404–13 . doi :10.1093/emboj/20.22.6404. PMC 125723. PMID 11707411 .
- Barlev NA, Emelyanov AV, Castagnino P, Zegerman P, Bannister AJ, Sepulveda MA, Robert F, Tora L, Kouzarides T, Birshtein BK, Berger SL (2003年10月). 「新規ヒトAda2ホモログはGcn5またはBrg1と共存して転写を活性化する」. Molecular and Cellular Biology . 23 (19): 6944–57 . doi :10.1128/MCB.23.19.6944-6957.2003. PMC 193946. PMID 12972612 .
- ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實・岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ=グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリアー A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M (2005 年 10 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173–8 . Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Qian C, Zhang Q, Li S, Zeng L, Walsh MJ, Zhou MM (2005年12月). 「SWIRMドメインの構造と染色体DNA結合」. Nature Structural & Molecular Biology . 12 (12): 1078–85 . doi :10.1038/nsmb1022. PMID 16299514. S2CID 23215862.