ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| TBC1D1 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | TBC1D1、TBC、TBC1、TBC1ドメインファミリーメンバー1 |
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| 外部ID | オミム:609850; MGI : 1889508;ホモロジーン: 56856;ジーンカード:TBC1D1; OMA :TBC1D1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 5番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 5 C3.1|5 32.8 cM | 始める | 64,313,648 bp [2] |
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| 終わり | 64,508,829 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 心室帯
- 子宮体部
- S状結腸の筋層
- 右冠動脈
- 神経節隆起
- 膝窩動脈
- 脛骨動脈
- 胃粘膜
- 左冠動脈
- 上行大動脈
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| | 上位の表現 | - 太ももの筋肉
- 精母細胞
- 接合子
- 網膜色素上皮
- 第四脳室脈絡叢
- 顆粒球
- 二次卵母細胞
- 右腎臓
- 精子細胞
- 足底筋
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS |  | | より多くの参照表現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- 繊毛の組み立ての調節
- 膜組織
- タンパク質の局在の制御
- GTPase活性の活性化
- 小胞融合の調節
- 細胞内タンパク質輸送
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オーソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | NM_001253912 NM_001253913 NM_001253914 NM_001253915 NM_015173
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NM_001396959 |
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NM_001289514 NM_019636 NM_001310611 |
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| RefSeq(タンパク質) | |
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NP_001240841 NP_001240842 NP_001240843 NP_001240844 NP_055988 |
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NP_001276443 NP_001297540 NP_062610 |
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| 場所(UCSC) | 4章: 37.89 – 38.14 Mb | 5章: 64.31 – 64.51 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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TBC1ドメインファミリーメンバー1は、ヒトではTBC1D1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
TBC1D1は、180~200アミノ酸からなる TBCドメインを共有するタンパク質ファミリーの創始メンバーであり、細胞増殖および分化の制御に関与すると推定されています。これらのタンパク質は、 TRE2(USP6)、酵母Bub2、CDC16と高い相同性を有しています(White et al., 2000)。[OMIM提供] [6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000065882 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000029174 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ White RA, Pasztor LM, Richardson PM, Zon LI (2000年9月). 「tre-2/USP6がん遺伝子、BUB2、およびcdc16と相同性を持つTBC1D1をコードする遺伝子は、マウス5番染色体およびヒト4番染色体にマッピングされる」. Cytogenet Cell Genet . 89 ( 3–4 ): 272–5 . doi :10.1159/000015632. PMID 10965142. S2CID 22255963.
- ^ ab "Entrez 遺伝子: TBC1D1 TBC1 (tre-2/USP6、BUB2、cdc16) ドメイン ファミリー、メンバー 1".
さらに読む
- 中島大将、岡崎直人、山川博司、他(2003年)。 「KIAA 遺伝子の発現準備が整った cDNA クローンの構築: 330 個の KIAA cDNA クローンの手動キュレーション」。DNA研究所9 (3): 99–106 .土井: 10.1093/dnares/9.3.99。PMID 12168954。
- Roach WG, Chavez JA, Mîinea CP, Lienhard GE (2007). 「Rab GTPase活性化タンパク質Tbc1d1の基質特異性とGLUT4への転座への影響」Biochem. J. 403 ( 2): 353–8 . doi :10.1042/BJ20061798. PMC 1874243. PMID 17274760 .
- Stone S, Abkevich V, Russell DL, et al. (2006). 「TBC1D1は重症肥満遺伝子の候補であり、肥満素因における遺伝子間相互作用の証拠となる」Hum. Mol. Genet . 15 (18): 2709–20 . doi : 10.1093/hmg/ddl204 . PMID 16893906.
- 大月 剛志、太田 剛志、西川 剛志、他 (2007). 「シグナル配列とキーワードトラップを用いたin silicoによる、オリゴキャップcDNAライブラリーからの分泌タンパク質または膜タンパク質をコードする全長ヒトcDNAの選択」DNA Res . 12 (2): 117–26 . doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID 16303743.
- Rush J, Moritz A, Lee KA, et al. (2005). 「癌細胞におけるチロシンリン酸化の免疫親和性プロファイリング」Nat. Biotechnol . 23 (1): 94– 101. doi :10.1038/nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
- Jin J, Smith FD, Stark C, et al. (2004). 「細胞骨格制御と細胞組織化に関与するin vivo 14-3-3結合タンパク質のプロテオーム、機能、およびドメインベース解析」Curr. Biol . 14 (16): 1436–50 . doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . PMID 15324660. S2CID 2371325.
- Colland F, Jacq X, Trouplin V, et al. (2004). 「ヒトシグナル伝達経路の機能的プロテオミクスマッピング」Genome Res . 14 (7): 1324–32 . doi :10.1101/gr.2334104. PMC 442148. PMID 15231748 .
- 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- 菊野 亮、永瀬 剛、石川 功、他 (1999). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測 XIV. in vitroで巨大タンパク質をコードする脳由来の新規cDNAクローン100個の完全配列」DNA Res . 6 (3): 197– 205. doi : 10.1093/dnares/6.3.197 . PMID 10470851.